Re: Test de permutation

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Ce test est basé sur l'inertie interclasse. Ce que dit le test c'est
que sur 1000 permutations des individus dans les groupes, il n'y en a
qu'une qui donne une inertie inter-groupes plus faible. Autrement
dit, pour les 8 descripteurs choisis, il y a moins de difference
entre les groupes que si on met les individus au hasard dans chaque
groupe. il est donc illégitime de faire une acp inter. Cela vient
certainement du grand nombre de classes par rapport au nombre
d'individus.Il doit y avoir un grand nombre de classe pour lesquels
les individus se ressemblent.

Cordialement.

>Bonjour,
>
>J'ai réalisé un test de permutation avant d'effectuer une ACP
>inter-classe (8 variables, 95 individus, 12 classes).
>Mais je me suis retrouvé avec ceci :
>
>number of random matching: 1000 Observed: 0.571016
>Histogramm: minimum = 0.528945, maximum = 1.535300
>number of simulation X<Obs: 1 (frequency: 0.001000)
>number of simulation X>=Obs: 999 (frequency: 0.999000)
>
>Autrement dit il n'y a qu'une seule (sur 1000) inertie simulée
>supérieure à mon inertie observée...
>
>Comme c'est la première fois que tombe sur ce type de résultat, je
>ne sais pas trop comment l'interpréter.
>
>Est ce une erreur de ma part ou ai je raté quelque chose dans la doc ?
>
>Merci pour votre aide.
>
>Cordialement
>
>Nicolas
>
>
>
>
>~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Nicolas POULET
>Cemagref
>Unité de Recherche RIPE
>361, rue JF Breton
>BP 5095 34 033 Montpellier Cedex
>Tel/fax : 04 67 04 63 63 / 63 57 95
>~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

-- 
Stéphane DRAY
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Biométrie et Biologie évolutive - Equipe "Écologie Statistique"
Universite Lyon 1 - Bat 711 - 69622 Villeurbanne CEDEX - France
Tel : 04 72 43 27 56			   Fax : 04 78 89 27 19
       04 72 43 27 57 	   E-mail : dray@biomserv.univ-lyon1.fr 
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ADE-4               http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4F.html
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