PileUp MSF: 1734 Type: N Check: 5140 .. Name: TPMA_3UT.1.COTJA oo Len: 1734 Check: 4682 Weight: 1.00 Name: TPMA_3UT.1.CHICK oo Len: 1734 Check: 2154 Weight: 1.00 Name: TPMA_3UT.1.RAT oo Len: 1734 Check: 5699 Weight: 1.00 Name: TPMA_3UT.1.MOUSE oo Len: 1734 Check: 2700 Weight: 1.00 Name: TPMA_3UT.1.HUMAN oo Len: 1734 Check: 3069 Weight: 1.00 Name: TPMA_3UT.2.HUMAN oo Len: 1734 Check: 6836 Weight: 1.00 // TPMA_3UT.1.COTJA AAACCTTCTT AGCAGCAACC ACATTGTTAT TATTTTT... .......... TPMA_3UT.1.CHICK AAACCTTCTT AGCAGCAACC ACATTGTTAT TATTTTT... .......... TPMA_3UT.1.RAT AACCCTCCTT AGCTGCGGCC ACATTCTCTC GTTTCCCCCT GTTGTTTTAT TPMA_3UT.1.MOUSE AACCCTCCTT AGCTGCGGCC AGATTCTCTC CCCCTCCCCC CATGTTTAAT TPMA_3UT.1.HUMAN AAACCTCCTT AGCTGCGACC ACATTCTTTC ATTTTGTT.. .TTGTTTTGT TPMA_3UT.2.HUMAN AAACCTCCTT AGCTGCGACC ACATTCTTTC ATTTTGTT.. .TTGTTTTGT TPMA_3UT.1.COTJA .......... .ACACCTGCT TGCCGTGAAG CCCCATAAAC ATGTCTTTAT TPMA_3UT.1.CHICK .......... .ACACTCGCT TGCCGTGAAG CCCCATAAAC ATGTCTTTAT TPMA_3UT.1.RAT TTTGTCTTTA AACACATGCT TACCATGAAA CCCCTTCAAT GCTTTTTTTT TPMA_3UT.1.MOUSE TTTGTCTTTA AACACATGCT TACCGTGAAA CCCCTTCAAT GCGTTTTTTT TPMA_3UT.1.HUMAN TTTGTTTTTA AACACCTGCT TACC...... ..CCTTAAAT GCAATTTA.. TPMA_3UT.2.HUMAN TTTGTTTTTA AACACCTGCT TACC...... ..CCTTAAAT GCAATTTA.. TPMA_3UT.1.COTJA .......... ..TTTAGTTT CACCACAGTC ACAACAACAT CAGCTAAA.. TPMA_3UT.1.CHICK .......... ..TTTAGTTT CACCACAGTC ACAAGAACAT CAGCTAAA.. TPMA_3UT.1.RAT TTTATATATA TATATACCTT TACCACTGTC ACTGCAACAT CTGC...... TPMA_3UT.1.MOUSE TT.......A TATATACTTT TACCACTGTC ACTGAAACAT CTGCCGAGAG TPMA_3UT.1.HUMAN .......... ..TTTACTTT TACCACTGTC ACAGAAACAT CCACAAGATA TPMA_3UT.2.HUMAN .......... ..TTTACTTT TACCACTGTC ACAGAAACAT CCACAAGATA TPMA_3UT.1.COTJA .TTATCAGGC ..AGGGTCAG GAAGTACCAA AAAGGGCAAG CTGTATGCGG TPMA_3UT.1.CHICK .TTATCAGGC AGGGGTCAGG GAAACACCAA AAAGGGCAAG CTGTATGCGG TPMA_3UT.1.RAT ..AGCCAGGG CAGGGGGTGG GGAAAG..AC ACACAGAAAG .......... TPMA_3UT.1.MOUSE CCAGCTAGGG CAGGAGTTGG GGAAAG..AC GCGCAGAAAG GCAAGCCCGA TPMA_3UT.1.HUMAN CCAGCTAGGT CAGGGGGTGG GGAAAAC.AC ATACAAAAAG .CAAGCCCAT TPMA_3UT.2.HUMAN CCAGCTAGGT CAGGGGGTGG GGAAAAC.AC ATACAAAAAG .CAAGCCCAT TPMA_3UT.1.COTJA GTTAAGCTAT TTCATTATGG TTTAAATGTG CCATTTCCCC AACAAAATGT TPMA_3UT.1.CHICK GTTAAGCTAT TTCATTATGG TTTAAATGTG CCATTTCCCA ACCAAA.TGT TPMA_3UT.1.RAT .TCAGGGTAC TT....GTTA TTTAAATGTG CCATTTCCCA AGTTGG.CGT TPMA_3UT.1.MOUSE GTCAGGGCAC TT....GTTA TTTAAATGTG CCATTTCCCA GGT....... TPMA_3UT.1.HUMAN GTCAGGGCGA TC....CTGG TTCAAATGTG CCATTTCCCG GGTTGA.TGC TPMA_3UT.2.HUMAN GTCAGGGCGA TC....CTGG TTCAAATGTG CCATTTCCCG GGTTGA.TGC TPMA_3UT.1.COTJA TACCTACACT TTGTAGAGAG TTCAGAGAT. TGGAATGCTT AGTCTTTGGA TPMA_3UT.1.CHICK TACCTACACT TTGTAGAGAG TTCAGCAAT. TGGAATGCTT AGTCTTCAGA TPMA_3UT.1.RAT TGCC.GCGCT TCGCGGAG.. TTTGGGCATG CAGTTTGCTT AGCCAGTGTA TPMA_3UT.1.MOUSE TGCC.ACCCT TCATAGAG.. TTTAGGCATG CAGTTTGCTT AGCCAGTGTA TPMA_3UT.1.HUMAN TGCC.ACACT TTGTAGAGAG TTTAGCAACA CAGTGTGCTT AGTCAGTGTA TPMA_3UT.2.HUMAN TGCC.ACACT TTGTAGAGAG TTTAGCAACA CAGTGTGCTT AGTCAGCGTA TPMA_3UT.1.COTJA ATAATCCTGG CTCTGTCAGG TAGCGTCCCA CCTCAAGTGC CAACCACAGT TPMA_3UT.1.CHICK AGAATCCTGG CTGTGTCAGA TCACGTCCCA CCTCAAGTGC CAACCTCAAT TPMA_3UT.1.RAT GGAAGCCTCA CGAAAACAAA AGGATTGACA GCCTAAGTGC CAATGGTGGG TPMA_3UT.1.MOUSE GGAAGCCTCA TGAGAACAGA ACCATTAACA GCCAGAGTGC CAATGGTGGG TPMA_3UT.1.HUMAN GGAATCCTCA CTAAAGCAGA AGAAGTTCCA TTC....... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN GGAATCCTCA CTAAAGCAGG AGAAGTTCCA TTCAAAGTGC CAATGATAGA TPMA_3UT.1.COTJA TTTGAACAAG CATGATACAT CCTC.AAAAA AGATCCAGCA TAAAG.GGTG TPMA_3UT.1.CHICK TTTTAACAAG AATGATACAT CTTC.AAAAA AGATCCAGTG TAAAG.GGTG TPMA_3UT.1.RAT GTC.ATCA.G GAAGACTGAT GTTGGAGACA ..ATCAGGTG CAGATTGGTG TPMA_3UT.1.MOUSE ATC.AGCA.G GAAGACTGAT GTTGGAGACA ..ATCGGGTG CGGATTGGTG TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN GTC.AACAAG GAAGGTTAAT GTTGGAAACA CAATCAGGTG TGGATTGGTG TPMA_3UT.1.COTJA CTATTTGGAT CC.AAAAGCT CTGTAGGGGC TTTTATTTGA TACCCGATGA TPMA_3UT.1.CHICK CTATTTGGAT CA.AAAAGCT CTACTGGGGC TTTTATTTGA TACCTGAC.A TPMA_3UT.1.RAT CTAATTTAAA CAAAAGAACC CC.TAGTGTC TTTTGTTCAG TCTAATAC.A TPMA_3UT.1.MOUSE CTAATTTAAA CAAAAGGGCC TC.TGGGGTC TTTTGTTCAA TATTTTAC.A TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN CTACTTTGAA CAAAAGGTCC CCCTGTGGTC TTTTGTTCAA CATTGTAC.A TPMA_3UT.1.COTJA GTCAGGACTT GTTGAGCACA GTAATTTATT TTTATCA.GC ATTTTACTGA TPMA_3UT.1.CHICK GTCAGGGCTT GCTGAGCACA GTAATTTATT TTTATCA.GC ATTTTACTGA TPMA_3UT.1.RAT ATTTAG.CTT CTGTTCAACA CTAATTTATT TTTGTCTTGA GTAGCACTGC TPMA_3UT.1.MOUSE ATTTAGACTT CTGTCCAACA CTAATTTATT TT.GTCTTGA GTTGTACTGC TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN ATGTAGAACT CTGTCCAACA CTAATTTATT TT.GTCTTGA GTTTTACTAC TPMA_3UT.1.COTJA TC........ .......TGT GAGGATTTGG ACTTTG.TGC CTTTGATT.. TPMA_3UT.1.CHICK TC........ .......TGT GAGGATTTGG ACTTCG.TGC CTTCTATT.. TPMA_3UT.1.RAT AACTAATTAC TTGTCCTGAG TAGCACTGAG AGAGATATGG TTCCATGTGC TPMA_3UT.1.MOUSE GA........ .......GAG AAGAATATGG GGTTTTGTAT GCCCGTGT.. TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN AA........ .......GAT GAG.ACTATG GATCCCGCAT GCCT...... TPMA_3UT.1.COTJA ....TCAATA GAACGAAGGC TGTGTGGTCA ACACAGTAAA ACAAAGGCTT TPMA_3UT.1.CHICK ....TCAGTG GAACGAAGGA TATGTAGTCA ACACAGTAAA ACAAAGGCTT TPMA_3UT.1.RAT CCTGTCCTCA CAGCCAAGG. TTTGAAAGCC ACGCTGTTCT GGTAAGATTC TPMA_3UT.1.MOUSE ....TCCTTA AAGCCAAGGG TTTGAAAGCC ACGCTGGTCT TCTGAGATTC TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA ATGAAGGTTT TA.AATTGTA AACTT.GCAA CTCGTTACAT AAGTGTAGGT TPMA_3UT.1.CHICK ATGAAGGTTT TA.AACTGTA AACTT.GCAA CTTGCTACAT AAGTGTAGGT TPMA_3UT.1.RAT CCAATTCCTT CCCAGCTGAC ATGCTTGTGG TCCCTT...A ACTAGTGGGA TPMA_3UT.1.MOUSE CAAGTCCTTC CCCAGCTCAC ATGCCCGTAG CCCCTTCCGA CTCAGTGGGG TPMA_3UT.1.HUMAN .......... ...CTT.TCT GATTGGCACA CGT..GCAGC TCATGACAAT TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA CAACATTTCC GCTTGAGTAT TCTTC..ATT GT..ATTTTT C..ATGTTCA TPMA_3UT.1.CHICK CAACATTTCA GCTTGAGTAT TCCTTCAATT GT..ATTTTT C..ATGTTCA TPMA_3UT.1.RAT AGAGGGCTCA GTCTTTTCGC CCCCCCCCCC CCAGATTCTG CCAATGTCA. TPMA_3UT.1.MOUSE CGAGCGCTCA ACACGGATCG CCCCCCCCTT CCCAGTTCTC C..ATATCA. TPMA_3UT.1.HUMAN CTGTAGGATA ACAATCAGTG TGGATTTCCA CTCTTTTCAG TC..CTTCA. TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA AATGAAAGAT TCAATAAATT CAGGAGAAAA CACAAATTTG GAAGAGATTG TPMA_3UT.1.CHICK AATGAAAGAT TCAATAAATT CAGGAGAAAA CACAAATTTG GAAGAGATTG TPMA_3UT.1.RAT .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA TTTAAAATGT ATTTTATTTG TGTGGAGCTT GGGGCG...G GGGTGGA..C TPMA_3UT.1.CHICK TTTAAAATGT ATTTTATCTG TGTGGAGCT. ...GAG...G GGGTGGAACT TPMA_3UT.1.RAT .......... .......... .......... .........G GGTAAGAGAT TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .........G GGTAGAAGAT TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... TGTTAAAGAT TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA TTACAAAT.C GATATTCGCC TCACTTTAT. TTTTCACACT TTCTTT.GAG TPMA_3UT.1.CHICK TCACAAATTC GATATTCGCC TCACTTTGT. TTTTCACACT TTCTTTTGAG TPMA_3UT.1.RAT CTAGGCACTA CATATGTAAT GGTAGAAGA. AAAGGGCATT TTCTCGAGAG TPMA_3UT.1.MOUSE CTAGGCACTA CATATGTAAT TGGTAAAGA. AAAGG.CATT TTCTTAAGAG TPMA_3UT.1.HUMAN TTAGACACCA CATA..CAAC TGGTAAAGG. A.....CGTT TTCTTGAGAG TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA CAGTTTAAA. .GTATACCTG TATGTAAACA TTGTATAATG ATATG.AATA TPMA_3UT.1.CHICK CAGTTTTAAA CGTATACCTG TATGTAAACA TTGTATAATG ATATGGAATA TPMA_3UT.1.RAT T......... ..TATAACTA T..GTAAACA TTGTATAATG ATATGAAATA TPMA_3UT.1.MOUSE T......... ..TATAACTA T..GTAAACA TTGTATAATG ATATGAAATA TPMA_3UT.1.HUMAN T......... ..TTTAACTA TATGTAAACA TTGTATAATG ATATGGAATA TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA AAATGCACAT TTTAGGA.AT TTTTTAAATC GTACCTCTCC TTGGATTTTC TPMA_3UT.1.CHICK AAATGCACAT TTTAGGACAT TTTTTAAA.T TTTACTCTCC TGTGATTTTT TPMA_3UT.1.RAT AAATGCACAT TGTAGGACAT TTTCTAAA.T CTGGTGGTCC TGTCGTTTGT TPMA_3UT.1.MOUSE AAACGCACAT T.TAGGACAT TTTCT..... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN AAATGCACAT TTTAGGACAT TTTCTAAA.. .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA ATCATCCTAA TGTCTGTATT GCTGTGTAAA ACTATATATT GGCACTGTCT TPMA_3UT.1.CHICK CATCACGCTT ATTATGTATG TCTGTATGGC TGTGTAAAAC GTGTATGTGG TPMA_3UT.1.RAT CTGGTTTTGT TGTTGTTGTT GTTGTCTTGC TTTGTGAACT CAGCGCGATG TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA CACTGGGTAC ATCGTTACAC ATGGTTTTCA GTTTCCCCTN TGCTTTTAAG TPMA_3UT.1.CHICK GCACTGTCTC ATTGGGTGCA CCGTTACCAC ACTGGTTTTC AGTCTCTGCT TPMA_3UT.1.RAT GACCTGCCTG CCTCTTGAGA GGTTGCTTAC GCTGGTGTTC CACAGAGGCT TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA CT.......A GCATATAAGA AAAGCATGAA ATGCAGTGGT TTGGACTTAG TPMA_3UT.1.CHICK GT.TAACGTA ATGTATAAAA AAGCAATGAA ATGCTGTGGT TTGGACTTGC TPMA_3UT.1.RAT GGGTCCCTTG GTTAGCCTCT GAGCAGTGAT TTAAGTCAGA AAGCCCTTTC TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA GTGGATCTGC AGCTGCTTAG GGGGACCATA CTGTGAGAAT CTATCCCCCC TPMA_3UT.1.CHICK ATGGATCAGC AGCTGCTTCA CGGGGCCATA CTGCGAGTAT CTACCCCCA. TPMA_3UT.1.RAT CAAACG.... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA CCCCCCATCA CTTGATTGTG TTTCCAGATG GATGCAGGCA GCGACCATCA TPMA_3UT.1.CHICK .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.RAT .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA CTCAAGGGAA GACAGACATT AAAGTAAAAT GTAAAAGCAG TAAAAGCACT TPMA_3UT.1.CHICK .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.RAT .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA GCATATCTTT CATAATAATT TTCACCCCTT CTTTTTCTTT AGTACATCAC TPMA_3UT.1.CHICK .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.RAT .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.COTJA TGAAAGCTGA TGCTGTACAT CCTTCTAGCA GAAAGGAGCT TGGTAGGAGA TPMA_3UT.1.CHICK .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.RAT .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.MOUSE .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.1.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... TPMA_3UT.2.HUMAN .......... .......... .......... .......... .......... 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