Alignment of the gene Family HOG000228714 of HOGENOM

JalView . Download . SRS . Tree .
Threshold: 50% 80% 100%
Size: Bigger Smaller Normal
Isoforms are ON
ACIET_1_PE2732 ACIET_1_PE2732 ----------MIFAATL-VRRCTAGLALASLAGVAAAKL--PPLSPEAQAKAAETAAKAA ACISJ_3_PE3318 ACISJ_3_PE3318 ----------MIFAATL-VRRCTAGLALASLAGVAAAKL--PPLSPEAQAKAAETAAKAA ALDEN1_2_PE3311 ALDEN1_2_PE3311 ---------MISVSSSL-ARRCAAGLALGALACVAAAKL--PPLTSQAQAKAAEAAAKAA BOBRO1_1_PE2115 BOBRO1_1_PE2115 -------------------MKKIAALIIALAAAPALAKL--PPPTPEAAAKAKETAAKAA BOPAR1_1_PE1832 BOPAR1_1_PE1832 -------------------MKKIAALIIALAAAPALAKL--PPPTPEAAAKAKETAAKAA BOPER1_1_PE1292 BOPER1_1_PE1292 -------------------MKKIAALIIALAAAPALAKL--PPPTPEAAAKAKETAAKAA BORPD_1_PE4670 BORPD_1_PE4670 -------------------MKLLAALPLAMIAAAAHATL--PAPSAEAQAKAAEAKAKAA CUPNH_2_PE2857 CUPNH_2_PE2857 ----------MTMTRTLTLVALC---AGATLATGALAKL--PPPTEAQQAKAAETKARTA CUPPJ_3_PE686 CUPPJ_3_PE686 ------------MKRILMLIALAAGTAGLAGSQAALAKL--PSPTDAQKAKAEETKARTA CUTAI1_1_PE2348 CUTAI1_1_PE2348 ------------MTRILTLIAVAAGAAGAAFAPDALAKL--PPPTEAQQAKAAETRARAA HERAR_1_PE1337 HERAR_1_PE1337 ------------MKKIL------IGLMGWAVVGMACAAL--PPLSDEAKAKAAEAKNKSA JANMA_1_PE1966 JANMA_1_PE1966 ------------MKKIL------IALLGTMLMASASAKL--PPLSDEAKAKAAETKNKAG LEPCP_1_PE3702 LEPCP_1_PE3702 --------------MNR-YAILSAGLVGALFAATVSAKL--PPPGDEAKAKAAEAAAKTA METPP_1_PE1173 METPP_1_PE1173 LMMNRPTPGPRCVAAAL-CA-----VLGLALLPAAHAKL--PAPTPEAKAKADEAKAKTA POLNA_9_PE828 POLNA_9_PE828 --------------MTL-KKLLTTGL-LLGGCALAAARL--PPPSPEAKAKSDEAAARAA POLSJ_1_PE930 POLSJ_1_PE930 -------------MKKL-IRLLTWGL-LAGVPALALAKL--PPLNDEAKAKAAEAAAKTA RASOL1_1_PE2366 RASOL1_1_PE2366 --MTWSTR---KMR--R-SGTWLAAALLGLASATAGARL--PPPTAEQKARAEMDKAKAA RASOL2_1_PE1004 RASOL2_1_PE1004 --MTGSAK---KMH--P-LGTWLAATVLGLASATAGARL--PAPTEAQKAKAEVDKAKAV RASOL3_2_PE1046 RASOL3_2_PE1046 --MRLHAA---RMR--L-SGMG-LAAVLGLASGFAGARL--PAPTAEQKAKADVDKAKAA RHOFD_2_PE3204 RHOFD_2_PE3204 ------MPEKACMKKPL-KQMFVISS-LLLMGTAVMAKL--PAPSDEAKAKAAEAAAKAA THIK1_1_PE2875 THIK1_1_PE2875 ---M------RCMRG-L-IV-----AVSLACGATAWAKL--PPPSPEAKAKAEEAAAKGK THIS3_1_PE3321 THIS3_1_PE3321 -MMM------RCMRG-L-IV-----AVSLACGATAWAKL--PPPSPEAKAKAEEAAAKAK VAPAR1_1_PE3583 VAPAR1_1_PE3583 ------------MKHTL-ILLCALA--LPLAATSAFAKL--PAPSPEAQAKAADTAARTA VARPS_1_PE4009 VARPS_1_PE4009 ------------MKLPL-NLSCASLLVLALAAPAAWAKLAPPPATPEAKAKAAEAAAKTA MATCH . * * *. *:: : CONSENSUS ??????????????????????????????????A?A?L??P???????AKA?E??A??A

ACIET_1_PE2732 ACIET_1_PE2732 WSGKVDAYKLCQAQDRVVAHYRRTAP----NAAPAVSAPACLDPGPFSYTPPE-A----- ACISJ_3_PE3318 ACISJ_3_PE3318 WSGKMDAYKLCQAQDRVVAHYRRTAP----NPAPAVPAPACLDPGPFSYTPPE-A----- ALDEN1_2_PE3311 ALDEN1_2_PE3311 WAGKVDAYKLCLAQDRVVAQYRRTAQ----DVRPAAAMPACADPGPFSYTPPP-E----- BOBRO1_1_PE2115 BOBRO1_1_PE2115 WSGKMDAFRLCRVQDEVAATYFERAKAAGKTTRAPMATPECKDPGPFVYNAE--D----- BOPAR1_1_PE1832 BOPAR1_1_PE1832 WSGKMDAFRLCRVQDEVAATYFERAKAAGKTTRAPMATPECKDPGPFVYNAE--D----- BOPER1_1_PE1292 BOPER1_1_PE1292 WSGKMDAFRLCRVQDEVAATYFERAKAAGKTTRAPMATPECKDPGPFVYNVE--D----- BORPD_1_PE4670 BORPD_1_PE4670 WSGKVAAYKLCQVQDTVAEQYFASARAAGKNAAPPLPTPECKDPGPFVYAPA-PV----- CUPNH_2_PE2857 CUPNH_2_PE2857 WADKVAAYQLCRAQDKTAARYFAERKAHGQETRAPSQAAACADPGPFVAPTAAAP----- CUPPJ_3_PE686 CUPPJ_3_PE686 WADKVAAFQLCKAQDKVAARYYGDMKTSGKGTHEPVQTAACADPGPFVPPAAPAT----- CUTAI1_1_PE2348 CUTAI1_1_PE2348 WSDKVAAYQLCRAQDKVATRYLADRKAHGQQVRDPVQTAACADPGPFVASAPAIA----- HERAR_1_PE1337 HERAR_1_PE1337 WSDKVAAYQLCQAQDLVAANYLKSKG----KPKPAVEVPACTNPGPYVALQVATSTVGVA JANMA_1_PE1966 JANMA_1_PE1966 WSDKVAAYQLCESQNKVAAQYLKRTG----KPKPDIAVPPCSNPGPYVALQVATSTVGVA LEPCP_1_PE3702 LEPCP_1_PE3702 HGGKVEAWLLCKSMDRVAAAYLASAKQAGKDVRPPVATPPCADPGPFVYTPPAPV----- METPP_1_PE1173 METPP_1_PE1173 WSDKVAAFQLCKSMDRVAARYAQEAKAAGKETKPSIATPACTDPGPYQVAATAAT----- POLNA_9_PE828 POLNA_9_PE828 WAGKVDAYQLCQSQDRAAASYFKSAQAAAKEVKPATATPPCTDPGVFAYTPAEAA----- POLSJ_1_PE930 POLSJ_1_PE930 WTGKIEAYQLCKAQDKVVASYYKSAKSAGKETKPPAAAPACADPGAFAYTPPEAA----- RASOL1_1_PE2366 RASOL1_1_PE2366 WSDKVAAFQLCNAQDRAVAQYQASGK----GTR-TQAGAPCADPGPFVPPAPPAP----- RASOL2_1_PE1004 RASOL2_1_PE1004 WSDKVAAFQLCQAQDRAVAQYQASGN----GTR-VQAGAPCADPGPFVPPVPPAP----- RASOL3_2_PE1046 RASOL3_2_PE1046 WSDKVAAFQLCKAQDRAVAQYQASGK----GTR-VQAGAPCADPGPFVPSVPPAP----- RHOFD_2_PE3204 RHOFD_2_PE3204 WSGKVDAYQSCKAQDKVAAHYVQTAKAAGKDVKPAPAMPPCVDPGAFSYAPAVAA----- THIK1_1_PE2875 THIK1_1_PE2875 WADKVAAYQLCQTQDKVAAFYYAQAKEQGKATQPPVPTPPCVNPGPYVAAQSDAA----- THIS3_1_PE3321 THIS3_1_PE3321 WADKVAAYQLCQTQDKVAAFYYAQAKEQGKATQPPVATPPCVNPGPYVAAQSEAA----- VAPAR1_1_PE3583 VAPAR1_1_PE3583 WNTKTDAYLLCKAQDQVAAKYRASAQAAGKPAPAAMATPPCVDPGPYAAA-PTET----- VARPS_1_PE4009 VARPS_1_PE4009 WSGKVDAYKLCQAQDRVAAKYRASATAAGKPVPPAPATPPCADPGPFVFTPPAEA----- MATCH * *: * : .. * . * :** : CONSENSUS W??K??A??LC??QD???A?Y???????????????????C?DPGP??????????????

ACIET_1_PE2732 ACIET_1_PE2732 --KPLEAAGAHSPAGTATSPPNTAVPAAAASAPKS-- ACISJ_3_PE3318 ACISJ_3_PE3318 --KPLEAAGAHSPAGTATSPPNTAVPAAAASAPKS-- ALDEN1_2_PE3311 ALDEN1_2_PE3311 --APASAPKS--------------------------- BOBRO1_1_PE2115 BOBRO1_1_PE2115 --KPREASGAHSPADTAAKPPSTPAPAAEQKPGQ--- BOPAR1_1_PE1832 BOPAR1_1_PE1832 --KPREASGAHSPADTAAKPPSTPAPAAEQKPGQ--- BOPER1_1_PE1292 BOPER1_1_PE1292 --KPREAAGAHSPADTAAKPPSSPAPAAEQKPGQ--- BORPD_1_PE4670 BORPD_1_PE4670 --QPREGSGAHSPAETASQPPSSPQPESDGKSAK--- CUPNH_2_PE2857 CUPNH_2_PE2857 ---AAPAPAVASTAADAKPA----AAGAVQSPAKAP- CUPPJ_3_PE686 CUPPJ_3_PE686 ---PA-------------------AAAAVQSTAKAP- CUTAI1_1_PE2348 CUTAI1_1_PE2348 ---ST-----------AGAP----AAGAVQSSAKAP- HERAR_1_PE1337 HERAR_1_PE1337 DAKPVPAAGAKK------------------------- JANMA_1_PE1966 JANMA_1_PE1966 DSKPVPAAGAKK------------------------- LEPCP_1_PE3702 LEPCP_1_PE3702 --AA----AASAPAVTAAAPAADKK------------ METPP_1_PE1173 METPP_1_PE1173 --PPLEAAGAHSPAKTATTPPSGKATSAEQTGTPKK- POLNA_9_PE828 POLNA_9_PE828 --KPLEASGAHSPAATATSPPGSKVPDAVMNPDKKP- POLSJ_1_PE930 POLSJ_1_PE930 --KPIEAAGAHSPAPTATSPPSTKQPDAVANPAKKP- RASOL1_1_PE2366 RASOL1_1_PE2366 --AT-----------PATPAPKG-------------- RASOL2_1_PE1004 RASOL2_1_PE1004 --AA-----------AATPPPKG-------------- RASOL3_2_PE1046 RASOL3_2_PE1046 --AT-----------PATPAAKG-------------- RHOFD_2_PE3204 RHOFD_2_PE3204 --KPLEASGAHSPAPTATSPPSSKAPAADIAPAKKP- THIK1_1_PE2875 THIK1_1_PE2875 --APAAAAQK--------------------------- THIS3_1_PE3321 THIS3_1_PE3321 --APAAAAQK--------------------------- VAPAR1_1_PE3583 VAPAR1_1_PE3583 --KPIEASGAHSPAPTAAAPPSTNQTSAQTNPAPKK- VARPS_1_PE4009 VARPS_1_PE4009 --KPIEAAGAHSPATTAASPPSTTQPAAAANPTPKAQ MATCH . CONSENSUS ?????????????????????????????????????


JalView . Download . SRS . Tree .

If you have problems or comments...

Back to PBIL home page