Problèmes de pratique statistique
Biologie évolutive
[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/pps1.html Version : 09.12.14]
Problèmes de pratique statistiqueBiologie évolutive[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/pps1.html Version : 09.12.14] | |
Mesurer la diversité taxonomique de l'avifaune de la Réserve Naturelle des Ramières Données présentées par Romain Bertrand (M2 ABEEB 2006) : comment mesurer la diversité en tenant compte de la taxonomie d'un cortège faunistique ? |  |
La compilation de Morgan Ernest sur les traits d'histoire de vie des mammifères euthériens Olivier Delaigue (M2 oMIV 2006) nous fait connaître la base de données proposée dans les archives de l'ESA par S. K. Morgan Ernest (2003. Life History Characteristics of Non-Volant Placental mammals. Ecology 84:3401. Ecological Archives E084-093). |
Chili, Californie, Bourgogne, Provence : communautés d'oiseaux Avec \textt{data(ecomor)} dans le paquet ade4, on obtient un objet complexe qui pose des questions statistiques difficiles. C'est une transcription fidèle des données publiées par J. Blondel , F. Vuilleumier, L. F. Marcus et E. Terouanne (1984). Données disponibles par \texttt{library(ade4)}. |
Galabiose et phylogénie des Oiseaux Pour réfléchir sur la signification statististique et la sigification biologique en partant d'un extraordinaire article de N. Suzuki, M. Laskowski et Y.C. Lee (2004). |
Oiseaux, végétation et trajectoires convergentes 89 espèces / 5 régions / 6 stades de succession forestière. Une structure de données très particulière à découvrir. Un problème de biogéographie initié par J. Blondel d'essence statistique. |
Longévité et fidélité : chez les Pétrels et les Albatros 13 espèces et leur phylogénie dans \texttt{data(procella)}. Liaison entre 4 traits d'histoire de vie. Un problème difficile posé dans un travail de J. Bried, D. Pontier et P. Jouventin (2002). |  |
Masse corporelle et style alimentaire Gilles Bourgoin - M2 - EEB - 2005 propose une étude de liens entre traits biologiques sous contrainte phylogénétique décrits dans Pérez-Barbería, F. J., and I. J. Gordon. 1999. The relative roles of phylogeny, body size and feeding style on the activity time of temperate ruminants: a reanalysis. Pour débuter : comment on teste le lien entre une phylogénie et un trait qualitatif ? |
Régime alimentaire et morphométrie des poissons de l'Amazonie bolivienne Esther Hubert (M2 - EEB - 2005) nous invite à découvrir les données éditées dans Pouilly, M., F. Lino, J.-G. Bretenoux, and C. Rosales. 2003. Dietary-morphological relationships in a fish assemblage of the Bolivian Amazonian floodplain. \textit{Journal of Fish Biology} \textbf{62}:1137-1158. Un beau problème de couplage de deux tableaux biologiques. |
Gaufres et poux : Coévolution hôtes-parasites et couplage de phylogénies Sabine Patot (M2 - EEB - 2005) présente l'article de Legendre, P., Y. Desdevises, and E. Bazin. 2002. A statistical test for host-parasite coevolution. Systematic Biology 51:217-234. Un cas d'école de description statistique des structures biologiques. |
Lacertidés : tableaux de traits et phylogénies Périnne Pelosse (M2 - EEB - 2005) décrit les données publiées par Dirk Bauwens et Ramón Díaz-Uriarte de 1997 : 'Covariation of life-history traits in Lacertid lizards: a comparative study.' (American Naturalist 149:91-111). Sait-on faire des ACP sous contrainte phylogénétique ? A utiliser avec data(lizards). |
