Modèles de la variabilité

Lois de probabilités classiques : approche pratique.

[ http://pbil.univ-lyon1.fr/R/html/tdr2.html Version : 30.01.17]

 Ref : tdr21 Taille : 640 ko  Version : 30.01.18 (2535 jours)

Lois de Probabilités

Aucun sommaire

 Ref : tdr22 Taille : 587 ko  Version : 19.01.17 (2911 jours)

Graphes quantiles-quantiles

Histogrammes, fonctions de répartition, droite de Henri (ou de Henry) et texttt{qqnorm()}. Mélanges de distributions

 Ref : tdr221 Taille : 209 ko  Version : 27.09.13 (4121 jours)

Estimer un mélange de lois normales

Maximum de vraisemblance, solution numérique, simulations et estimations.

 Ref : tdr222 Taille : 378 ko  Version : 27.09.13 (4121 jours)

Mélange de lois normales et tailles de génomes bactériens

Étude de la taille de 279 génomes de bactéries exprimée en kilobases (données de 2002). Mise à jour avec des données plus récentes à partir de GOLD (Genomes Online Database).

 Ref : tdr223 Taille : 421 ko  Version : 08.12.16 (2953 jours)

Mélanges et point isoélectrique des protéines

Étude de la distribution du point isolélectrique dans un protéome. Une simulation pour invalider une interprétation trop jolie pour être vraie. D'après un article de G.F. Weiller, G. Caraux et N. Sylvester (2004) Proteomics, 4:943-949.

 Ref : tdr23 Taille : 2834 ko  Version : 19.05.15 (3523 jours)

Dendrogrammmes

Introduction à la représentation d'une hiérarchie de partitions.

 Ref : tdr24 Taille : 411 ko  Version : 27.09.13 (4121 jours)

Axes principaux

Approches de la définition en dimensions réduite

 Ref : tdr25 Taille : 381 ko  Version : 27.09.13 (4121 jours)

Courbes de granulométrie

Ecrire une fonction utilitaire

 Ref : tdr26 Taille : 938 ko  Version : 10.12.14 (3682 jours)

Courbes de niveau

Comment représenter la variation d'une mesure spatialisée ? On utilise pour les illustrations une carte météorologique.

 Ref : tdr27 Taille : 172 ko  Version : 27.09.13 (4121 jours)

Intervalles de Confiance

L'objectif est de représenter les intervalles de confiance d'une moyenne, d'une proportion.

 Ref : tdr28 Taille : 582 ko  Version : 23.10.15 (3366 jours)

Mesures de biodiversité

A travers les différentes échelles (gène vs espèce vs règne ; espèce vs région) et les différents critères (e.g. phénotypiques, fonctionnels) de mesure de la biodiversité, une structure générale de données apparaît autour de trois objets : entité, catégorie, et collection. Une collection (e.g. communauté) est un ensemble d'entités (e.g. organismes) réparties entre catégories (e.g. espèces). L'entité est l'objet sur lequel nous pouvons faire des mesures, c'est l'objet que nous échantillonnons.

 Ref : tdr29 Taille : 2785 ko  Version : 09.02.24 (334 jours)

Normalisation d'une variable quantitative : la transformation de bec{}

La fonction de bsc{Box} et bsc{Cox} (1964) est une généralisation astucieuse de la transformation logarithmique qui permet, dans des situations favorables, de justifier objectivement de l'utilisation d'icelle. Dans des situations moins favorables elle permet a minima de proposer une transformation qui permet de mieux appréhender la variabilité des données. L'objectif de cette fiche de TD est de vous faire pratiquer cette transformation sur des données réelles pour vous familiariser avec l'outil.