(data stored in SCRATCH zone)

SWISSPROT: C8UBD3_ECO1A

ID   C8UBD3_ECO1A            Unreviewed;       296 AA.
AC   C8UBD3;
DT   03-NOV-2009, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT   03-NOV-2009, sequence version 1.
DT   11-DEC-2019, entry version 54.
DE   SubName: Full=Putative IS629 transposase OrfB {ECO:0000313|EMBL:BAI36055.1};
GN   OrderedLocusNames=ECO111_0307 {ECO:0000313|EMBL:BAI34294.1},
GN   ECO111_0316 {ECO:0000313|EMBL:BAI34303.1}, ECO111_0582
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI34556.1}, ECO111_0786
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI34748.1}, ECO111_0805
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI34766.1}, ECO111_1043
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI34994.1}, ECO111_1079
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35029.1}, ECO111_1219
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35166.1}, ECO111_1298
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35236.1}, ECO111_1424
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35359.1}, ECO111_1582
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35508.1}, ECO111_1604
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35529.1}, ECO111_1735
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35647.1}, ECO111_1951
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI35843.1}, ECO111_2185
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36055.1}, ECO111_2300
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36164.1}, ECO111_2506
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36369.1}, ECO111_2620
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36479.1}, ECO111_2625
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36483.1}, ECO111_2641
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36497.1}, ECO111_2657
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36510.1}, ECO111_2677
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36528.1}, ECO111_2682
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI36532.1}, ECO111_3356
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI37167.1}, ECO111_3375
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI37184.1}, ECO111_3721
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI37510.1}, ECO111_3776
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI37560.1}, ECO111_3997
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI37775.1}, ECO111_4508
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI38264.1}, ECO111_5001
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI38734.1}, ECO111_5088
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI38812.1}, ECO111_5172
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI38889.1}, ECO111_5200
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI38916.1}, ECO111_p1-025
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39000.1}, ECO111_p1-040
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39012.1}, ECO111_p1-156
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39123.1}, ECO111_p2-087
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39284.1}, ECO111_p2-119
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39313.1}, ECO111_p3-29
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39344.1}, ECO111_p3-69
GN   {ECO:0000313|EMBL:BAI39375.1};
OS   Escherichia coli O111:H- (strain 11128 / EHEC).
OG   Plasmid pO111_1 {ECO:0000313|EMBL:BAI39000.1,
OG   ECO:0000313|Proteomes:UP000001614},
OG   Plasmid pO111_2 {ECO:0000313|EMBL:BAI39284.1,
OG   ECO:0000313|Proteomes:UP000001614}, and
OG   Plasmid pO111_3 {ECO:0000313|EMBL:BAI39344.1,
OG   ECO:0000313|Proteomes:UP000001614}.
OC   Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales;
OC   Enterobacteriaceae; Escherichia.
OX   NCBI_TaxID=585396 {ECO:0000313|EMBL:BAI36055.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000001614};
RN   [1] {ECO:0000313|EMBL:BAI36055.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000001614}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=11128 {ECO:0000313|EMBL:BAI36055.1}, and 11128 /
RC   EHEC {ECO:0000313|Proteomes:UP000001614};
RC   PLASMID=Plasmid pO111_1 {ECO:0000313|Proteomes:UP000001614}, Plasmid
RC   pO111_2 {ECO:0000313|Proteomes:UP000001614}, Plasmid pO111_3
RC   {ECO:0000313|Proteomes:UP000001614}, pO111_1
RC   {ECO:0000313|EMBL:BAI39000.1}, pO111_2 {ECO:0000313|EMBL:BAI39284.1},
RC   and pO111_3 {ECO:0000313|EMBL:BAI39344.1};
RX   PubMed=19815525; DOI=10.1073/pnas.0903585106;
RA   Ogura Y., Ooka T., Iguchi A., Toh H., Asadulghani M., Oshima K., Kodama T.,
RA   Abe H., Nakayama K., Kurokawa K., Tobe T., Hattori M., Hayashi T.;
RT   "Comparative genomics reveal the mechanism of the parallel evolution of
RT   O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli.";
RL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106:17939-17944(2009).
CC   ---------------------------------------------------------------------------
CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC   Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC   ---------------------------------------------------------------------------
DR   EMBL; AP010960; BAI34294.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI34303.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI34556.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI34748.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI34766.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI34994.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35029.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35166.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35236.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35359.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35508.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35529.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35647.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI35843.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36055.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36164.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36369.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36479.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36483.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36497.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36510.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36528.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI36532.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI37167.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI37184.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI37510.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI37560.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI37775.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI38264.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI38734.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI38812.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI38889.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010960; BAI38916.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010961; BAI39000.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010961; BAI39012.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010961; BAI39123.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010962; BAI39284.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010962; BAI39313.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010963; BAI39344.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP010963; BAI39375.1; -; Genomic_DNA.
DR   EnsemblBacteria; BAI34294; BAI34294; ECO111_0307.
DR   EnsemblBacteria; BAI34303; BAI34303; ECO111_0316.
DR   EnsemblBacteria; BAI34556; BAI34556; ECO111_0582.
DR   EnsemblBacteria; BAI34748; BAI34748; ECO111_0786.
DR   EnsemblBacteria; BAI34766; BAI34766; ECO111_0805.
DR   EnsemblBacteria; BAI34994; BAI34994; ECO111_1043.
DR   EnsemblBacteria; BAI35029; BAI35029; ECO111_1079.
DR   EnsemblBacteria; BAI35166; BAI35166; ECO111_1219.
DR   EnsemblBacteria; BAI35236; BAI35236; ECO111_1298.
DR   EnsemblBacteria; BAI35359; BAI35359; ECO111_1424.
DR   EnsemblBacteria; BAI35508; BAI35508; ECO111_1582.
DR   EnsemblBacteria; BAI35529; BAI35529; ECO111_1604.
DR   EnsemblBacteria; BAI35647; BAI35647; ECO111_1735.
DR   EnsemblBacteria; BAI35843; BAI35843; ECO111_1951.
DR   EnsemblBacteria; BAI36055; BAI36055; ECO111_2185.
DR   EnsemblBacteria; BAI36164; BAI36164; ECO111_2300.
DR   EnsemblBacteria; BAI36369; BAI36369; ECO111_2506.
DR   EnsemblBacteria; BAI36479; BAI36479; ECO111_2620.
DR   EnsemblBacteria; BAI36483; BAI36483; ECO111_2625.
DR   EnsemblBacteria; BAI36497; BAI36497; ECO111_2641.
DR   EnsemblBacteria; BAI36510; BAI36510; ECO111_2657.
DR   EnsemblBacteria; BAI36528; BAI36528; ECO111_2677.
DR   EnsemblBacteria; BAI36532; BAI36532; ECO111_2682.
DR   EnsemblBacteria; BAI37167; BAI37167; ECO111_3356.
DR   EnsemblBacteria; BAI37184; BAI37184; ECO111_3375.
DR   EnsemblBacteria; BAI37510; BAI37510; ECO111_3721.
DR   EnsemblBacteria; BAI37560; BAI37560; ECO111_3776.
DR   EnsemblBacteria; BAI37775; BAI37775; ECO111_3997.
DR   EnsemblBacteria; BAI38264; BAI38264; ECO111_4508.
DR   EnsemblBacteria; BAI38734; BAI38734; ECO111_5001.
DR   EnsemblBacteria; BAI38812; BAI38812; ECO111_5088.
DR   EnsemblBacteria; BAI38889; BAI38889; ECO111_5172.
DR   EnsemblBacteria; BAI38916; BAI38916; ECO111_5200.
DR   EnsemblBacteria; BAI39000; BAI39000; ECO111_p1-025.
DR   EnsemblBacteria; BAI39012; BAI39012; ECO111_p1-040.
DR   EnsemblBacteria; BAI39123; BAI39123; ECO111_p1-156.
DR   EnsemblBacteria; BAI39284; BAI39284; ECO111_p2-087.
DR   EnsemblBacteria; BAI39313; BAI39313; ECO111_p2-119.
DR   EnsemblBacteria; BAI39344; BAI39344; ECO111_p3-29.
DR   EnsemblBacteria; BAI39375; BAI39375; ECO111_p3-69.
DR   KEGG; eoi:ECO111_0307; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_0316; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_0582; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_0786; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_0805; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1043; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1079; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1219; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1298; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1424; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1582; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1604; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1735; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_1951; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2185; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2300; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2506; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2620; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2625; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2641; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2657; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2677; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_2682; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_3356; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_3375; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_3721; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_3776; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_3997; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_4508; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_5001; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_5088; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_5172; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_5200; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p1-025; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p1-040; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p1-156; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p2-087; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p2-119; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p3-29; -.
DR   KEGG; eoi:ECO111_p3-69; -.
DR   HOGENOM; HOG000023134; -.
DR   KO; K07497; -.
DR   OMA; HDVARCT; -.
DR   Proteomes; UP000001614; Chromosome.
DR   GO; GO:0003676; F:nucleic acid binding; IEA:InterPro.
DR   GO; GO:0015074; P:DNA integration; IEA:InterPro.
DR   Gene3D; 3.30.420.10; -; 1.
DR   InterPro; IPR025948; HTH-like_dom.
DR   InterPro; IPR001584; Integrase_cat-core.
DR   InterPro; IPR012337; RNaseH-like_sf.
DR   InterPro; IPR036397; RNaseH_sf.
DR   Pfam; PF13276; HTH_21; 1.
DR   Pfam; PF00665; rve; 1.
DR   SUPFAM; SSF53098; SSF53098; 1.
DR   PROSITE; PS50994; INTEGRASE; 1.
PE   4: Predicted;
DR   PRODOM; C8UBD3.
DR   SWISS-2DPAGE; C8UBD3.
KW   Plasmid {ECO:0000313|EMBL:BAI39000.1}.
FT   DOMAIN          125..285
FT                   /note="Integrase catalytic"
FT                   /evidence="ECO:0000259|PROSITE:PS50994"
SQ   SEQUENCE   296 AA;  33718 MW;  1A59581C77AE2904 CRC64;
     MMPLLDKLRE QYGVGPVCSE LHIAPSTYYH CQQQRHHPDK RSARAQHDDW LKREIQRVYD
     ENHQVYGVRK VWRQLLREGI RVARCTVARL MAVMGLAGVL RGKKVRTTIS RKAVAAGDRV
     NRQFVAERPD QLWVADFTYV STWQGFVYVA FIIDVFAGYI VGWRVSSSME TTFVLDALEQ
     ALWARRPSGT IHHSDKGSQY VSLAYTERLK EAGLLASTGS TGDSYDNAMA ESINGLYKAE
     VIHRKSWKNR AEVELATLTW VDWYNNRRLL GRLGHTPPAE AEKAYYASIG NDDLAA
//

If you have problems or comments...

PBIL Back to PBIL home page