Problèmes de pratique statistique
Ecologie des communautés - Ecosystèmes
[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/pps2.html Version : 09.12.14]
Problèmes de pratique statistiqueEcologie des communautés - Ecosystèmes[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/pps2.html Version : 09.12.14] | |
Végétation de la plaine de la Mafragh Avec texttt{data(mafragh)} on obtient un ensemble de données représentatif des enquêtes phyto-écologiques à vocation d'aménagement. Un archétype souvent cité sur ce site et dans la documentation du paquet |  |
La valeur typologique des groupes faunistiques : ça se mesure ? La question est sous-jacente aux données publiées par L. Friday The diversity of macro invertebrate and macrophyte communities in ponds. Freshwater Biology, 18, 87-104, 1987. |
Richesse de l'avifaune, taille des îles et densité des singes Cyril Barnier (M2 oMIV 2006) propose d'étudier les données disponibles dans les archives de l'ESA associées à l'article de Kenneth J. Feeley et John W. Terborgh (Habitat fragmentation and the indirect effects of herbivore (howler monkey) abundances on bird species richness. Ecology 2006, 87:144-150). |
Structure des communautés aviaires de lacs du Nord-Est des Etats-Unis 208 sites, 95 espèces d'Oiseaux, 12 variables environnementales : Julien de Bortoli (Master OMIV 2004-2005) propose de visiter les données diffusées sur le site de l'United States Environmental Protection Agency . |  |
Macrofaune et annexes d'un fleuve En souvenir des travaux de Monique Coulet, un difficile problème de liaison entre cortèges faunistiques et variables explicatives, soit expérimentales soit environnementales. |
Lézards des îles de la mer de Cortés 20 espèces (Case 1983 in Manly 1995) sont présentes dans 25 îles : le problème des matrices nulles est posé (difficile). |  |
Cube de données au lac du Brévent Le lac du Brévent, situé à 2127 m d'altitude, a été étudié par Jean-Michel Chacornac (1985, 1986). Dans la thèse de l'auteur on trouve un ensemble complet de mesures temps-profondeur-descripteurs. Peut servir une réflexion sur la représentation graphique des cubes de données. |
Expertise écologique d'un hydrosystème Couple de tableaux biologique et écologique proposé et documenté par Ph. Usseglio-Polatera. Evolution d'un cortège faunistique ? Sa signification biologique ? (difficile) |
Petits lacs en Alberta Un couple classique de tableaux écologiques de Robinson, C. L. K., and W. M. Tonn (1989). 42 lacs, 11 espèces de poissons, 8 variables de milieu. |
Cube de données au lac de la Sorme 12 dates d'échantillonnage, 10 stations et 10 variables physico-chimiques sur un réservoire artificiel. |
Synchronisme et Gardons Publiés par Grenouillet et al. (2001), deux tableaux petits par la taille mais contenant un travail considérable. 11 ans, 4 sites et 2 mesures. |
Espace-Temps-Faune dans un estuaire Eric Baran propose 95 échantillons de 39 espèces sur 6 périodes et 4 stations dans l'estuaire de la Fatala. Une question écologique originale dans \texttt{data(baran95)}. |  |
Traits biologiques et traits écologiques Une classe d?informations écologiques à laquelle introduit un grand ensemble de 17 traits sur 131 espèces d'insectes aquatiques publié par B. Statzner et al. (1997) et disponible dans \texttt{data(bsetal97)}. Comment mesurer la redondance dans ce type d'information ? |
Similarités le long de la rivière Willamette Une illustration rapportée dans J. Van Sickle (1997). Une matrice de similarités suffit-elle à caractériser une variabilité spatiale ? |
Piégeages lumineux 49 nuits, 11 variables météorologiques, 17 espèces de Trichoptères. Un problème classique de couplage de tableaux. Données de Philippe Usseglio-Polatera dans \texttt{data(trichometeo)}. |
Deux saisons sur le Buëch Deux fois la même mesure de 10 variables sur 31 stations, par F. Vespini. Carte de l?évolution ou évolution de la carte ? |
Avifaune de montagne 98 espèces d'oiseaux dans 376 points d'écoute entre 600 et 3000 m, 11 variables environnementales et 6 traits biologiques : un ensemble remarquable de données proposées par H. Tournier et Ph. Lebreton. Méthodes statistiques au service des données ou données biologiques comme illustration des méthodes ? Dans data(tarentaise) les deux sont possibles. |
Acariens Oribates Une copie dans le paquet ade4 (data(oribatid)) des données proposées par P. Legendre et D. Borcard (\url{http://www.bio.umontreal.ca/Casgrain/fr/labo/oribates.html}). Pour une introduction aux difficiles questions de relations entre tableaux dans une contrainte spatiale commune. |
Bordure d'étang Un relevé linéaire de J.C. Felzines (1977). Partition, gradient, écailles ? Pour apprendre à faire sortir les modèles des données. |
Ichtyofaune du bassin du Doubs En souvenir de la thèse de Jean Verneaux (1973), une partie des données révisées par l?auteur est disponible par data(jv73). Pour poser la question de l?ordination simultanée. |
Avifaune des Albères 182 relevés portant sur 51 espèces ont permis à R. Prodon et J.D. Lebreton (1981) de poser une des bases statistiques de l?étude du lien entre avifaune et structure de la végétation. Dans data(rpjdl) |
Poissons de l'Afrique de l'Ouest Une base de données (data(westafrica)) proposée par B. Hugueny dans le but de caractériser le lien entre distances entre communautés et voisinages dans l'espace. Ordination ou classification ? |
Avifaune de la plaine de Jons Avec data(avijons) on dispose de 91 relevés spatialisés d?avifaune : quelle structure spatiale apparaît dans la dispersion des oiseaux ? |
Insularité et communautés d'oiseaux J. Blondel et B. Frochot (Blondel et al. 1988) ont collecté les données accessibles par data(avimedi). Elles posent de sérieuses questions sur les techniques d'ordination sous contraintes. |
