Merci daniel
je fais suivre à ADE list !
gudrun
Début du message réexpédié :
> De: Daniel Chessel <chessel@biomserv.univ-lyon1.fr>
> Date: 24 juin 2005 16:46:06 GMT+02:00
> À: Gudrun Bornette <bornette@avosnes.univ-lyon1.fr>
> Objet: Rép : question d'un doctorant sur laquelle je sèche
> Répondre à: chessel@biomserv.univ-lyon1.fr
>
> Je ne réponds plus à titre personnel à ce genre de question (c'est
> impossible, tous les jours en ce moment)
> La question est très intéressante et n'a rien de naïf
> dis lui d'utiliser adelist, il y a 420 inscrits
> la réponse sera archivée et utile à d'autres
> merci
>
>
> Gudrun Bornette a écrit :Bonjour daniel
>> je me permets de te contacter car mon doctorant m'envoie le problème
>> suivant, et je ne sais pas quoi lui répondre... est ce que vous
>> auriez quelques mn à me consacrer pour le lire et réagir ?
>> merci d'avance
>>
>> gudrun
>>
>>
>> Je dispose de trois tableaux :
>>
>> 1. 169 relevés x 292 espèces. L'AFC de ce
>> tableau a une inertie
>>
>> de 16.
>>
>> 2. 6 variables de milieu 2 quantitatives
>> (altitude et recouvrements en sol nu + cailloux) et 4 semi
>> quantitatives ou
>> qualitatives (mésotopographie, exposition, acidité de la roche mère
>> et
>> pente. Dans un premier temps j'ai classé ces variables en mode
>> qualitatives
>> et procédé à une ACM.
>>
>> 3. 292 espèces x 9 traits relatifs à la
>> multiplication végétative des espèces codés en 0 et 1. En fait il
>> s'agit de
>> trois traits codés en 2, 2 et 3 modalités. Mais la même espèce peut
>> présenter simultanément plusieurs modalités du même trait.
>>
>>
>> Analyse
>>
>> En multipliant les matrices relevés espèces et espèces
>> traits j'obtiens une matrice 169 x 9 indiquant la fréquence totale
>> de chaque
>> trait sur chaque relevé Ces traits présentent une structure
>> particulière
>> dans la mesure où certains sont toujours proches de 1 et d'autres
>> toujours
>> proches de 0 voire souvent nulles. L'inertie de l'AFC floue de ce
>> tableau
>> est aussi très faible de l'ordre de 0,1.
>>
>>
>> En réalisant la coinertie de cette analyse avec l'ACM du
>> tableau relevé milieu, je trouve bien entendu une coinertie encore
>> plus
>> faible de 0,005. Les corrélations des axes de l'analyse de la table
>> de
>> milieu avec les axes de coinertie sont passables (50 à 60 %), mais
>> ces memes
>> corrélations sont très mauvaises lorque l'on considère la table de
>> traits...
>> ( 5 et 6 %). Cependant, le test de Monte Carlo est hautement
>> significatif.
>>
>>
>>
>> De surcroît, les analyses unidimensionnelles (e.g.
>> régression entre les variables de milieux prises indépendamment et
>> le poids
>> des traits dans les relevés) sont très significatives (p allant
>> jusqu'à 10-7
>> avec des r2 allant de 5 à 10 %). Les résultats des corrélations sont
>> concordants entre l'analyse de coinertie et les analyses
>> unidimensionnelles.
>> Ces deux types d'analyses mettent en évidence une présence plus
>> fortes de
>> mêmes traits dans les mêmes conditions de milieu.
>>
>>
>> Comment expliquer une inertie si faible, mais une
>> co-structure significative, du tableau trait-relevés et des
>> régressions
>> trait par trait x milieu significatives ?
>> notre hypothèse est la suivante : l'inertie est faible car
>> on a peu de traits par rapport au nombre de relevés et ceux-ci ont
>> peu de
>> variabilité et donc ne discriminent que très peu les stations.
>>
>>
>> Est-il possible de dire que cette analyse montre qu'il
>> existe une relation significative entre les traits et les conditions
>> de
>> milieu, mais que cette relation n'explique une très faible part de la
>> structure des relevés, ou la faiblesse de l'inertie conduit-elle à
>> abandonner cette méthode pour une autre?
>>
>> Dr G. Bornette, Directeur de recherche CNRS
>> UMR CNRS 5023 "ecology of fluvial hydrosystems"
>> 6, rue Dubois (bât. FOREL/403) 2e étage
>> 43 Bd du 11 nov. 1918
>> 69622 Villeurbanne Cedex France
>> tel: +33 472 431 294
>> fax: +33 472 431 141
>> email: bornette@avosnes.univ-lyon1.fr
>>
Dr G. Bornette, Directeur de recherche CNRS
UMR CNRS 5023 "ecology of fluvial hydrosystems"
6, rue Dubois (bât. FOREL/403) 2e étage
43 Bd du 11 nov. 1918
69622 Villeurbanne Cedex France
tel: +33 472 431 294
fax: +33 472 431 141
email: bornette@avosnes.univ-lyon1.fr
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