Bonjour,
D. Nandris pose la question :
>J'ai dans mon bureau un collegue Y. Letourneur (Oceano-poissons) qui vient
>de se mettre sur ADE pour de l'ACP sur ses 252 stations (répartis en 4
>sites) de plongée avec comptage de poissons.
>1) Dispose-t-on dans ADE des tests "distances" de Mahalanobis et de Wilks ?
Réponse non.
On peut retrouver les critères des tests de Wilks, Hotelling, Pillai et Roy en utilisant les formules p. 157 dans :
Tomassone, R., Danzard, M., Daudin, J.J. & Masson, J.P. (1988) Discrimination et classement. Masson, Paris. 1-173.
Il suffit de savoir que la quantité rhok*rhok de ces formules sont exactement les valeurs propres de l'option Discrimin : Discriminant analysis/Run
La version non paramétrique (free distribution) de ces critères est dans Discrimin : Discriminant analysis/Test. C'est la version randomisation (citer Manly, B.F.J. (1991) Randomization and Monte Carlo methods in biology. Chapman and Hall, London. 1-281.) du test de Pillai (Pillai, K.C.S. (1955) Some new test criteria in multivariate analysis. Annals of Mathematical Statistics : 26, 117-121.)
Pour les données faunistiques, avec les 0 nombreux la normalité des données n'est jamais valide et les critères classiques sont très douteux. Le test de permutations est meilleur.
>2) Dans Discrimin, il a fait le test "inter-classes" qui est tres significatif.
>Peut-on le citer dans une publi (dont le referee comprend mal la difference
>interclasses) et si oui, sous quel nom ?
Pour une ACP c'est exactement le test de
Romesburg, H.C. (1985) Exploring, confirming and randomization tests. Computers and Geosciences : 11, 19-37.
comme indiqué dans la doc de Discrimin p. 7.
Cordialement
Daniel Chessel
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ADE-4 sur Internet ---> http://biomserv.univ-lyon1.fr/ADE-4.html
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