Re: individus supplÈmentaires

From: Daniel Chessel (chessel@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Fri Feb 06 1998 - 14:45:31 MET


1) Petite question technique:
>Lorsque l'on crée une variable qualitative (categvar), par exemple avec
>Verifcateg, on obtient plusieurs fichiers dont j'ignore l'usage.
>En particulier, à quoi servent les fichiers *Moda.cat, *Moda.123 et *Moda
> (*=nom du fichier de départ).
>Est-ce qu'il est nécessaire que le premier ait le suffixe .cat, alors
>qu'apparemment on n'a pas à l'utiliser pour des représentations et qui vient
>"polluer" les listes de sélection de fichiers qui ont le filtre *.cat?

Jean a répondu

Pollution ? Le terme est acceptable et il faudrait passer cette possibilité dans une option supplémentaire de CategVar (à la prochaine mise à jour).

2) Petite question sur les individus supplémentaires:
>-Sur l'aspect technique:

Jean a répondu itou

Il est plus simple de jouer sur la possibilité de graphes multiples et c'est assez général, par exemple dans la superposition des lignes et des colonnes (-.fcli et .fcco) ou la superposition des distributions et des ellipses (ScatterDistri : Frequencies et ScatterDistri : Ellipses) ou les points et les points supplémentaires ou deux représentations cartographiques.
On peut toujours dans chaque module graphique ouvrir plusieurs fenêtres d'exécution et/ou ouvrir plusieurs modules graphiques et faire copier-coller d'une fenêtre sur l'autre. Reste à fixer les bornes pour rendre les échelles compatibles et ne pas se mélanger dans les fenêtres de dialogue. Quand on a collé un graphe sur un autre un nouveau copier enregistre les deux et on peut coller dans le grapheur. Le copier-coller d'une fenêtre sur une autre dans une même option d'un module, dans deux options d'un même module, entre duex modules et entre les modules et le grapheur marche très bien sur Macintosh (hum !)

>-Sur l'aspect interprétation:
>Est-ce que je peux utiliser les distances entre groupes pour une
>interprétation? Ainsi, mes individus supplémentaires sont assez groupés, ils se
>positionnent entre les deux groupes (brag et lilh) définis par l'AFC, mais plus
>près d'un des deux (lilh).
>Puis-je dire que le lilh est moins différent des bois anciens que Brag? C'est à
>dire que les coupes de lIlh ont conservé plus d'attributs spécifiques des bois
>anciens que l'autre...
>Les individus supplémentaires comportent des bois anciens de brag et de Lilh.
>Ils se répartissent aussi en 2 sous-groupes conformes aux 2 groupes de l'AFC.
>Brag et Lilh sont moins distants dans les bois anciens (indiv sup) que dans les
>coupes (indiv actifs). Est-ce que je peux en déduire qu'il y a moins de
>différences entre sites dans les bois anciens qu'entre sites dans les coupes?
>C'est à dire que la coupe conduit à une divergence de composition botanique et
>que le viellissement conduit à une convergence...

Cette partie du mail est une définition admirable du mot interprétation en satistiques : le passage des données aux observations exprimés dans les données par des procédures numériques, des observations numériques aux observations biologiques et des observations aux faits biologiques (voir Legay, J.M. (1993) Une expérience est-elle possible ?. In : Biométrie et Environnement. Lebreton, J.D. & Asselain, B. (Eds.) Masson, Paris. 1-14). On peut citer aussi la formule de Benzécri (du genre "la statistique n'est pas destinée à invalider les remarques les plus judicieuses des expérimentateurs").
La quantité d'informations biologique est trop importante dans cette question pour que des non spécialistes puissent répondre. La coupe introduit le cortège des espèces pionnières qui vont disparaître, ... et le fait proposé semble logique.

>-Pour la suite:
>La distinction entre sites m'intéresse peu. Je voudrais l'éliminer.
>Est-ce qu'une analyse intra-classe (Within analysis) avec les sites comme
>variable de regroupement est la solution adaptée?

C'est une des solutions, la plus simple et de bon rapport qualité-prix.
STATIS : Operator averaging fait cela aussi (les sites définissent les blocs) mais est plus compliquée à dépouiller. Les deux cherchent des stuctures communes entre unités d'un même site à l'aide d'une même ordination des espèces mais par une logique différente.

Daniel Chessel
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