Re: Mantel or not Mantel

From: Daniel Chessel (chessel@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Fri Apr 24 1998 - 17:58:49 MET DST


Jean Pierre ROSSI pose une question qui touche au fond de qu'on appelle
test de permutations ou test de randomisation.

Le test de Mantel est l'un des plus simples. Sous certaines hypothèse
l'observation qu'on a faite est supposée tirée au hasard dans l'ensemble
dans n! = n*(n-1)*(n-2)*...3*2*1 cas possibles équiprobables.

Quand n est petit on peut énumérer tous les cas et positionner exactement
l'observation dans l'ensemble des possibles. C'est un test de permutation.

Pour n = 3 il y a 6 cas possibles et l'observation ayant au moins 1 chance
sur 6 de se réaliser aucun test n'est possible. Pour n = 4 il y a 24 cas et
c'est encore limite. Mais dès que n = 10 le nombre des cas est très grand
et on en tire un certain nombre m au hasard pour comparer l'observation à
la population des possibles. C'est un test de randomisation.

On peut faire de même quand n est petit et si m est grand on retrouvera les
mêmes combinaisons plusieurs fois mais on aura une idée précise de la
distribution de la statistique et de la position de l'observation.

On peut donc dire qu'il n'y a pratiquement pas de condition d'utilisation
sur le n dans un test d'équiprobabilité de n! permutations comme le test de
Mantel (Distances: Mantel Test). C'est un principe très général. Ce genre
de test définit lui-même la possibilité de l'employer dès qu'on peut voir
la distribution simulée. Le test partiel n'est pas installé dans ADE-4.
Dans la même logique, avec des graphes de voisinage, le test de Geary dans
sa version randomisée (NGStat: NG Test) est à comparer avec l'approximation
normale classique (NGStat: Geary Test).

>Je recherche des informations (references bibliographiques) sur le nombre
>de mesures minimum qu'il est necessaire de realiser pour pouvoir appliquer
>le test de Mantel (simple et/ou Partiel).
>Merci d'avance et bon week end!
>Jean Pierre
>
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>Jean Pierre ROSSI
>Laboratoire d'Ecologie des Sols Tropicaux
>Université Paris 6/ORSTOM Centre de Bondy
>32 Av. VARAGNAT
>93143 Bondy Cedex
>FRANCE
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Daniel Chessel
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