SSU rRNA multiple sequence alignment
Multiple sequence alignment of 40 SSU rRNA sequences.
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1
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------N
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------O
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------O
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------O
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GTGC
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
101
Mycobacter.lepra TTGTTTGGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --T-TAACAC
Streptomyc.grise ATTCACGGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --T-TAACAC
Bacillus.subti TTTATCGGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --C-TAATAC
Lactobacil.delbr TCAAATTGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --C-TAATAC
Leuconosto.mesen TCAAATTGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --C-TAATAC
Staphyloco.aureu TTTTATGGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --C-TAATAC
Bartonella.bacil OOOOOOOOOO OOTTT----- GATCCT-GGC TCAGAA-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCA-GGC-- --T-TAACAC
Rhodopseud.palus OOOOOOOOOO OOOOO----- GATCTT-GGC TCAGAG-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCA-GGC-- --T-TAACAC
Rickettsia.ricke OOOOOOOOOO OOOOO----- OOOCCT-GGC TCA-AACGGA A-CGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GTA-TGC-- --T-TAACAC
Bordetella.bronc TGAACTGAAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGAT-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GGA-TGC-- --T-TTACAC
Escherichi.coli -AAATTGAAG AGTTT----- GATCAT-GGC TCAGAT-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCA-GGC-- --C-TAACAC
Haemophilu.influ -NAATTGAAG AGTTT----- GATCAT-GGC TCAGAT-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCA-GGC-- --T-TAACAC
Thermus.therm -OOOOOOOOO OOOOO----- OOOOOO-OGC TCAGGG-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --C-TAAGAC
Thermotoga.marit -TATATGGAG GGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGG-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCG-TGC-- --C-TAACAC
Zea.mays.CP TCTCATGGAG AGTTC----- GATCCT-GGC TCAGGA-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCA-TGC-- --T-TAACAC
Chlamydomo.reinh.CP ATCCATGGAG AGTTT----- GATCCT-GGC TCAGGA-CGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GCA-TGC-- --T-TAACAC
Euglena.graci.CP GGAAATGACG AGTTT----- GATCCT-TGC TCAGGG-TGA A-CGCT-G-- ---------- ---------- -------GCG -GTA-TGC-- --T-TAACAC
Desulfuroc.mobil ------ACTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGTCCC--GA C-CGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GGG-TGGG- -GC-TAAGCC
Sulfolobus.acido ------ATTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGACCC--GA C-CGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GGG-TAGG- -GA-TAAGCC
Thermofilu.pende GGCCAGACTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGACCC--GA C-CGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GGG-TGGG- -GC-TAACCC
Thermoprot.tenax ------AAAC CGGTT----- GATCCT-GCC GGACCT--GA C-CGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GGG-TGGG- -GC-TAAGCC
Halobacter.halob ------ATTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGAGGC--CA T-TGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GAG-TCCG- -AT-TTAGCC
Halobacter.maris ------ATTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGAGGC--CA T-TGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GAG-TCCG- -AT-TTAGCC
Halococcus.morrh ------ATTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGAGGC--TA T-TGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GGG-TCCG- -AT-TCAGCC
Natronobac.magad ------ATTC CGGTT----- GATCCT-GCC GGAGGT--CA T-TGCT-A-- ---------- ---------- -------TTG -GAG-TCCG- -AT-TTAGCC
Methanococ.janna ------ATTC CGGTT----- GATCCT-GNN GGAGGC--CA C-TGCT-A-- ---------- ---------- -------TCG -GGG-TCCG- -AC-TAAGCC
Methanococ.vanni ------ATTC CGGTT----- GATCCC-GCC GGAGGC--TA C-TGCT-A-- ---------- ---------- -------TTG -GGG-TTCG- -AC-TAAGCC
Xenopus.laevi ------TACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGC--AT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Homo.sapie ------TACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGC--AT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Candida.albic ------TATC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Saccharomy.cerev ------TATC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Schizosacc.pombe ------TACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Oryza.sativ ------TACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Arabidopsi.thali ------TACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Fragaria.anana ------TACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Chlorella.ellip ------AACC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -CTC-AAAG- -AT-TAAGCC
Euglena.graci ------AATC TGGTT----- GATCCT-GCC AGCAGT-CAT A-TGCT-T-- ---------- ---------- -------TGT -T-C-AAGG- -GC-TAAGCC
Entamoeba.histo ------TATC TGGTT----- GATCCT-GCC AGTATT--AT A-TGCTGA-- ---------- ---------- -------TGT -T---AAAG- -AT-TAAGCC
Giardia.intes ------CATC CGGTC----- GATCCT-GCC GGAGCG--CG A-CGCT---- ---------- ---------- -------CTC -CCC-AAGG- -AC-GAAGCC
Trypanosom.bruce ------GATC TGGTT----- GATTCT-GCC AGTAGT-CAT A-TGCT---- ---------- ---------- -------TGT -TTC-AAGG- -AC-TTAGCC
201
Mycobacter.lepra A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----G---A AAGGTC-TCT AAAAA----- ---------- ---------- ---------- ---------- -AT-CT----
Streptomyc.grise A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----A---T GAAGCC-T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-CG----
Bacillus.subti A-TGCA-AGT -CGA-G-CG- -----G---A CAGATG-GGA G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-TG----
Lactobacil.delbr A-TGCA-AGT -CGA-G-CG- -----A---G CTGAAT-TCA AAGATCCC-- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-CG----
Leuconosto.mesen A-TGCA-AGT -CGAAG-C-- -----C---A CAGCGA-AAG GTG------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-TG----
Staphyloco.aureu A-TGCA-AGT -CGA-G-CG- -----A---A CGGAC--GAG AAG------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-TG----
Bartonella.bacil A-TGCA-AGT -CGA-G-CG- -----C---A CTC------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTT-TG----
Rhodopseud.palus --TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----G---G CATA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GC-AA----
Rickettsia.ricke A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----G---A CTAATT-GGG G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-TG----
Bordetella.bronc A-TGCA-AGT -CGG-A-CG- -----G---C AGCACG-GGC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-CG----
Escherichi.coli A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----G---T AACAG--GAA GAAG------ ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-TG----
Haemophilu.influ A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----G---T AGCAG--GAG AAAG------ ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-TG----
Thermus.therm A-TGCA-AGT -CGT-G-CG- -----G---G CCGCGG-GGT ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-T-----
Thermotoga.marit A-TGCA-AGT -CGA-G-CG- -----G---G GGAAAC-TCC C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-CG----
Zea.mays.CP A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----G---G AAGT------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GG-T-----
Chlamydomo.reinh.CP A-TGCA-AGT -CGA-A-CG- -----A---G CAAA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GC-AA----
Euglena.graci.CP A-TGCA-AGT -TGA-A-CG- -----A---A ATTACT-A-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GC-AA----
Desulfuroc.mobil A-TGGG-AGT -CGC-A-CG- -----C---T CCGC------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CG-CT----
Sulfolobus.acido A-TGGG-AGT -CTT-A-CA- -----C---T CCCG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GG-TA----
Thermofilu.pende A-TGGA-AGT -CTA-G-GA- -----G---C CGGG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GC-TACG--
Thermoprot.tenax A-TGCG-AGT -CGC-G-CG- -----C---C CGG------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GG-CG----
Halobacter.halob A-TGCT-AGT -TGT-G-CG- -----G---G T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-AG----
Halobacter.maris A-TGCT-AGT -CGC-A-CG- -----G---G C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-AG----
Halococcus.morrh A-TGCT-AGT -TGT-A-CG- -----G---G T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TC-AG----
Natronobac.magad A-TGCT-AGT -TGT-A-CG- -----A---G T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-AG----
Methanococ.janna A-TGCG-AGT -CA--A-GG- -----G---G CTCCC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-CG----
Methanococ.vanni A-TGCG-AGT -CT--A-TG- -----G---T ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TT-CG----
Xenopus.laevi A-TGCA-CGT -GTA-A-GT- -----A---C GC-ACG---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCC GGT-AC----
Homo.sapie A-TGCA-TGT -CTA-A-GT- -----A---C GC-ACG---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCC GGT-AC----
Candida.albic A-TGCA-TGT -CTA-A-GT- -----A---T AA-GCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------ATT TAT-AC----
Saccharomy.cerev A-TGCA-TGT -CTA-A-GT- -----A---T AA-GCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------ATT TAT-AC----
Schizosacc.pombe A-TGCA-TGT -CTA-A-GT- -----A---T AA-GCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------ATT TTGTAC----
Oryza.sativ A-TGCA-TGT -GCA-A-GT- -----A---T GA-ACT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------AATT CGA-AC----
Arabidopsi.thali A-TGCA-TGT -GTA-A-GT- -----A---T GA-ACG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------AATT CAG-AC----
Fragaria.anana A-TGCA-TGT -GTA-A-GT- -----A---T GA-ACT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------AATT CAG-AC----
Chlorella.ellip A-TGCA-TGT -CTA-A-GT- -----A---T AA-ACT-G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CTT TAT-A-----
Euglena.graci A-TGCA-CGT -CTC-A-GC- -----G---C AA-ACG-G-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AGTGA-----
Entamoeba.histo A-TGCA-TGT -GTA-A-GT- -----A---T AAAGAC-C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A AGT-A-----
Giardia.intes A-TGCA-T-- -----G-CC- ---------- CG-CTC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -AC-CC----
Trypanosom.bruce A-TGCA-TGC -CTC-A-GA- -----A---T CA-CTG-C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -AT-T-----
301
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTT TTAGAG--AT ACTC--G---
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GG--GT GGAT--T---
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CTCCC--TG ATG--TT---
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GGGTGA TTTGTT--GG ATGC--T---
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ACCTTT--CA -AGT--G---
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CT TCTC-T--GA -TGT--T---
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CAGT--G---
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ATGT--C---
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTCCAA--TT -AGT--T---
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GCCT--GG TGGC--G---
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CTT CTTT----GC TGAC--G---
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CTT TCTT----GC TGAC--G---
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --ACTC--CG TGGT--C---
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GGGAG--GA GTACC-C---
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G TTTC--C---
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------TT TGTG--T---
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----TA--GT AATT--T---
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G CGGG--G---
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A GGGA--G---
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G CCGG--C---
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CCGG--G---
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AC--C---
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AC--C---
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AC--C---
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AC--T---
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G GGAG--C---
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---G--C---
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG -T-G--A---
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG -T-G--A---
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG -T-G--A---
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG -T-G--A---
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------TG -T-G--A---
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------TG -T-G--A---
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------TG -T-G--A---
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------TG -T-G--A---
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----C--TG -T-G--A---
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----C--AG -T-G--G---
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----G--GA -T-G--A---
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GG -GAC--G---
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----G--CA -G-G--A---
401
Mycobacter.lepra ---AGT-GGC GAA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG GT--AAT-CT G--CCCTGCA C--------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---AGT-GGC GAA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG GC--AAT-CT G--CCCTTCA C--------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---AGC-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG GT--AAC-CT G--CCTGTAA G--------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---AGC-GGC GGA--TGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG GC--AAT-CT G--CCCTAAA G--------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---AGT-GGC GAA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG AC--AAC-CT G--CCTCAAG G--------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---AGC-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG AT--AAC-CT A--CCTATAA G--------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---AGC-GGC AAA--CGAG- TGAGTA---A CG-C-GT-GG G---AAT-CT A--CCCATCT C--------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---AGT-GGC AGA--CGGG- TGAGTA---A CG-C-GT-GG G---AAC-GT A--CCTTTTG G--------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---AGT-GGC AGA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG G---AAT-CT A--CCCATCA G--------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---AGT-GGC GAA--CGGG- TGAGTA---A TG-T-AT-CG G---AAC-GT G--CCCAGTA G--------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---AGT-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A TG-T-CT-GG G---AAA-CT G--CCTGATG G--------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---AGT-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A TG-C-TT-GG G---AAT-CT G--GCTTATG G--------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---AGC-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A CG-C-GT-GG GT--GAC-CT A--CCCGGAA G--------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---AGC-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A CA-C-GT-GG GT--AAC-CT G--CCCTCCG G--------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---AGT-GGC GAA--CGGG- TGAGTA---A CG-C-GT-AA G---AAC-CT G--CCCTTGG G--------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---AGT-GGC GAA--CGGG- TGCGTA---A CG-C-GT-AA G---AAC-CT A--CCTATCG G--------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---AGT-GGC GGA--CGGG- TGAGTA---A TA-T-GT-AA G---AAT-CT G--CGCTTGG G--------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---CGT-GGC GGA--CGGC- TGAGTA---A CA-C-GT-GG CT--AAC-CT A--CCCTCGG G--------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---TGT-GGC GGA--CGGC- TGAGTA---A CA-C-GT-GG CT--AAC-CT A--CCCTCGG G--------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---TCC-GGC GGA--CGGC- TCAGTA---G CA-C-GT-GG CT--AAC-CT A--CCCTCGG G--------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---CGC-GGC GCA--CGGC- TCAGTA---A CA-C-GT-AC CC--AAC-CT A--ACCTCGG G--------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---CGC-AGC GGA--AAGC- TCAGTA---A CA-C-GT-GG CC--AAG-CT A--CCCTGTG G--------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---CGT-GGC ATA--TAGC- TCAGTA---A CA-C-GT-GG CC--AAA-CT A--CCCTACA G--------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---CGT-AGC AAA--TAGC- TCCGTA---A CA-C-GT-GG TC--AAA-CT A--CCCTCTG G--------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---CGT-AGC AGA--TAGC- TCAGTA---A CA-C-GT-GG CC--AAA-CT A--CCCTATG G--------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---ACC-GGC GCA--CGGC- TCAGTA---A CA-C-GT-GG CT--AAC-CT A--CCCTCGG G--------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---CAT-GGC GGA--CGGC- TCATTA---A CA-C-GT-GG TT--AAC-TT A--ACCTCAG G--------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--GGT-TC C--TTTGATC G--CT--CC- ---------- ---------- -----AT---
Homo.sapie ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--GGT-TC C--TTTGGTC G--CT--CGC T--------- ---------- ----CCT---
Candida.albic ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--CGT-TT A--TTTGATA G--TA--CC- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--CGT-TT A--TTTGATA G--TT--CC- ---------- ---------- ------T---
Schizosacc.pombe ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--CGT-TT A--TTTGATA G--TA--CC- ---------- ---------- ------T---
Oryza.sativ ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--AGT-TT G--TTTGATG G--TA--CG- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--AGT-TT G--TTTGATG G--TA--AC- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--AGT-TT G--TTTGATG G--TA--TC- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---AAC-TGC GAA--TGGC- TCATTA---A AT-C-AG-TT AT--AGT-TT A--TTTGATG G--TA--CC- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---ATC-TGT GAA--TGGC- TCCTTA---C AT-C-AG-CA GT--CAT-CT A--CGTGATA GA-GT--GTG CTCGGTC--C A--CCTGCAA ----------
Entamoeba.histo ---AAC-TGC GGA--CGGC- TCATTA---T AA-C-AG-TA AT--AGT-TT C--TTTGGTT A--GT--A-- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---CGG-C-- GGA--CGGC- TCAGGA---C AA-C-GG-TT GC--ACC-CC C--CGCGGCG G--TC--C-- ---------- ---------- ------C---
Trypanosom.bruce ---ATC-TGC GCA--TGGC- TCATTA---C AT-C-AG-AC GT--AAT-CT GCCGCCAAAA ---TT----- ---TTGC--G G--TCT---- ------C---
********************
501
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- -TTCAGGG-A TAAG-CT--- ----TG-GGA AA--CTG-GG TCTAATA-CC GGATA-----
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- --TCTGGG-A CAAG-CC--- ----CT-GGA AA--CGG-GG TCTAATA-CC GGATA-----
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- --ACTGGG-A TAAC-TC--- ----CG-GGA AA--CCG-GG GCTAATA-CC GGATG-----
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- --ACTGGG-A TACC-AC--- ----TT-GGA AA--CAG-GT GCTAATA-CC GGATA-----
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- --CTGGGG-A TAAC-AT--- ----TT-GGA AA--CAG-AT GCTAATA-CC GAATA-----
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- --ACTGGG-A TAAC-TT--- ----CG-GGA AA--CCG-GA GCTAATA-CC GGATA-----
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- --TACGGA-A TAAC-AC--- ----AG-ACA AA--TTT-GT GCTAATA-CA GTATA-----
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- --TTCGGA-A CAAC-TG--- ----AG-GGA AA--CTT-CA GCTAATA-CC GGATA-----
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- --TACGGA-A TAAC-TT--- ----TT-AGA AA--TAA-AA GCTAATA-CC GTATA-----
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- --CGGGGG-A TAAC-TA--- ----CG-CGA AA--GCG-TG GCTAATA-CC GCATA-----
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A TAAC-TA--- ----CT-GGA AA--CGG-TA GCTAATA-CC GCATA-----
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A TAAC-GA--- ----CG-GGA AA--CTG-TC GCTAATA-CC GCGTA-----
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A CAAC-CC--- ----GG-GGA AA--CTC-GG GCTAATC-CC CCATG-----
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A TAAC-CA--- ----GG-GGA AA--CCC-TG GCTAATA-CC CCATA-----
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGA-A CAAC-AA--- ----CT-GGA AA--CGG-TT GCTAATA-CC CCGTA-----
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A TAAC-AT--- ----TG-GGA AA--CTG-TT GCTAATA-CC CCATA-----
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- --CGAGGA-A TAAC-AG--- ----AT-GGA AA--CGT-TT GCTAATG-CC TCATA-----
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A TAAC-AC--- ----CG-GGA AA--CTG-GT GCTAATC-CC CCATA-----
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- --ACGGGG-A TAAC-CC--- ----CG-GGA AA--CTG-GG GATAATC-CC CGATA-----
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A TAAC-CC--- ----CG-GGA AA--CTG-GG GATAAAC-CC CCATA-----
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- --AGGGGG-A CAAC-CC--- ----CG-GGA AA--CTG-GG GCTGATC-CC CCATA-----
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- --ACGGGA-A TACT-CT--- ----CG-GGA AA--CTG-AG GCTAATC-CC CGATA-----
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- --ACCGCG-A TAAC-CT--- ----CG-GGA AA--CTG-AG GCCAATA-GC GGATA-----
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- --ACCGGG-A TATC-CT--- ----CG-GGA AA--CTG-AG GTCAATC-CC AGATA-----
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- --ATCCAG-A CAAC-CT--- ----CG--GA AA--CTG-AG GCTAATC-TG GAATA-----
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- --TGGGGG-A TAAC-CT--- ----CG-GGA AA--CTG-AG GCTAATC-CC CCATA-----
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- --TGGAGC-A TAAC-CT--- ----TG-GGA AA--CTG-AG GATAATT-CT CCATA-----
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- -----CT-GT -TACTTGG-A TAAC-TG--- ----TG-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CA TGCCG-----
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- -----CT-CC -TACTTGG-A TAAC-TG--- ----TG-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CA TGCCG-----
Candida.albic ---------- ---------- ---------- -----TT-AC -TACTTGG-A TAAC-CG--- ----TG-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CA TGCTT-----
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- -----TT-AC -TACATGGTA TAAC-CG--- ----TG-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CA TGCTT-----
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- -----CA-AC -TACTTGG-A TAAC-CG--- ----TG-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CA TGCTA-----
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ------T-GC -TACTCGG-A TAAC-CG--- ----TA-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CG TGCAA-----
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ------T-AC -TACTCGG-A TAAC-CG--- ----TA-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CG TGCAA-----
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ------T-AC -TACTCGG-A TAAC-CG--- ----TA-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CG TGCAA-----
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- -----TT-AC -TACTCGG-A TAAC-CG--- ----TA-GTA AT-TCTA-GA GCTAATA-CG TGCGC-----
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- -----GG-AC CCCATTGG-A CATC-CA--- ----CC-AAA AC-CTTG-TG GCTAATA-CA CGTTC----G
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ------A-AA -TACAAGG-A TAGC-TT--- ----TG-TGA AT-GATA-AA GATAATA-CT TGAGA-----
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- -----TG-CT A--GCCGG-A CACC-GC--- ----TG-GCA AC--CCG-GC GCCAAGA-CG TGCG------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- -----CG-CA -TTACTGG-A TAAC-TT--- ----GG-CGA AA-CGCC-AA GCTAATA-CA TGAAC----C
***********************************************
601
Mycobacter.lepra --GG-ACTTC --A--AGGC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAT----- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise --AC-ACTCT ----GTCCC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAT----- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti --GT--NGTT --TG-AACC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAT----- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr --AC-AACAT --G--AATC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAT----- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen --AA-ACTTA --G--TGTC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAT----- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu --AT-ATTTT --G--AACC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAT----- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil --CG-TCC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TTCG----- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus --AG-CCC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TTAC----- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke --TT-CTC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TGCG----- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc --CG-CCC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TACG----- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli --AC-GTC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAA----- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ --TT-ATC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GGAA----- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---T-GGACC --C--GCCC- ---------- ---------- ---------- ---------- -CTTG----- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit --CG-CTCCA --T--CAAC- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCAA----- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---G-GCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GAGG----- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP --CA-GCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GAGG----- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ATTT-ACTAG --A-TCTAT- ---------- ---------- ---------- ---------- -GTGA----- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil -----GGGGA --G-GAGGCC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAG---- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido -----GGGAA --G-GAGTCC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAT---- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende -----GGCGC --G-GACACC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAT---- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax -----GGGGA --A-GGGCGC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAG---- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob -----ACGCT --T-TGCTCC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAA----- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris -----TAACT --C-TCATGT ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAGT---- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh -----CTGCT --T-TCATGT ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAT---- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad -----CGACT --C-TCATCC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAGT---- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna -----GGGGA --G-GAGGTC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAT---- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni -----AGAAA --A-GCAGTC ---------- ---------- ---------- ---------- TGGAAC---- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ACGA-GCGCT --G-ACCC-- ---------- ---------- ---------- ---------- --CCA----- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ACGG-GCGCT --G-ACCCCC TT-------- ---------- ---------- ---------- ---CGC---- ---------- ---------- ----------
Candida.albic -AAA-ATCCC --G-ACT--- ---------- ---------- ---------- ---------- -GTTT----- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev -AAA-ATCTC --G-ACC--- ---------- ---------- ---------- ---------- -CTTT----- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe -AAA-ATCCC --G-ACT--- ---------- ---------- ---------- ---------- -TTTTT---- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ -CAA-ACCCC --G-ACT--- ---------- ---------- ---------- ---------- --TCCG---- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali -CAA-ACCCC --G-ACT--- ---------- ---------- ---------- ---------- --TAT----- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana -CAA-ATCCC --G-ACT--- ---------- ---------- ---------- ---------- --TCTG---- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip --AA-ATCCC --G-ACT--- ---------- ---------- ---------- ---------- --TCC----- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ACCCAGTCAG --C-CATGCA ACACTCGGCA GGGATCCTGT CT-------- ---------- ---CC----- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo -CGATCCAGT -----TTGTA ---------- ---------- ---------- ---------- --TTAG---- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes -----CGCAA --G-GGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- --GGGC---- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce AATC-GGACG --C-TCTCTT TTTCTATGTC GCGGCTTGTG T--------- ---------- --TTAC---- ---------- ---------- ----------
701
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GGACAG
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----GCACT
801
Mycobacter.lepra ---------- -GT-C-TT-- -G---TGGTG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- -GG-G-AC-- -G---GGGTT ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- -GG-T-TC-- -A---AACNT ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- -GA-T-TC-- -A----AGTT T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- -GA-C-AC-- -A----AAGT T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- -GG-T-TC-- -A----AAAG T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- -------GGA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- -------GGG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- -------GAG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- -------GGG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- -------GAC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- -------GAT ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- -GG-G-TG-- -T----GTCC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- -GT-T-GG-- -T----GGAG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ------AGC- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ------AGT- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- -GT-A-GC-- -----TAGT- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- -GG-T-TC-- -C---TCCCC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- -GG-T-TC-- -C---TTCCC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- -GG-G-TC-- -C---GCGCT ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- -GC-C-CC-- -T---TCCTC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- -GG-G-GC-- -A---AAGCC G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- -GC-C-GA-- -G---AGTTA ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- -AC-A-GA-- -A---AGTCG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- -GG-A-GA-- -G---AGTCC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- -GA-T-CC-- -C---TCCCC ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- -GA-T-TC-- -T---TTTCT ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- --G-G-GA-- -----TGCGT -GCAT--TT- ATCAGACCA- ---AAACC-- ---AATCCGG GGC------- ---------- ----------
Homo.sapie --------GG GGG-G-GA-- -----TGCGT -GCAT--TT- ATCAGATCA- ---AAACC-- ---AACCCGG TCAGCCCCTC TCCGGC---- ----------
Candida.albic ---------- ----G-GA-- -A---GGGAT -GTAT--TT- ATTAGATAAA ---AAATC-- ---AATGCC- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ----G-GA-- -A---GAGAT -GTAT--TT- ATTAGATAAA ---AAATC-- ---AATGTC- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ----G-GA-- -A---GGGAT -GTAT--TT- ATTAGATAAA ---AAACC-- ---AATGCC- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ----G-GA-- -----GGGGC -GCAT--TT- ATTAGATAAA ---AGGCT-- ---GACGCGG GC-------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ----G-GA-- -A---GGGAC -GCAT--TT- ATTAGATAAA ---AGGTC-- ---GACGCGG GC-------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ----A-GA-- -A---GGGAT -GCAT--TT- ATTAGATAAA ---AGGTC-- ---AACGCGG GC-------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ----G-GA-- -A---GGGAC -GTAT--TT- ATTAGATAAA ---AGGCC-- ---GACCGGG C--------- ---------- ----------
Euglena.graci TCCCTTCACC GGT-G-GT-- -GG--CGGAT -GTATGCCC- AGCTGATACG A--AGACC-- ---AGCGGCC GC-------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- -TA-C-AA-- -----AATGG CCAAT--TC- ATTCAATGA- -----ATT-- ---GAGAA-- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ----G-C--- -----CCGCG -GG------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce TGTCGTGGCG -AT-G-AG-- -A---CGTCC AGCGA--AT- GAATGAAATT A--GAACC-- ---AACGCCT CCACCCGGGG GCAGT----- ----------
901
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- --CCCCGC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GCCCCG G-----CCG- CTTT-G-GT-
Homo.sapie ---------- ---------- ---CCCG--- ---------- ---------- ---------- --GCCGGGGG GCGGGCGCCG G-----CGG- CTTT-G-GT-
Candida.albic ---------- ---------- ---TTC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G GGC----T-- CTTT-G-AT-
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---TTC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G GAC----T-- CTTT-G-AT-
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---TTC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G GGC----TTT TTTT-G-GT-
Oryza.sativ ---------- ---------- ---TCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCC CGC---TG-- ATCC-G-AT-
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---TCTG--- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCT TGC------- -TCT-G-AT-
Fragaria.anana ---------- ---------- ---TCT---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCT CGC------- -ATT-G-AT-
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---TT----- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GC CCG--AC--- TCGC-G-GT-
Euglena.graci ---------- ---------- AAGGCCA--- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GTG TGT--TGG-- CATG-G-TT-
Entamoeba.histo ---------- ---------- -ATGACA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TT---CTA-- ---A---GT-
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---AAC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ACT--CAG-- ACGT-G-TT-
1001
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- AAAA-G-C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- AAAA-G-GTG G---C----- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-GCG G---C----- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- AAAA-G-GCG C--------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-ACG GT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-A-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-A-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-A-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-CGG G---G--GAC C--------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- CAAA-G-AGG G---G--GAC C--------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-TGC G---G--GAC T--------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- -AAA-G-GGC ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-GGG C--------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- AAAA-G-GA- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-GT- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- TAAA-G-AG- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- GAAAGG-GTG T---G--GCA G--------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- TAAAGG-GCT A---T--AGG C--------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- GAAAGG-GCC A---C--GGT A--------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- CAAAGG-GAT C---G--CGG G--------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-C-GC- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-C-GT- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-C-GG- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-T-GC- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-GC- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA-G-C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi GA-CTCTAG- ATAACCTCGG G--------- ---------- CCGA-T-CGC A---C--GTC ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie GA-CTCTAG- ATAACCTCGG G--------- ---------- CCGA-T-CGC A---C--GCC ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic GA-TTCATA- ATAACTTTT- ---------- ---------- CGAA-T-CGC A---T--GGC ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev GA-TTCATA- ATAACTTTT- ---------- ---------- CGAA-T-CGC A---T--GGC ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe GA-GTCATA- ATAACTTTT- ---------- ---------- CGAA-T-CGC A---T--GGC ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ GA-TTCATG- ATAACTCGA- ---------- ---------- CGGA-T-CGC A---C--GGC ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali GA-TTCATG- ATAACTCGA- ---------- ---------- CGGA-T-CGC A---T--GGC ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana GA-TTCATG- ATAACTCGA- ---------- ---------- CGGA-T-CGC A---C--AGC ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip GA-ATCATG- ATAACTTCA- ---------- ---------- CGAA-T-CGC A---T--GGC ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci GA-CTCAGG- CTGGCCCTCC GTGG-CCGCA GTG------- -CTG-G-TGG ATTTCGTGCA T--------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo GA-GTTAGG- ATGCCACG-- ---------- ---------- -ACA-A-TTG T---AGAACA C--------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- CGA--G-CAG C---G----- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce GA-CTCAAT- TCATTCCGTG CG-------- ---------- -AAA-G-CCG ----A--GC- ---------- ---------- ---------- ----------
1101
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------T--- ---------- TTTT------ ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TCCG------ ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTCG------ ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GYAA------ ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTCG------ ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTT------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTTA------ ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTTA------ ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTTA------ ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTCG------ ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTCG------ ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GAGA------ ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TTT------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GTTT------ ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GAAA------ ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GAAAA----- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -AAT------ ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----GG--- ---------- GTTAACG--- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------T--- ---------- ATTTCCC--- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CC--- ---------- ATGCT----- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CG--- ---------- ATCT------ ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TCCG------ ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TCCG------ ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TCCG------ ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TCCG------ ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GTAA------ ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATAT------ ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CCCGT----- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------C--- ---------- CCCGT----- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTTGT----- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTTGT----- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTTGC----- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------C--- ---------- CTCGT----- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------C--- ---------- TCTGT----- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------C--- ---------- TTTGT----- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------C--- ---------- TTCGT----- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GCCTC----- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ACA------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --TGA----- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTTTTT---- ----------
1201
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GCTA
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GCTG
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCG
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GCTG
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GG--CCTC
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GG--CCTC
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GG--CCGC
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GC
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GCC
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTGC---TAC
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GTTT---GTA
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TACC---GTG
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CCCG---CGG
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GAC--GGCG
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GGC--GGCG
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCT--GGCG
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCT--GGCG
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCC--GGCG
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCC--GGCG
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCT--GGCG
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCT--GGCG
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCC--GGCG
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GT GCAT--GCCC
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GT GTTT--AACA
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----C--GCA
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GC--TCG
1301
Mycobacter.lepra -GCG---G-- --TG---C-A GGAT---GGG CCC-GCG--- -GCCT-ATC- ----A-GCTT ----GTTGG- TG-GGGT--- -GACGGCCTA CCA-----AG
Streptomyc.grise -GCG---G-- --TG---A-A GGAT---GAG CCC-GCG--- -GCCT-ATC- ----A-GCTT ----GTTGG- TG-GGGT--- -AATGGCCTA CCA-----AG
Bacillus.subti -CCA---C-- --TT---A-C AGAT---GGA CCC-GCG--- -GCGC-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-AGGT--- -AACGGCTCA CCA-----AG
Lactobacil.delbr -TCA---C-- --TT---T-A GGAT---GAG CCC-GCG--- -GCGC-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AAAGGCCTA CCA-----AG
Leuconosto.mesen -TCA---C-- --CT---A-G AGAT---GGA TCC-GCG--- -GTGC-ATT- ----A-GTTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AAAGGCCTA CCA-----AG
Staphyloco.aureu -TCA---C-- --TT---A-T AGAT---GGA TCC-GCG--- -CTGC-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TA-AGGT--- -AACGGCTTA CCA-----AG
Bartonella.bacil -TCG---G-- --AG---A-T GGAT---GAG CCC-GCG--- -TTGG-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-AGGT--- -AACGGCCCA CCA-----AG
Rhodopseud.palus -TCG---C-- --CG---A-A AGAT---CGG CCC-GCG--- -TCTG-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-TGGT--- -AAAGGCGCA CCA-----AG
Rickettsia.ricke -TCG---C-- --TG---A-T GGAT---GAG CCC-GCG--- -TCAG-ATT- ----A-GGTA ----GTTGG- TG-AGGT--- -AATGGCTCA CCA-----AG
Bordetella.bronc -GCA---C-- --TA---T-T GGAG---CGG CCG-ATA--- -TCGG-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AACGGCCTA CCA-----AG
Escherichi.coli -TTG---C-- --CA---T-C GGAT---GTG CCC-AGA--- -TGGG-ATT- ----A-GCTA ----GTAGG- TG-GGGT--- -AACGGCTCA CCT-----AG
Haemophilu.influ -ATG---C-- --CA---T-A GGAT---GAG CCC-AAG--- -TGGG-ATT- ----A-GGTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AAATGCCTA CCA-----AG
Thermus.therm -CCG---C-- --TT---C-C GGAT---GGG CCC-GCG--- -TCCC-ATC- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AATGGCCCA CCA-----AG
Thermotoga.marit -CCG---C-- --CG---G-A GGAG---GGG CCC-GCG--- -GCCC-ATC- ----A-GGTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AACGGCCCA CCA-----AG
Zea.mays.CP -CCG---C-- --CC---A-A GGAG---GGG CTC-GCG--- -TCTG-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TG-AGGC--- -AATAGCTTA CCA-----AG
Chlamydomo.reinh.CP -CCGC--C-- --NG---A-T AGAG---GGG CTT-GCG--- -TCTG-ATT- ----A-GCTA ----GTTGG- TGGGGGT--- -AACGGCCTC CCA-----AG
Euglena.graci.CP -TCG---C-- --CT---A-G GCAT---GAG CTT-GCA--- -TCTG-ATT- ----A-GCTT ----GTTGG- TG-AGGT--- -AAAGGCTTA CCA-----AG
Desulfuroc.mobil -ACCG--C-- --CC---G-A GGAT---GGG GCT-ACG--- -GCCC-ATT- ----A-GGTT ----GTTGG- CG-GGGT--- -AACGGCCCG CCA-----AG
Sulfolobus.acido -GCCG--C-- --CC---G-A GGAT---GGG GCT-ACG--- -GCCC-ATC- ----A-GGCT ----GTCGG- TG-GGGT--- -AAAGGCCCA CCG-----AA
Thermofilu.pende -GCCG--C-- --CC---G-A GGAT---GGG GCT-GCG--- -CCCT-ATC- ----A-GGTA ----GTTGG- CG-GGGT--- -AACGGCCCG CCA-----AG
Thermoprot.tenax -TCCG--C-- --CC---G-A GGGT---GGG GGT-ACG--- -GCCC-ATC- ----A-GGTT ----GTTGG- CG-GGGT--- -AACGGCCCG CCA-----AG
Halobacter.halob -GCG---C-- --CA---C-A GGAT---GCG GCT-GCG--- -GTCG-ATT- ----A-GGTA ----GACGG- TG-GGGT--- -AACGGCCCA CCG-----TG
Halobacter.maris -GCG---C-- --TG---T-A GGAT---GTG GCT-GCG--- -GCCG-ATT- ----A-GGTA ----GATGG- TG-GGGT--- -AACGGCCCA CCA-----TG
Halococcus.morrh -CCG---C-- --CG---G-A GGAC---GTG ACT-GCG--- -GCCG-ATT- ----A-GGTA ----GACGG- TG-GGGT--- -AACGGCCCA CCG-----TG
Natronobac.magad -GCG---C-- --CA---T-A GGAT---GTG GCC-G----- -GCCG-ATT- ----A-GGTA ----GACGG- TG-GGGT--- -AACGGCCCA CCG-----TG
Methanococ.janna -GCTG--C-- --CC---G-A NNAT---GGG GCT-GCG--- -GCGG-ATT- ----A-GGTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AACGGCCCA CCA-----AG
Methanococ.vanni --GCG--C-- --CC---G-A GGAT---AGG ACT-GCG--- -CTCG-ATT- ----A-GGTA ----GTTGG- TG-GGGT--- -AATGGCCCA CCA-----AG
Xenopus.laevi -ACG------ --AT---A-C ATTC---GGA TGT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-CTTT--- -CTGCGCCTA CCA-----TG
Homo.sapie -ACG------ --AC---C-C ATTC---GAA CGT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GTCG--- -CCGTGCCTA CCA-----TG
Candida.albic -ATG------ --GT---T-C ATTC---AAA TTT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGTGGCCTA CCA-----TG
Saccharomy.cerev -ATG------ --GT---T-C ATTC---AAA TTT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGTGGCCTA CCA-----TG
Schizosacc.pombe -ATG------ --GT---T-C ATTC---AAA TTT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGAGGCCTA CCA-----TG
Oryza.sativ -ACG------ --CA---T-C ATTC---AAA TTT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGGGGCCTA CCA-----TG
Arabidopsi.thali -ACG------ --CA---T-C ATTC---AAA TTT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGTGGCCTA CCA-----TG
Fragaria.anana -ACG------ --CA---T-C ATTC---AAA TAT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGTGGCCTA CCA-----TG
Chlorella.ellip -ATG------ --TT---T-C ATTC---AAA TTT-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-ACTT TC--GATGG- TA-GGAT--- -AGAGGCCTA CCA-----TG
Euglena.graci CACT---T-- --GA---T-C GCAA---GAG CTT-CTG--- -ACCT-ATC- ----A-GCTT ----GACTG- TG-GTGT--- -ATCGGACCA CAG-----TG
Entamoeba.histo AGTA------ --AC---C-A ATGA---GAA TTT-CTG--- -ATCT-ATC- ----A-ATCA ----GTTGG- TA-GTAT--- -CGAGGACTA CCA-----AG
Giardia.intes -GCGA-CG-- --GC---C-C GCCC---GGG CTT-CCG--- -GGGC-ATC- ----A-CCCG ----GTCGG- CG-CGGT--- -CGCGGCGCG CCG-----AG
Trypanosom.bruce -GCGT--C-- --TA---C-T GAC----GAA CAA-CTG--- -CCCT-ATC- ----A-GCCA GT--GATGG- CC-GTGT--- -AGTGGACTG CCA-----TG
*****
1401
Mycobacter.lepra GC-G--ACGA -CGGGT---- ---------A GCCG-GCCT- GAGA--GGGT ---------- ---------- GTCC-GG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAT-A
Streptomyc.grise GC-G--ACGA -CGGGT---- ---------A GCCG-GCCT- GAGA--GGGC ---------- ---------- GACC-GG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Bacillus.subti GC-G--ACGA -TGCGT---- ---------A GCCG-ACCT- GAGA--GGGT ---------- ---------- GATC-GG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Lactobacil.delbr GC-A--ATGA -TGCGT---- ---------A GCCG-AGTT- GAGA--GACT ---------- ---------- GATC-GG-CC AC-ATTGGGA C-TGAGAC-A
Leuconosto.mesen AC-A--ATGA -TGCAT---- ---------A GCCG-AGTT- GAGA--GACT ---------- ---------- GATC-GG-CC AC-ATTGGGA C-TGAGAC-A
Staphyloco.aureu GC-A--ACGA -TACGT---- ---------A GCCG-ACCT- GAGA--GGGT ---------- ---------- GATC-GG-CC AC-ACTGGAA C-TGAGAC-A
Bartonella.bacil GC-G--ACGA -TCCAT---- ---------A GCTG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GATC-AG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Rhodopseud.palus GC-G--ACGA -TCAGT---- ---------A GCTG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GATC-AG-CC AC-ATTGGGA C-TGAGAC-A
Rickettsia.ricke CC-G--ACGA -TCTGT---- ---------A GCTG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GATC-AG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Bordetella.bronc GC-G--ACGA -TCCGT---- ---------A GCTG-GTTT- GAGA--GGAC ---------- ---------- GACC-AG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Escherichi.coli GC-G--ACGA -TCCCT---- ---------A GCTG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GACC-AG-CC AC-ACTGGAA C-TGAGAC-A
Haemophilu.influ CC-T--GCGA -TCTCT---- ---------A GCTG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GACC-AG-CC AC-ACTGGAA C-TGAGAC-A
Thermus.therm GC-G--ACGA -CGGGT---- ---------A GCCG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GGCC-GG-CC AC-AGGGGCA C-TGAGAC-A
Thermotoga.marit CC-G--ACGA -CGGGT---- ---------A GCCG-GCCT- GAGA--GGGT ---------- ---------- GGTC-GG-CC AC-AGGGGCA C-TGAGAC-A
Zea.mays.CP GC-G--ATGA -TCAGT---- ---------A GCTG-GTCC- GAGA--GGAT ---------- ---------- GATC-AG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Chlamydomo.reinh.CP GC-C--ACGA -GCAGT---- ---------A GCTG-GTCT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GATC-AG-CC AC-ACTGGGA C-TGAGAC-A
Euglena.graci.CP GC-G--ACGA -TCAGT---- ---------A GCTG-ATTT- GAGA--GGAT ---------- ---------- GATC-AG-CC AC-ACTGGGA T-TGAGA--A
Desulfuroc.mobil CC-G--ATAA -TGGGT---- ---------A GGGG-CCGT- GAGA--GCGG ---------- ---------- GAGC-CC-CC AG-ATGGGCA C-TGAGAC-A
Sulfolobus.acido CC-T--ATAA -CGGGT---- ---------A GGGG-CCGT- GGAA--GCGG ---------- ---------- GAGC-CT-CC AG-TTGGGCA C-TGAGAC-A
Thermofilu.pende CC-G--ATAA -CGGGT---- ---------G GGGG-CCGT- GAGA--GCGG ---------- ---------- GAGC-CC-CG AG-ATGGGCA C-TGAGAC-A
Thermoprot.tenax CC-G--AAGA -CGGGT---- ---------A GGGG-CGGT- GAGA--GCCG T--------- ---------- GAGC-CC-CG AG-ATGGGCA C-TGAGAC-A
Halobacter.halob CC-C--ATAA -TCGGT---- ---------A CGGG-TTGT- GAGA--GCAA ---------- ---------- GAGC-CC-GG AG-ACGGAAT C-TGAGAC-A
Halobacter.maris CC-G--ATAA -TCGGT---- ---------A CGGG-TTGT- GAGA--GCAA ---------- ---------- GAAC-CT-GG AG-ACGGTAT C-TGAGAC-A
Halococcus.morrh CC-G--ATAA -TCGGT---- ---------A CGGG-TTGT- GAGA--GCAA ---------- ---------- GAAC-CC-GG AG-ACGGTAT C-TGAGAC-A
Natronobac.magad CC-G--ATAA -TCGGT---- ---------A CGGG-TTGT- GAGA--GCAA ---------- ---------- GAGC-CC-GG AG-ACGGTAT C-TGAGAC-A
Methanococ.janna CC-T--ACGA -TCCGT---- ---------A CGGG-CCCT- GAGA--GGGG ---------- ---------- GAGC-CC-GG AG-ATGGACA C-TGAGAC-A
Methanococ.vanni CC-T--ACGA -TCGAT---- ---------A CGGG-CCTT- GAGA--GAGG ---------- ---------- GAGC-CC-GG AG-ATGGGGA C-TGAGAC-A
Xenopus.laevi GT-G--ACCA -CGGGT---- --------AA CGGG-GAAT- CAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Homo.sapie GT-G--ACCA -CGGGT---- --------GA CGGG-GAAT- CAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Candida.albic GT-T--TCAA -CGGGT---- --------AA CGGG-GAAT- AAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Saccharomy.cerev GT-T--TCAA -CGGGT---- --------AA CGGG-GAAT- AAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Schizosacc.pombe GT-T--TTAA -CGGGT---- --------AA CGGG-GAAT- TAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Oryza.sativ GT-G--GTGA -CGGGT---- --------GA CGGA-GAAT- TAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Arabidopsi.thali GT-G--GTAA -CGGGT---- --------GA CGGA-GAAT- TAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Fragaria.anana GT-G--GTGA -CGGGT---- --------GA CGGA-GAAT- TAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Chlorella.ellip GT-G--GTAA -CGGGT---- --------GA CGGA-GGAT- TAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
Euglena.graci GC-C--TTGA -CGGGT---- --------AA CGGA-GAAT- CAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAG-A
Entamoeba.histo AT-T--ATAA -CGGAT---- --------AA CGAG-GAAT- TGGG--GTTC ---------- ---------- GACA-TC-GG AG-AGGGAGC T-TTACAG-A
Giardia.intes GG-C--CCGA -CGCCT---- --------GG CGGA-GAAT- CAGG--GTTC ---------- ---------- GACT-CC-GG AG-AGCGGGC C-TGCGAG-A
Trypanosom.bruce GC-G--TTGA -CGGGA---- ---------G CGGG-GGAT- TAGG--GTTC ---------- ---------- GATT-CC-GG AG-AGGGAGC C-TGAGAA-A
*****************************
1501
Mycobacter.lepra CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGCAC- AATGG--GCG CA----A--- ---GCC-TGA --TGCAG-CG
Streptomyc.grise CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGCAC- AATGG--GCG AA----A--- ---GCC-TGA --TGCAG-CG
Bacillus.subti CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TA---GGGAA TC-TTCCGC- AATGG--ACG AA----A--- ---GTC-TGA --CGGAG-CA
Lactobacil.delbr CGGCCNNAA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TA---GGGAA TC-TTCCAC- AATGG--ACG CA----A--- ---GTC-TGA --TGGAG-CA
Leuconosto.mesen CGGCCCAAA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-TGC-A-G TA---GGGAA TC-TTCCAC- AATGG--GCG AA----A--- ---GCC-TGA --TGGAG-CA
Staphyloco.aureu CGGTCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TA---GGGAA TC-TTCCGC- AATGG--GCG AA----A--- ---GCC-TGA --CGGAG-CA
Bartonella.bacil CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGGAC- AATGG--GGG CA----A--- ---CCC-TGA --TCCAG-CC
Rhodopseud.palus CGGCCCAAA- CTGCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGGAC- AATGG--GCG AA----A--- ---GCC-TGA --TCCAG-CC
Rickettsia.ricke CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGGAC- AATGG--GCG AA----A--- ---GCC-TGA --TCCAG-CA
Bordetella.bronc CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TT-TTGGAC- AATGG--GGG CA----A--- ---CCC-TGA --TCCAG-CC
Escherichi.coli CGGTCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGCAC- AATGG--GCG CA----A--- ---GCC-TGA --TGCAG-CC
Haemophilu.influ CGGTCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TA-TTGCGC- NATGG--GGG GA----A--- ---CCC-TGA --CGCAG-CC
Thermus.therm CGGGCCCCA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TT---AGGAA TC-TTCCGC- AATGG--GCG CA----A--- ---GCC-TGA --CGGAG-CG
Thermotoga.marit CGGGCCCCA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TC-TTGGAC- AATGG--GGG AA----A--- ---CCC-TGA --TCCAG-CG
Zea.mays.CP CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---GGGAA TT-TTCCGC- AATGG--GCG AA----A--- ---GCC-TGA --CGGAG-CA
Chlamydomo.reinh.CP CGGCCCAGA- CTCCTAC--- ---GG-G-AG GC-AGC-A-G TG---AGGAA TT-TTTCGC- AATGG--GCG CA----A--- ---GC---GA --CGGAG-CA
Euglena.graci.CP CGGAACAGA- CTTCTAC--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G TG---AGGAA TT-TTCCGC- AATGG--GCG CA----A--- ---GCC-TGA --CGGAG-CA
Desulfuroc.mobil AGGGCCCAG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-ACC-A-G GC---GCGAA AC-CTCCGC- AATGC--GGG AA----A--- ---CCG-TGA --CGGGG-CC
Sulfolobus.acido AGGGCCCAG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-ACC-A-G GC---GCGAA AC-GTCCCC- AATGC--GCG AA----A--- ---GCG-TGA --GGGCG-CT
Thermofilu.pende AGGGCCCAG- GCCCTAC--- ---GG-G-GT GC-ACC-A-G GG---GCGAA AC-TTCCGC- AATGC--GGG AA----A--- ---CCG-TGA --CGGAG-TC
Thermoprot.tenax AGGGCCCAG- GCCCTAC--- ---GG-G-GT GC-AGC-A-G GC---GCGAA TA-CTCCGC- AATGC--GGG CA----A--- ---CCG-CGA --CGGGG-CC
Halobacter.halob AGATTCCGG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-AGC-A-G GC---GCGAA AC-CTTTAC- ACTGT--ACG AA----A--- ---GTG-CGA --TAAGG-GG
Halobacter.maris AGATACCGG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-AGC-A-G GC---GCGAA AC-CTTTAC- ACTGC--ACG AC----A--- ---GTG-CGA --TAGGG-GG
Halococcus.morrh AGATACCGG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-AGC-A-G GC---GCGAA AC-CTTTAC- ACTGC--ACG CC----A--- ---GTG-CGA --TAAGG-GG
Natronobac.magad AGATACCGG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-AGC-A-G GC---GCGAA AC-CTTTAC- ACTGC--ACG CC----A--- ---GTG-CGA --TAAGG-GG
Methanococ.janna CGGGTCCAG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-AGC-A-G GC---GCGAA AC-CTCCGC- AATGC--GCG AA----A--- ---GCG-CGA --CGGGG-GG
Methanococ.vanni CGGCCCCAG- GCCCTAC--- ---GG-G-GC GC-AGC-A-G GC---GCGAA AC-CTCCGC- AATGC--ACG AA----A--- ---GTG-CGA --CGGGG-GG
Xenopus.laevi CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- ACTCC--CGA CG-------- ---CGG-GGA --GGTAG-TG
Homo.sapie CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- ACTCC--CGA CC-------- ---CGG-GGA --GGTAG-TG
Candida.albic CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--CGA TT-----C-- ---AGG-GGA --GGTAG-TG
Saccharomy.cerev CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--TAA TT-------- ---CAG-GGA --GGTAG-TG
Schizosacc.pombe CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--CGA CA-------- ---CGG-GGA --GGTAG-TG
Oryza.sativ CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--TGA CA-------- ---CGG-GGA --GGTAG-TG
Arabidopsi.thali CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--TGA CA-------- ---CGG-GGA --GGTAG-TG
Fragaria.anana CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--TGA CA-------- ---CGG-GGA --GGTAG-TG
Chlorella.ellip CGGCTACCA- CATCCAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTACCC- AATCC--TGA CA-------- ---CAG-GGA --GGTAG-TG
Euglena.graci CGGCTACCA- CTACCAA--- ---GG-T-GG GC-AGC-A-G GC---ACGCA AA-TTGCCC- CATGC--AAA GACAGT---- ---CTG-TGA --GGCAG-CG
Entamoeba.histo TGGCTACCA- CTTCTAA--- ---GG-A-AG GC-AGC-A-G GC---GCGTA AA-TTACCC- ACTTT--CGA AT-------- ---TGA-AGA --GGTAG-TG
Giardia.intes CGGCCCGCA- CATCCAA--- ---GG-A-CG GC-AGC-A-G GC---GCGGA AC-TTGCCC- AATGC--GCG GC-------- ---GCG-CGA --GGCAG-CG
Trypanosom.bruce TAGCTACCA- CTTCTAC--- ---GG-A-GG GC-AGC-A-G GC---GCGCA AA-TTGCCC- AATGT--CGA AAAAATA--- ---CGA-TGA --GGCAG-CG
*********************************************************************** ******************
1601
Mycobacter.lepra A-CGCCG-CG T--------- GGG--G--GA T-GACG-GCC ---------- -------TTC G--------- -------GGT -T-G-TA--A ACCTC-----
Streptomyc.grise A-CGCCG-CG T--------- GAG--G--GA T-GACG-GCC ---------- -------TTC G--------- -------GGT -T-G-TA--A ACCTC-----
Bacillus.subti A-CGCCG-CG T--------- GAG--T--GA T-GAAG-GTT ---------- -------TTC G--------- -------GAT -C-G-TA--A AGCTC-----
Lactobacil.delbr A-CGCCG-CG T--------- GAG--T--GA A-GAAG-GTC ---------- -------TTC G--------- -------GAT -C-G-TA--A AGCTC-----
Leuconosto.mesen A-CGCCG-CG T--------- GTG--T--GA T-GAAG-GCT ---------- -------TTC G--------- -------GGT -C-G-TA--A AGCAC-----
Staphyloco.aureu A-CGCCG-CG T--------- GAG--T--GA T-GAAG-GTC ---------- -------TTC G--------- -------GAT -C-G-TA--A AACTC-----
Bartonella.bacil A-TGCCG-CG T--------- GAG--T--GA T-GAAG-GCC ---------- -------TTA G--------- -------GGT -T-G-TA--A AGCTC-----
Rhodopseud.palus A-TGCCG-CG T--------- GAG--T--GA T-GAAG-GCC ---------- -------CTA G--------- -------GGT -T-G-TA--A AGCTC-----
Rickettsia.ricke A-TACCG-AG T--------- GAG--T--GA T-GAAG-GCC ---------- -------TTA G--------- -------GGT -T-G-TA--A AGCTC-----
Bordetella.bronc A-TCCCG-CG T--------- GTG--C--GA T-GAAG-GCC ---------- -------TTC G--------- -------GGT -T-G-TA--A AGCAC-----
Escherichi.coli A-TGCCG-CG T--------- GTA--T--GA A-GAAG-GCC ---------- -------TTC G--------- -------GGT -T-G-TA--A AGTAC-----
Haemophilu.influ A-TGCCG-CG T--------- GAA--T--GA A-GAAG-GCC ---------- -------TTC G--------- -------GGT -T-G-TA--A AGTTC-----
Thermus.therm A-CGCCG-CT T--------- GGA--G--GA A-GAAG-CCC ---------- -------TTC G--------- -------GGG -T-G-TA--A ACTCC-----
Thermotoga.marit A-CGCCG-CG T--------- GCG--G--GA C-GAAG-CCC ---------- -------TTC G--------- -------GGG -T-G-TA--A ACCGC-----
Zea.mays.CP A-TGCCG-CG T--------- GGA--G--GT G-GAAG-GCC ---------- -------TAC G--------- -------GGT -C-G-TC--A ACTTC-----
Chlamydomo.reinh.CP A-TGCCG-CG T--------- GCA--G--GA A-GAAG-GCC ---------- -------TGT G--------- -------GGT -C-G-TA--A ACTGC-----
Euglena.graci.CP A-TACCG-CG T--------- GAA--G--GA A-GACG-GCC ---------- -------TTT G--------- -------GGT -T-G-AA--A ACCTC-----
Desulfuroc.mobil A-CCCCG-AG T--------- GCC------- -------CCC ---------- -------TTA C--------- -------GGG ---------- --GGC-----
Sulfolobus.acido A-CCCCG-AG T--------- GCC------- -------TCC ---------- -------GCA A--------- -------GGA ---------- --GGC-----
Thermofilu.pende A-CCCCG-AG T--------- GCC------- -----A-CCC ---------- -------GAA GA-------- -------GGG -T-------- --GGC-----
Thermoprot.tenax A-CCCCG-AG T--------- GCC------- -----G-GGC ---------- -------GAA GA-------- -------GCC -C-------- --GGC-----
Halobacter.halob A-CTCCG-AG T--------- GTG------- ----AA-GGC ---------- -------ATA GA-------- -------GCC -TT------- --CAC-----
Halobacter.maris A-CTCCG-AG T--------- GTG------- ----AG-GGC ---------- -------ATA TA-------- -------GCC -CT------- --CGC-----
Halococcus.morrh A-CCCCG-AG T--------- GCG------- ----AG-GGC ---------- -------ATA CA-------- -------GTC -CT------- --CGC-----
Natronobac.magad A-CTCCA-AG T--------- GCG------- ----AG-GGC ---------- -------ATA TA-------- -------GTC -CT------- --CGC-----
Methanococ.janna A-CCCCG-AG T--------- GCC------- ----CA-CGC ---------- -------CCT ---------- -------GCG -TG------- --GGC-----
Methanococ.vanni A-CCCCA-AG T--------- GCT------- ----CA-TGC ---------- -------ACA ---------- -------GCA -TG------- --GGC-----
Xenopus.laevi A-CGAAA-AA T-------AA CAA--T--AC A-G-GA-CTC ---------- -------TTT C--------- -------GAG GCCC-TG--T AATTGG----
Homo.sapie A-CGAAA-AA T-------AA CAA--T--AC A-G-GA-CTC ---------- -------TTT C--------- -------GAG GCCC-TG--T AATTGG----
Candida.albic A-CAATA-AA T-------AA CGA--T--AC A-G-GG-CCC ---------- -------TTT T--------- -------GGG -TCT-TG--T AATTGG----
Saccharomy.cerev A-CAATA-AA T-------AA CGA--T--AC A-G-GG-CCC ---------- -------ATT C--------- -------GGG -TCT-TG--T AATTGG----
Schizosacc.pombe A-CAAGA-AA T-------AA CAA--T--GC A-G-GG-CCC ---------- -------TTT C--------- -------GGG -TCT-TG--T AATTGG----
Oryza.sativ A-CAATA-AA T-------AA CAA--T--AC C-G-GG-CGC ---------- -------TTT A--------- -------GTG -TCT-GG--T AATTGG----
Arabidopsi.thali A-CAATA-AA T-------AA CAA--T--AC C-G-GG-CTC ---------- -------TTT C--------- -------GAG -TCT-GG--T AATTGG----
Fragaria.anana A-CAATA-AA T-------AA CAA--T--AC C-G-GG-CTC ---------- -------TTT ---------- -------GAG -TCT-GG--T AATTGG----
Chlorella.ellip A-CAATA-AA T-------AA CAA--T--AC C-G-GG-CTT ---------- --------TT C--------- -------AAG -TCT-GG--T AATTGG----
Euglena.graci A-CGAAC-AG T-------AG CAA--C--CC C-G-TC-GGC ---------- ------CTTA CGT------- -------GCC -GAT-GG--G GCTTGG----
Entamoeba.histo A-CGACA-CA T-------AA CTC--T--AG A-G-TT-GA- ---------- -------GTA AA-------- -------ATC -AAT-TC--T TGAAGG----
Giardia.intes A-CGGGG-AG ---------- CGC------- ---------- ---------- -------GCG A--------- ---------- ---------- --GCGA----
Trypanosom.bruce A-AAAGA-AA T--------A GAGC-C--GA C-C-GT-GC- ---------- ------CCTA GT-------- ---------G -CAT-GGT-T GTTTTC----
*
1701
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- --------TT TCAC-CATCG -AC--GAA-G GTC---TGGG TT-------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- --------TT TCAG-CAGGG -AA--GAA-G CG-------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- --------TG TTGT-TAGGG -AA--GAA-C AAG---TGCC GTTCGAAT-- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- --------TG TTGT-TGGTG -AA--GAA-G GAT---AGAG GCAGTAAC-- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- --------TG TTGT-ATGGG -AA--GAA-C AGC---TAGA ATAGGAAA-- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- --------TG TTAT-TAGGG -AA--GAA-C ATA---TGTG TAAGTAAC-- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- --------TT TCAC-CGGTG -AA--GAT-A A--------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- --------TT TTGT-GCGGG -AA--GAT-A A--------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- --------TT TTAG-CAAGG -AA--GAT-A A--------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- --------TT TTGG-CAGGA -AA--GAA-A CGG---CACG GGCTAAT--- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- --------TT TCAG-CGGGG -AG--GAA-G GGA---GTAA AGTTAAT--- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- --------TT TCGG-TATTG -AG--GAA-G GTT---GATG TGTTAAT--- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------T GAAC-CCGGG -AC--GAA-A CCC---CCGA GGA------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- --------TG TGGC-GGGGG -AA--GAA-T AAG---GTAG GGAGGAA--- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- --------TT TTCT-CGGAG -AA--GAA-A CA-------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- --------TT TTCT-CAGAG -AA--GAA-G TT-------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- --------TT TTCT-CAAAG -AA--GAA-G AA-------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- --------TT TTCC-CCGCT -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- --------TT TTCC-CCGCT -CT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- --------TT TTGC-CCGGT -CT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- --------TT TTGC-CCGGT -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- --------TT TTGT-ACACC -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- --------TT TTCT-GTACC -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- --------TT TTCG-TGACC -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- --------TT TTTG-CGACC -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- --------TT TTCC-GGAGT -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- --------TT TTAT-CAAGT -GT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACACT -TT--AAA-T C--------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-CCACT -TT--AAA-T C--------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -GT--AAA-T A--------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -GT--AAA-T A--------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -GT--AAA-T A--------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -CT--AAA-T C--------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -CT--AAA-T C--------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -CT--AAA-T C--------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-ACAAT -CT--AAA-T C--------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- -------AAT GGAC-GCTAT -CC--AAA-G A--------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- -------AAT GAGT-AGGAG -GT--AAA-T T--------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- --GG-CGGG- -----CCC-A C--------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- -------AAT GGGG-GATAC -TC--AAA-C C--------- ---------- ---------- ----------
1801
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---TTCTCGG ATT-GACGGT
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------AG AGT-GACGGT
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AGGGCGGTAC CTT-GACGGT
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TGGTCTTTA TTT-GACGGT
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TGATTTTAG TTT-GACGGT
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TGTGCACAT CTT-GACGGT
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --T-GACGGT
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --T-GACGGT
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --T-GACGTT
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATCCTGTGCA ACT-GACGGT
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ACCTTTGCTC ATT-GACGTT
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AGCACATCAA ATT-GACGTT
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GGGG ACT-GACGGT
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATGCCCTACC GAT-GACGGT
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -AT-GACGGT
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -CT-GACGGT
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -AT-GACGGT
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AGGAA
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAAAA
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAAAA
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAGGA
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAGGT
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAGGT
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAGAA
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAGGT
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAACA
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----AAACA
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CT
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CT
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CC
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CA
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------CT
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CATCC
1901
Mycobacter.lepra -AG-GTGGA- G-AA--GAAG CAC------- --C--GG-C- CAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GGT-GCGA
Streptomyc.grise -AC-CTGCA- G-AA--GAAG CGC------- --C--GG-C- TAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GGC-GCAA
Bacillus.subti -AC-CTAAC- C-AG--AAAG CCA------- --C--GG-C- TAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GTG-GCAA
Lactobacil.delbr -AA-TCAAC- C-AG--AAAG TCA------- --C--GG-C- TAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GTG-GCAA
Leuconosto.mesen -AC-CATAC- C-AG--AAAG GGA------- --C--GG-C- TAA---A-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA T-GTC-CCGA
Staphyloco.aureu -AC-CTAAT- C-AG--AAAG CCA------- --C--GG-C- TAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GTG-GCAA
Bartonella.bacil -AG-CCGGA- G-AA--GAAG CCC------- --C--GG-C- TAA---C-T- TCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GAA G-GGG-GCTA
Rhodopseud.palus -AC-CGCAA- G-AA--TAAG CCC------- --C--GG-C- TAA---C-T- TCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GAA G-GGG-GCTA
Rickettsia.ricke -AC-TTGCA- G-AA--AAAG CCC------- --C--GG-C- TAA---C-T- CCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAG --AC---GGA G-GGG-GCTA
Bordetella.bronc -AC-CTGCA- G-AA--TAAG CAC------- --C--GG-C- TAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GGT-GCAA
Escherichi.coli -AC-CCGCA- G-AA--GAAG CAC------- --C--GG-C- TAA---C-T- CCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GGA G-GGT-GCAA
Haemophilu.influ -AA-ATACA- G-AA--GAAG CAC------- --C--GG-C- TAA---C-T- CCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GGA G-NGT-GCGA
Thermus.therm -AC-CGGGG- T-AA---TAG CGC------- --C--GG-C- CAA---C-T- CCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GGA G-GGC-GCGA
Thermotoga.marit -AC-CCCGC- T-AG--AAAG CCC------- --C--GG-C- TAA---C-T- ACGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GTA G-GGG-GCAA
Zea.mays.CP -AT-CTGAG- G-AA--TAAG CAT------- --C--GG-C- TAA---C-T- CTGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAG --AC---AGA G-GAT-GCAA
Chlamydomo.reinh.CP -AT-CTGAG- G-AA--TAAG CAC------- --C--GG-C- TAA---C-T- CTGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---AGA G-GGT-GCAA
Euglena.graci.CP -AT-TTGAG- G-AA--TAAG CAT------- --C--GG-C- TAA---T-T- CCGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---GGG A-GAT-GCGA
Desulfuroc.mobil -GG-CGGGG- G-AA--TAAG CGG------- --GG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GTCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CAG C-CCC-GCGA
Sulfolobus.acido -GG-CGGGG- G-AA--TAAG CGG------- --GG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GTCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CAG C-TCC-GCGA
Thermofilu.pende -GC-CGGGC- G-AA--TAAG CGG------- --GG-GG-C- AAG---C-T- TGGT--GTCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CAA C-CCC-GCGA
Thermoprot.tenax -GC-CGGGC- G-AA--TAAG CGG------- --GG-GG-T- AAG---T-C- TGGT--GTCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CAG C-CCC-GCGA
Halobacter.halob -GG-TGCAC- G-AA--TAAG GAC------- --TG-GG-C- AAG---A-C- CGGT--GCCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CGG C-AGT-CCGA
Halobacter.maris -GG-TACAG- G-AA--CAAG GAC------- --TG-GG-C- AAG---A-C- CGGT--GCCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CGG C-AGT-CCGA
Halococcus.morrh -GG-TCTCA- G-AA--TAAG AGC------- --TG-GG-C- AAG---A-C- CGGT--GCCA GC---CGCCG CGG---TAAT --AC---CGG C-AGC-TCGA
Natronobac.magad TGG-TCGCG- G-AA--TAAG TGC------- --TG-GG-C- AAG---A-C- CGGT---CCA GC---CGCCG CGG---TAA- --AC---CGG C-AGC-ACGA
Methanococ.janna -GC-TCCGG- G-AA--TAAG GGC------- --TG-GG-C- AAG---T-C- CGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---CGG C-GGC-CCAA
Methanococ.vanni -GC-TTGAG- G-AA--TAAG GGC------- --TG-GG-C- AAG---T-T- CGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --AC---CGA C-GGC-CCGA
Xenopus.laevi TTA-ACGAG- G-AT--CTAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Homo.sapie TTA-ACGAG- G-AT--CCAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Candida.albic TTA-ACGAG- G-AA--CAAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AAAA
Saccharomy.cerev TTA-ACGAG- G-AA--CAAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Schizosacc.pombe TTA-ACGAG- G-AA--CAAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Oryza.sativ TTA-ACGAG- G-AT--CCAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Arabidopsi.thali TTA-ACGAG- G-AT--CCAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Fragaria.anana TTA-ACGAG- G-AT--CCAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Chlorella.ellip TTA-ACGAG- G-AT--CAAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Euglena.graci GCC-GTGAG- T-AT--CAAC CGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCTG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-GAGG
Entamoeba.histo CCT-ACGA-- A-AT--CAAT TGG------- --AG-GG-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AATA
Giardia.intes GCC-CCCGC- C-GC--GGAG CCG------- --AG-GG-C- AAGG--T-C- TGGT--GCCA GC---AGCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCG-GCGA
Trypanosom.bruce AATATCGAG- T-AA--CAAT TGG------- --AG-GA-C- AAG---T-C- TGGT--GCCA GC---ACCCG CGG---TAAT --TC---CAG C-TCC-AAAA
************************************************************ *
2001
Mycobacter.lepra G-CGTTGTCC GGAA-TTA-- CTGGG-CGTA ----AAGAGC T-CGTAG-G- TG-------- ------GTTT G-TCGCGTT- GTTCGTG-A- AATCTCACGG
Streptomyc.grise G-CGTTGTCC GGAA-TTA-- TTGGG-CGTA ----AAGAGC T-CGTAG-G- CG-------- ------GCTT G-TCACGTC- GGATGTG-A- AAGCCCGGGG
Bacillus.subti G-CGTTGTCC GGAA-TTA-- TTGGG-CGTA ----AAGGGC T-CGCAG-G- CG-------- ------GTTT C-TTAAGTC- TGATGTG-A- AAGCCCCCGG
Lactobacil.delbr G-CGTTGTCC GGAT-TTA-- TTGGG-CGTA ----AAGCGA G-CGCAG-G- CG-------- ------GAAT G-ATAAGTC- TGATGTG-A- AAGCCNACGG
Leuconosto.mesen G-CGTTATCC GGAT-TTA-- TTGGG-CGTA ----AAGCGA G-CGCAG-A- CG-------- ------GTTT A-TTAAGTC- TGATGTG-A- AAGCCCGGAG
Staphyloco.aureu G-CGTTATCC GGAA-TTA-- TTGGG-CGTA ----AAGCGC G-CGTAG-G- CG-------- ------GTTT T-TTAAGTC- TGATGTG-A- AAGCCCACGG
Bartonella.bacil G-CGTTGTTC GGAT-TTA-- CTGGG-CGTA ----AAGCGC A-TGTAG-G- CG-------- ------GATA T-TTAAGTC- AGAGGTG-A- AATCCCAGGG
Rhodopseud.palus G-CGTTGCTC GGAA-TCA-- CTGGG-CGTA ----AAGGGT G-CGTAG-G- CG-------- ------GGTC T-TTAAGTC- AGAGGTG-A- AAGCCTGGAG
Rickettsia.ricke G-CGTTGTTC GGAA-TTA-- CTGGG-CGTA ----AAGAGT G-CGTAG-G- CG-------- ------GTTT A-GTAAGTT- GGAAGTG-A- AAGCCCGGGG
Bordetella.bronc G-CGTTAATC GGAA-TTA-- CTGGG-CGTA ----AAGCGT G-CGCAG-G- CG-------- ------GTTC G-GAAAGAA- AGATGTG-A- AATCCCAGGG
Escherichi.coli G-CGTTAATC GGAA-TTA-- CTGGG-CGTA ----AAGCGC A-CGCAG-G- CG-------- ------GTTT G-TTAAGTC- AGATGTG-A- AATCCCCGGG
Haemophilu.influ G-CGTTAATC GGAA-TAA-- CTGGG-CGTA ----AAGGGC A-CGCAG-G- CG-------- ------GTTA T-TTAAGTG- AGGTGTG-A- AAGCCCCGGG
Thermus.therm G-CGTTACCC GGAT-TCA-- CTGGG-CGTA ----AAGGGC G-TGTAG-G- CG-------- ------GCCT G-GGGCGTC- CCATGTG-A- AAGACCACGG
Thermotoga.marit G-CGTTACCC GGAT-TTA-- CTGGG-CGTA ----AAGGGG G-CGTAG-G- CG-------- ------GCCT G-GTGTGTC- GGATGTG-A- AATCCCACGG
Zea.mays.CP G-CGTTATCC GGAA-TGA-- TTGGG-CGTA ----AAGCGT C-TGTAG-G- TG-------- ------GCTT T-TCAAGTC- CGCCGTC-A- AATCCCAGGG
Chlamydomo.reinh.CP G-CGTTGTCC GCAA-TGA-- TTGGG-CGTA ----AAGCGT C-TGTAG-G- TG-------- ------GCTC G-TAAAGTC- TAATGTC-A- AATACCAGGG
Euglena.graci.CP G-CGTTATCC GGAA-TTA-- TTGGG-CGTA ----AAGAGT T-TGTAG-G- CG-------- ------GTCA A-GTGTGTT- TAATGTT-A- AAAGTCAAAG
Desulfuroc.mobil G-TGGTCGGG ACGA-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGC C-CGTAG-C- CG-------- ------GCCC G-GCAAGTC- CCCTCCT-A- AATTCCCGGG
Sulfolobus.acido G-TGGTCGGG GTGA-TTA-- CTGGG-CCTA ----AAGCGC C-TGTAG-C- CG-------- ------GCCC A-CCAAGTC- GCCCCTT-A- AAGTCCCCGG
Thermofilu.pende G-TGGTCGGG ACGT-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- CG-------- ------GCCC G-GTAAGTC- CCTCCTT-A- AAGCCCACGG
Thermoprot.tenax G-TGGTCAGG GTGA-TTA-- CTGGG-CTTA ----AAGCGC C-CGTAG-C- CG-------- ------GCCC G-GCAAGTC- GCTCCTG-A- AATCCCCAGG
Halobacter.halob G-TGATGGCC GATC-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- TG-------- ------GCTG A-ACAAGTC- CGTTGGG-A- AATCTGTCCG
Halobacter.maris G-TGATGGCC GATA-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- CG-------- ------GCCG A-ACAAGTC- CGTTGGG-A- AATCGACGCG
Halococcus.morrh G-TGATAGCC ACTA-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- CG-------- ------GCCG A-ACAGGTC- CGTCGGG-A- AATCCACCCG
Natronobac.magad G-OOATGACC GGTG-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- TG-------- ------GCCG C-GCAAGTC- TATCGGG-A- AATCTCTTCG
Methanococ.janna G-TGGTGGCC ACTG-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- CG-------- ------GCCC N-GTAAGTC- TCTGCTT-A- AATCCTGCGG
Methanococ.vanni G-TGGTAGCC ACTC-TTA-- TTGGG-CCTA ----AAGCGT C-CGTAG-C- CG-------- ------GTCC A-GTAAGTC- CCTGTTT-A- AATTCTCTGG
Xenopus.laevi G-CGTATATT AAAG-TTG-- CTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGGATCTT-- -------GGG A-TCGAGCT- -----GG-C- GGTCCG-CC-
Homo.sapie G-CGTATATT AAAG-TTG-- CTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGGATCTT-- -------GGG A-GCGGGC-- ----GGG-C- GGTCCG-CC-
Candida.albic G-CGTATATT AAAG-TTG-- TTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGAACTTT-- ------GGGC --TTGGCT-- ----GGC-C- GGTCCA-TC-
Saccharomy.cerev G-CGTATATT AAAG-TTG-- TTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGAACTTT-- ------GGGC --CCGGTTG- -----GC-C- GGTCCG-A--
Schizosacc.pombe G-CGTATATT AAAG-TTG-- TTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGAACTTT-- ------GAGC --CTGGTCG- -----AC-T- GGTCCG-CCG
Oryza.sativ G-CGTATATT TAAG-TTG-- TTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGGACCTT-- ------GGGC --GCGGCCG- ----GGC-C- GGTCCG-CC-
Arabidopsi.thali G-CGTATATT TAAG-TTG-- TTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGAACCTT-- ------GGGA --TGGGTC-- ----GGC-C- GGTCCG-CC-
Fragaria.anana G-CGTATATT TAAG-TTG-- TTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGGACCTT-- ------GGGT --TGGGTC-- ----GAC-C- GGTCCG-CC-
Chlorella.ellip G-CGTATATT TAAG-TTG-- CTGCA-GTTA ----AAAAGC T-CGTAG-T- TGGATTTC-- ------GGAT --GGGTTCC- -----GT-C- GGTCCG-CCG
Euglena.graci G-CGTATACT AACA-TTG-- CTGCT-GTTA ----AAACAC T-TGTAG-TC TGCCTA---- ------CGGG --CTGCAGGT -----CT-G- CTGGGT-GGC
Entamoeba.histo G-TGTATATT AAAG-TTG-- CTGTG-ATTA ----AAACGC T-CGTAG-T- TGAATTAA-- ----AATGTG --GTTTTATA C----AT-TT TGAAGA-CTT
Giardia.intes G-CGTCGCGC GGCG-CTG-- CTGCA-GTTG ----AAACGC C-CGTAG-T- TGGCCCCC-- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce G-CGTATATT AATG-CTG-- TTGCT-GTTA ----AAGGGT T-CGTAG-T- TGAACTGT-- ------GGGC --CACGTAGT -----TT-T- GTGCC--GTG
****** *****************************************
2101
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CT--
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTYAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CT--
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CT--
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CT--
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CG--
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CG--
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CG--
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CG--
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTTAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CC--
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ----GCGA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---TTTTTC- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---TTTTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe C--------- ---------- ---------- ---------- -----AAG-- ---------- ---------- ---------- ---------- -------G--
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ----TCAC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ----TTT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ----TTAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ----TTT--- ---------- ---------- ---------- ---------- -------C--
Euglena.graci C-GGTTTGTT GTTTCTCTGG CCAGGGAAGG AC-------- ----CTCG-- ---------- ----GTTCGA CCCTGTGTTG GGCTGCAACG GCTGGACT--
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ----TATGT- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce CCAGTCCCGT CC-------- ---------- ---------- ---ACCTC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
2201
Mycobacter.lepra GTGA-G--C- -G---T---- ---------- ---------- ---------- --GCGGG--- ----CGAT-A CGGGCA--GA C--------- ----------
Streptomyc.grise CCGG-G--T- -C---T---- ---------- ---------- ---------- --GCATT--- ----CGAT-A CGGGCT--AG C--------- ----------
Bacillus.subti GGGG-A--G- -G---G---- ---------- ---------- ---------- --TCATT--- ----GGAA-A CTGGGG--AA C--------- ----------
Lactobacil.delbr GTGG-A--A- -C---T---- ---------- ---------- ---------- --GCATC--- ----GGAA-A CTGTCA--TT C--------- ----------
Leuconosto.mesen CCGG-N--A- -T---G---- ---------- ---------- ---------- --GCATT--- ----GGAA-A CTGGTT--AA C--------- ----------
Staphyloco.aureu GTGG-A--G- -G---G---- ---------- ---------- ---------- --TCATT--- ----GGAA-A CTGGAA--AA C--------- ----------
Bartonella.bacil TTGG-AA-C- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCCTT--- ----TGAT-A CTGGAT--GT C--------- ----------
Rhodopseud.palus CCAG-AA-C- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCCTT--- ----TGAT-A CTGAGG--AT C--------- ----------
Rickettsia.ricke TCGG-AA-T- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCTTT--- ----CAAA-A CTACTA--AT C--------- ----------
Bordetella.bronc TTGG-AA-C- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCATT--- ----TTTA-A CTACCG--GG C--------- ----------
Escherichi.coli TGGG-AA-C- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCATC--- ----TGAT-A CTGGCA--AG C--------- ----------
Haemophilu.influ TGGG-NA-T- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCATT--- ----TCAG-A CTGGGT--AA C--------- ----------
Thermus.therm GTGG-GG-G- -----A---- ---------- ---------- ---------- --GCGTG--- ----GGAT-A CGCTCA--GG C--------- ----------
Thermotoga.marit GTGG-GG-C- -----T---- ---------- ---------- ---------- --GCATC--- ----CGAA-A CTACCA--GG C--------- ----------
Zea.mays.CP CTGG-A--C- -A---G---- ---------- ---------- ---------- --GCGGT--- ----GGAA-A CTACCA--AG C--------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP TTGG-A--C- -C---G---- ---------- ---------- ---------- --GCATT--- ----GGAGTA CTCACG--AG C--------- ----------
Euglena.graci.CP TTGG-A--A- -G---G---- ---------- ---------- ---------- --GCATT--- ----AAAA-A CTGCTA--GA C--------- ----------
Desulfuroc.mobil CGGG-GA-C- -T-------- ---------- ---------- ---------- --GGAGG--- ----GGAT-A CTGCCG--GG C--------- ----------
Sulfolobus.acido GGGG-AA-C- -T-------- ---------- ---------- ---------- --GGGGG--- ----CGAT-A CTGGTG--GG C--------- ----------
Thermofilu.pende GTGG-GA-G- -C-------- ---------- ---------- ---------- --GGAGG--- -----GAT-A CTGCCG--GG C--------- ----------
Thermoprot.tenax TGGG-GG-C- -A-------- ---------- ---------- ---------- --GGGGG--- ----CGAT-A CTGCCG--GG C--------- ----------
Halobacter.halob GGCA-GG-C- -G---T---- ---------- ---------- ---------- --CCAGC--- ----GGAA-A CTGTTC--AG C--------- ----------
Halobacter.maris CGTC-GG-C- -G---T---- ---------- ---------- ---------- --CCAGC--- ----GGAA-A CTGTCC--GG C--------- ----------
Halococcus.morrh GGTG-GGAC- -G---T---- ---------- ---------- ---------- --CCGGC--- ----GGAA-A CCAGTC--GG C--------- ----------
Natronobac.magad GAGA-GG-C- -GA--T---- ---------- ---------- ---------- --CCGGT--- ----GGAA-- AAATGT--GG C--------- ----------
Methanococ.janna GCAG-GG-C- -T-------- ---------- ---------- ---------- ---GCAG--- ----AGAT-A CTGCCN--NN N--------- ----------
Methanococ.vanni AGAG-GA-C- -T-------- ---------- ---------- ---------- --GGCAG--- ----GGAT-A CTGCTG--GA C--------- ----------
Xenopus.laevi GGCG----G- -C---T---- ---------- ---------- ---------- --ACCGC--- ----CTGT-- CCCAG--CCC CTGCC----- ----------
Homo.sapie GGCG-A--G- -C---C---- ---------- ---------- ---------- --ACCGC--- ----CCGT-- CCCCGC-CCC TTGCC----- ----------
Candida.albic GATG----C- -G---T---- ---------- ---------- ---------- --ACTGG--- ---AC----- CAGCCG-AGC CTTTC----- ----------
Saccharomy.cerev -TCG----T- -G---T---- ---------- ---------- ---------- --ACTGG--- --ATTTC--- CAACGG-GGC CTTTCC---- ----------
Schizosacc.pombe CGTG----T- -T---T---- ---------- ---------- ---------- --ACTGG--- ----TCA--- TGACCG-GGG TCGTTAAC-- ----------
Oryza.sativ GGCA----G- -G---C---- ---------- ---------- ---------- --ACCGA--- ---------- --CCTG-CTC GACCCTT--- ----------
Arabidopsi.thali GGTG----T- -G---C---- ---------- ---------- ---------- --ATTGG--- ---TC----- -GGCTT-GTC CCTT------ ----------
Fragaria.anana GGTG----T- -G---C---- ---------- ---------- ---------- --ACCGG--- ---TC----- -GGCTC-GTC CCTT------ ----------
Chlorella.ellip GGTG----T- -G---C---- ---------- ---------- ---------- --ACTGA--- ---CG----- -GCGCC-TAT CTTG------ ----------
Euglena.graci CAAC-C-CC- -CAGTG---- ---------- ---------- ---------- --GTAC---- ------GT-C CCTGC--GCC CAC------- ----------
Entamoeba.histo -AAG-T-AA- -A---G---- ---------- ---------- ---------- --TTTC---- ---------- TAGAA--ATG TTAAATT--- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce -GGA-CGTG- -TTTTG---- ---------- ---------- ---------- --ACCCACGC ---------C CTCGT--GGC CCGTGAACAC AC--------
2301
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- --TCTCGGCG ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- --TCTCGGCG ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- -CTTCTGGTA ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- --TTCTGGCT ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- -CTTCTGGCA ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- -CTGCCGGCG ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- -CGGTCGGCG ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- -CTACCGGCG ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- -CTGCCGGGG ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- --CTCTCAGT CGATGGTGAG ATCTGCTCCT GCCAAA---- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- -------AAA ATCAAAGAAG GAAACAAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- --------TC AGATACAAGA AACACGGGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
2401
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CCTC-CC--- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CCCC-CT--- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCC-A---- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AACC------ ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AACT-AC-T- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATGC-GC--- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATAC-GC--- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATAC-GC--- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ACGG-GC-T- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- -AGTCTGCTT CACTGCAGGC CAAAGCGGTT TATGCCTCCC GCACT--GGC AACGGACACC AACA-GG-G- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GC GGTT--CCTC CTCACTTTC- ----------
2501
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
2601
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CGA TGCTC--TTG
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CGA TGCTC--TTA
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TTT
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TT- GAGTC--CTT
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CA- TGTTC--TTT
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TCC TGGCC--TTA
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TCC TGGTC--TTA
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------TCC TGGCC--TTA
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------CC- TGGGC--TTA
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GAC CCAGC--CTC
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -TCAA---GT
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------ACG CATGT----C
2701
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ACT--G-A-G TGTCC----C GGGGG----- ---------- ---------- ---CCCGAAG C-G-TTTACT TTGAAAAAA- TTAGAGTGTT CCAA-GCAGG
Homo.sapie GCT--G-A-G TGTCCC--GC GGGG------ ---------- ---------- ---CCCGAAG C-G-TTTACT TTGAAAAAA- TTAGAGTGTT CAAA-GCAGG
Candida.albic A--------- ---------T GGCGA----- ---------- ---------- ---ACCAGGA C-T-TTTACT TTGAAAAAA- TTAGAGTGTT CAAA-GCAGG
Saccharomy.cerev GT---G-G-C TCT------T GGCGA----- ---------- ---------- ---ACCAGGA C-T-TTTACT TTGAAAAAA- TTAGAGTGTT CAAA-GCAGG
Schizosacc.pombe ATT--G-A-G CGTGG----T AGGGA----- ---------- ---------- ---ACCAGGA C-T-TTTACC TTGAAAAAA- TTAGAGTGTT CAAA-GCAGG
Oryza.sativ ACT--G-G-C CGGGT---TC GTGCC----- ---------- ---------- ---TCCGGCG C-C-GTTACT TTGAAGAAA- TTAGAGTGCT CAAA-GCAAG
Arabidopsi.thali ATT--G-G-C CGGGT----C GTGCC----- ---------- ---------- ---TCCGGCG C-T-GTTACT TTGAAGAAA- TTAGAGTGCT CAAA-GCAAG
Fragaria.anana ACT--G-G-C CGGGT----C GTGCC----- ---------- ---------- ---TCCGGTG C-T-GTTACT TTGAAGAAA- TTAGAGTGCT CAAA-GCAAG
Chlorella.ellip ACT--G-T-C CGGGA----C TCGGA----- ---------- ---------- ---GTCGGCG A-G-GTTACT TTGAGTAAA- TTAGAGTGTT CAAA-GCAGG
Euglena.graci GA---G-C-T GGGTA-GTCT ACCTCTGGTC CACCACCGGA GCC------- ---CACCGTC TTC-GACACC CTGGAAAAC- TCAGTGTGCT CAAA-GCATC
Entamoeba.histo AA---T-T-G A--------- ---------- ---------- ---------- ----GTTGTT ----ATTACT TTGAATAAA- ATAAGGTGTT TAAA-GCAAA
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---CGCCGCC ACGAGGAAA- CGGGAGCGCT CCAG-GCAG-
Trypanosom.bruce AT---G-C-A TGCGA-G-GG GG-------- ---------- --C------- ---GTCCGTG AAT-TTTACT GTGACCAAA- AAAGTGCGAC CAAA-GCAGT
2801
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi C--------- ---------- CGCGTC---- ---------- ---GCC--TG GATAC--TTC AGCTAGGAA- TAATGGAAT- AGGA------ --------CT
Homo.sapie C--------- ---------C CGAGCC---- ---------- ---GCC--TG GATAC--CGC AGCTAGGAA- TAATGGAAT- AGGA------ --------CC
Candida.albic C--------- ---------- -CTTT----- ---------- ---GCT--CG AATAT--ATT AGCATGGAA- TAATAGAAT- AGGA------ --------CG
Saccharomy.cerev C--------- ---------- -GTATT---- ---------- ---GCT--CG AATAT--ATT AGCATGGAA- TAATAGAAT- AGGA------ --------CG
Schizosacc.pombe CAA------- ---------- -GTT------ ---------- -TTGCT--CG AATAC--ATT AGCATGGAA- TAATAAAAT- AGGA------ --------CG
Oryza.sativ C--------- ---------- -CATC----- ---------- ---GCT-CTG GATAC--ATT AGCATGGGA- TAACATCAT- AGGA------ --------TT
Arabidopsi.thali C--------- ---------- -CTAC----- ---------- ---GCT-CTG GATAC--ATT AGCATGGGA- TAACATCAT- AGGA------ --------TT
Fragaria.anana C--------- ---------- -CTAC----- ---------- ---GCT-CTG GATAC--ATT AGCATGGGA- TAACATCAT- AGGA------ --------TT
Chlorella.ellip C--------- ---------- -CTAC----- ---------- ---GCT-CTG AATAC--ATT AGCATGGAA- TAACACGAT- AGGA------ --------CT
Euglena.graci C--------- --------CC GCGAC----- ---------- ---GGC-TGA ATGTC---CA TCCATGGATG TCAAGGCAT- CGACCAAGTG TGGCA---TT
Entamoeba.histo ACA------- ---------- -TTA------ ---------- --TGTTAATG AATAT--TCA AGCATGGGA- CAATGCTG-- AG-------- --------GG
Giardia.intes ---------- ---------- -GCCCG---- ---------- -------TTG GACCC---GC CGCGTGGGA- ---CCGCGC- AG-------- --------CG
Trypanosom.bruce C--------- ---------- -TGCC----- ---------- ---GAC-TTG AATTA--CAA AGCATGGGA- TAACGAAGC- ATCAGCCCTG GGG-----CC
2901
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi C--------- -CGGTTCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie G--------- -CGGTTCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic TT---A---- -TGGTTCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev T----T---- -TGGTTCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe T----G---- -TGGTTCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ C--------- -CGGTCCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali T--------- -CGATCCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana T--------- -CGGTCCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip -----C---- -TGG-CCT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- --GGAGTTG- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- -GAT-GT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes GGC------- ----CG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce AC-------- --CGTTTCGG ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
3001
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi --------AT TT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTT ----------
Homo.sapie --------AT TT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTT ----------
Candida.albic --------AT TG-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTT ----------
Saccharomy.cerev --------AT TT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTT ----------
Schizosacc.pombe --------AT TT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTT ----------
Oryza.sativ --------AT TG-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGCC ----------
Arabidopsi.thali --------AT TG-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGC- ----------
Fragaria.anana --------AT TC-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGCC ----------
Chlorella.ellip --------AT CT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTC ----------
Euglena.graci ------TGCT GC-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -C-TTGGGGC CCACT-----
Entamoeba.histo --------CA AT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-CGCGCCG ----------
Trypanosom.bruce --------CT TT-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -T-GTTGGTT ----------
3101
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------T TCGGAAC--- ----TGGGGC C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------T TCGGAAC--- ----TGAGGC C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------T CTAGGAC--- ----CATCGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------T CTAGGAC--- ----CATCGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------T CTAGGAC--- ----CGCCGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------T TCGGGAT--- ----CGGAGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------T TCGGGAT--- ----CGGAGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------T TCGGGAT--- ----CGGAGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------T GTAGGAC--- ----CGGAGT A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci --------CT GGACAAC--- -----CTGG- ------TGGT GTGTTCCTGC --AGGAT--- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- AAGAC-A--- -----TTTCG A--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- -CGGCAGC-- -----CCCG- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------T TAGAAGTC-- --C-TTGGG- AGATTATGGG GCCGCGTGCC TTGGGTC--- ---------- ---------- ---------- ----------
3201
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---CAACAGG ATCGTTGCCC TGCCTGGCC- ----TTCGGG TCTC----GT CAGGCTTCGT
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- --------GG TGTTTCGTGT CTCATTTTTG TG-------- -GCGCG---- ---------C ACATTCGGCT
3301
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGAG -TACTG-CAG G--------- ---GGAGACT
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGAG -TGTGG-TAG G--------- ---GGAGATC
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TGCAG-AAG A--------- ---GGAGAGT
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TGCAG-AAG A--------- ---GGAGAGT
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TGCAG-TAG A--------- ---GGTAAGT
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TGCAG-AAG A--------- ---GGAAAGT
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TCGAG -TATGG-AAG A--------- ---GGTGAGT
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TATGG-GAG A--------- ---GGTGAGT
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGAG -TGTAG-TAG G--------- ---GGATGAT
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGAG -TGTGT-CAG A--------- ---GGGAGGT
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TCTCG-TAG A--------- ---GGGGGGT
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGAG -TACTT-TAG G--------- ---GAGGGGT
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGAC -GGTGG-GAG A--------- ---GGGTGGT
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGG -GGCGG-TAG A--------- ---GGGAGAC
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TGGAG -TACGG-TAG G--------- ---GGCAGAG
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TACGG-TAG G--------- ---GGCAGAG
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGAG -TATGG-TAG G--------- ---GGTGAAG
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGGG -GGTGG-GAG A--------- ---GGCCGAG
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGGG -GGCGG-GAG A--------- ---GGCGGGG
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGGG -GGCGG-GAG A--------- ---GGCCGGG
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TAGGG -GGCGG-GAG A--------- ---GGCCGCC
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGG -ACCGG-AAG A--------- ---CCTGAGG
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGG -GCCGG-AAG A--------- ---CCTGAGG
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGG -GCCGG-GAG A--------- ---CCAGAGA
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGG -ACCGG-AAG A--------- ---CCAGAGG
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGN -ACCGG-GAG A--------- ---GGCCNGG
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGG -ACCGG-GAG A--------- ---GGACAAG
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAG -AGGGA-CGG C--------- ---CGGGGGC
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAG -AGGGA-CGG C--------- ---CGGGGGC
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAT -AGGGA-CGG T--------- ---CGGGGGT
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAT -AGGGA-CGG T--------- ---CGGGGGC
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAT -AGGGA-TAG T--------- ---CGGGGGC
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAT -AGGGA-CAG T--------- ---CGGGGGC
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAC -AGGGA-CAG T--------- ---CGGGGGC
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAC -AGGGA-CAG T--------- ---CGGGGGC
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -ATGATTAAG -AGGGA-CAG T--------- ---CGGGGGC
Euglena.graci CCCCTG---- ---------- ---------- ----TCCCTG CAG-CTTGCA CCCATCGATC GTAAGTGA-T --GGGA-CTG TT-------- ---CGGGGTG
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------GAG AAGGATTAAA -AGGAA-CAA T--------- ---TGGGGTG
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------AGG -AGAGC-GGG ---------- ---CGGGGGC
Trypanosom.bruce CTTCGTGATG TTTTTTTA-- ---------- ----CATTC- ATTGCGACGC GCGGCT-TCC AGGAATGAAG -GAGGG-TAG TT-------- ---CGGGGGA
********
3401
Mycobacter.lepra ----GGA--A TT-CCTGGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --GAATGCGC -AGATATC-- ---------- ---------- ---------A
Streptomyc.grise ----GGA--A TT-CCTGGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGC -AGATATC-- ---------- ---------- ---------A
Bacillus.subti ----GGA--A TT-CCACGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGT -AGAGATG-- ---------- ---------- ---------T
Lactobacil.delbr ----GGA--A CT-CCATGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --GAATGCGT -AGATATA-- ---------- ---------- ---------T
Leuconosto.mesen ----GGA--A CT-CCATGT- -GT------- ---------- ---NGCGGTG --GAATGCGT -AGATATA-- ---------- ---------- ---------T
Staphyloco.aureu ----GGA--A TT-CCATGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGC -AGAGATA-- ---------- ---------- ---------T
Bartonella.bacil ----GGA--A TT-CCGAGT- -GT------- ---------- ---AGAGGTA --AAATTCGT -AGATATT-- ---------- ---------- ---------C
Rhodopseud.palus ----GGA--A CT-GCGAGT- -GT------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCGT -AGATATT-- ---------- ---------- ---------C
Rickettsia.ricke ----GGA--A TT-CCTAGT- -GT------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -AGATATT-- ---------- ---------- ---------A
Bordetella.bronc ----GGA--A TT-CCGCGT- -GT------- ---------- ---AGCAGTG --AAATGCGT -AGATATG-- ---------- ---------- ---------C
Escherichi.coli ----AGA--A TT-CCAGGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGT -AGAGATC-- ---------- ---------- ---------T
Haemophilu.influ ----AGA--A TT-CCACGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGT -AGAGATG-- ---------- ---------- ---------T
Thermus.therm ----GGA--A TT-CCCGGA- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGC -AGATACC-- ---------- ---------- ---------G
Thermotoga.marit ----GGA--A CT-GCCGGT- -GT------- ---------- ---AGGGGTG --AAATCCGT -AGATATC-- ---------- ---------- ---------G
Zea.mays.CP ----GGA--A TT-TCCGGT- -GG------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCAT -TGAGATC-- ---------- ---------- ---------G
Chlamydomo.reinh.CP ----GGA--A TT-CCATGT- -GG------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGT -AGAGATA-- ---------- ---------- ---------T
Euglena.graci.CP ----GGA--A TT-TCCAGT- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGT -AGAGATT-- ---------- ---------- ---------G
Desulfuroc.mobil ----GGT--A CT-CCCGGG- -GT------- ---------- ---AGGGGCG --AAATCCTA -TAATCCC-- ---------- ---------- ---------G
Sulfolobus.acido ----GGT--A CT-CCCGGA- -GT------- ---------- ---AGGGGCG --AAATCCTT -AGATACC-- ---------- ---------- ---------G
Thermofilu.pende ----GGT--A CT-CCTGGG- -GT------- ---------- ---AGGGGCG --AAATCCTA -TAATCCC-- ---------- ---------- ---------A
Thermoprot.tenax ----GGT--A CT-CCGGGG- -GT------- ---------- ---AGGGGCG --AAATCCTA -TAATCCC-- ---------- ---------- ---------C
Halobacter.halob ----GGT--A CG-TCTGGG- -GT------- ---------- ---AGGAGTG --AAATCCTG -TAATCCT-- ---------- ---------- ---------G
Halobacter.maris ----GGT--A CG-TCCGGG- -GT------- ---------- ---AGGAGTG --AAATCCTG -TAATCCT-- ---------- ---------- ---------G
Halococcus.morrh ----GGT--A CG-TCCGGG- -GT------- ---------- ---AGGAGTG --AAATCCTG -TAATCCT-- ---------- ---------- ---------G
Natronobac.magad ----GGT--A CG-TCTGGG- -GT------- ---------- ---AGGAGTG --AAATCCCG -TAATCCT-- ---------- ---------- ---------G
Methanococ.janna ----GGT--A CC-CCAGGG- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGCGT -TGATCCC-- ---------- ---------- ---------T
Methanococ.vanni ----GGT--A CT-CCAGGG- -GT------- ---------- ---AGCGGTG --AAATGTGT -TGATCCT-- ---------- ---------- ---------T
Xenopus.laevi A-TTCGT--A TT-GTGCCG- -CT------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -GGACCGG-- ---------- ---------- ---------C
Homo.sapie A-TTCGT--A TT-GCGCCG- -CT------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCCT TGGACCGG-- ---------- ---------- ---------C
Candida.albic A-TCAGT--A TT-CAGATG- -TCG------ ---------- ---AAAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------C
Saccharomy.cerev A-TCGGT--A TT-CAATTG- -TC------- ---------- ----GAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------T
Schizosacc.pombe A-TTCGT--A TT-CAATTG- -TC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------T
Oryza.sativ A-TTCGT--A TT-TCATAG- -TC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------T
Arabidopsi.thali A-TTCGT--A TT-TCATAG- -TC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------T
Fragaria.anana A-TTCGT--A TT-TCATAG- -TC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------T
Chlorella.ellip A-TTCGT--A TT-TCATTG- -TC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -GGATTTA-- ---------- ---------- ---------T
Euglena.graci A-AAGAT--A CG-GGAGCG- -CC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -AGATCGC-- ---------- ---------- ---------T
Entamoeba.histo A-TTCAG--A AA-ATAACG- -GG------- ---------- ---AGAGGTG --AAAATCCA -TGATCGC-- ---------- ---------- ---------T
Giardia.intes A-CCGGT--A CC-GGCCGG- -GG------- ---------- ---ACGGGTG --AAACAGGA -TGATCCC-- ---------- ---------- ---------G
Trypanosom.bruce G-AACGT--A CT-GGTGCG- -TC------- ---------- ---AGAGGTG --AAATTCTT -AGACCGC-- ---------- ---------- ---------A
*********************************************************************************************************
3501
Mycobacter.lepra GGA------G G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GGTC -TCTGGGCAG TA-------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise GGA------G G-AACACCGG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GATC -TCTGGGCCA TT-------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti GGA------G G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------ACTC -TCTGGTCTG TA-------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr GGA------A G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GCTC -TCTGGTCTG CA-------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen GGA------A G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GCTT -ACTGGACTG CA-------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu GGA------G G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------ACTT -TCTGGTCTG TA-------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil GGA------G G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GCTC -ACTGGTCCA TT-------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus GCA------A G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GCTC -ACTGGCCCA TA-------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke GGA------G G-AACACCGG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GTCA -TCTGGGCTA CC-------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc GGA------G G-AACACCGA T--GGC-GAA G--GCA---- ------GCCT -CCTGGGATA AC-------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli GGA------G G-AATACCGG T--GGC-GAA G--GCG---- ------GCCC -CCTGGACGA AG-------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ GGA------G G-AATACCGA A--GGC-GAA G--GCA---- ------GCCC -CTTGGGAAT GT-------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm GGA------G G-AACGCCGA T--GGC-GAA G--GCA---- ------GCCA -CCTGGTCCA CC-------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit GCA------G G-AACGCCGG T--GGG-GAA G--CCG---- ------GTCT -CCTGGGCCG AC-------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP GAA------A G-AACACCAA C--GGC-GAA A--GCA---- ------CTCT -GCTGGGCCG AC-------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP GGA------G G-AACACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------CTCT -GCTGGGCCG AA-------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP GAA------A G-AACACCAA T--GGC-GAA G--GCA---- ------CTTT -TCTAGGCCA AT-------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil GGA------G G-ACCACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------CTCG -GCTGGAACA CG-------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido GGA------G G-ACCACCAG T--GGC-GGA A--GCG---- ------CCCC -GCTAGAACG CG-------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende GGA------G G-ACCACCAG T--GGC-GAA G--GCG---- ------CCCG -GCTAGCACG CG-------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax GGA------G G-ACCACCAG T--GGC-GAA A--GCG---- ------GGCG -GCCAGAACG CG-------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob GAC------G G-ACCGCCGG T--GGC-GAA A--GCG---- ------CCTC -AGGAGAACG GA-------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris GAC------G G-ACCACCAA T--GGG-GAA A--CCA---- ------CCTC -AGGAAGACG GA-------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh GAC------G G-ACCACCGG T--AGC-GAA A--GCG---- ------TCTC -TGGAGAACG GA-------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad GAC------G G-ACCACCGG T--GGC-GAA A--GCG---- ------CCTC -TGGAAGACG GA-------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna GGG------G G-ACCACCTG T--GGC-GAA G--GCG---- ------CCCG -GCTGGAACG GG-------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni GGA------G G-ACCACCTA T--GGC-GAA G--GCA---- ------CTTG -TCTGGAACG GG-------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi GCA------A G-ACGAACCA A--AGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGAATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie GCA------A G-ACGGACCA G--AGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGAATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic TGA------A G-ACTAACTA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TACC -AAGGACGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev TGA------A G-ACTAACTA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGGACGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe TGA------A G-ACGAACTA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGGATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ GAA------A G-ACGAACAA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGGATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali GAA------A G-ACGAACAA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGGATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana GAA------A G-ACGAACAA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGGATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip GAA------A G-ACGAACTA C--TGC-GAA A--GCA---- TT----TGCC -AAGGATGTT TTC------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci GCC------A G-ATCCACTG C--AGC-GAA G--GCG---- TT----CTGC -AAGTGCACG TCC------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ATA------A G-ATGCACGA G--AGC-GAA A--GCA---- TT----TCAC -TCAACTGTG TCC------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes CCG------A G-ACCGCCGG C--CGC-GCA G--GCG---- CC----TGCC -AAGACCGCC TCT------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce CCA------A G-ACGAACTA C--AGC-GAA G--GCA---- TT----CTTC -AAGGATACC TTC------- ---------- ---------- ----------
***************************************
3601
Mycobacter.lepra ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GGA-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Streptomyc.grise ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GGA-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCG- AACAGGATTA G---------
Bacillus.subti ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GGA-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCG- AACAGGATTA G---------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GGC-TCGA- -AAGCATGGG ---------- ----TAGCG- AACAGGATTA G---------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- -----AC-TG A--CGTT-GA -GGC-TCGN- -AAGTGTGGG ---------- ----TAGCA- AACAGGATTA G---------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -TGT-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GATCA- AACAGGATTA G---------
Bartonella.bacil ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GGT-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GGC-ACGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -TGC-ACGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Bordetella.bronc ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-CA -TGC-ACGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Escherichi.coli ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-CA -GGT-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Haemophilu.influ ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-CA -TGT-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Thermus.therm ---------- ---------- -----CG-TG A--CGCT-GA -GGC-GCGA- -AAGCGTGGG ---------- ----GAGCA- AACCGGATTA G---------
Thermotoga.marit ---------- ---------- -----CC-CG A--CGCT-GA -GGC-CCGA- -AAGCCAGGG ---------- ----GAGCA- AACCGGATTA G---------
Zea.mays.CP ---------- ---------- -----AC-TG A--CACT-GA -GAG-ACGA- -AAGCTAGGG ---------- ----GAGCA- AATGGGATTA G---------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- -----AC-TG A--CACT-GA -GAG-ACGA- -AAGCTGGGG ---------- ----GAGCG- AATAGGATTA G---------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- -----AC-TG A--CGCT-GA -GAA-ACGA- -AAGCTGAGG ---------- ----GAGCA- AACAGGATTA G---------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- -----CC-CG A--CGGT-GA -GGG-GCGA- -AAGCCGGGG ---------- ----GAGCG- AACCGGATTA G---------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- -----CC-CG A--CGGT-GA -GAG-GCGA- -AAGCCGGGG ---------- ----CAGCA- AACGGGATTA G---------
Thermofilu.pende ---------- ---------- -----CC-CG A--CGGT-GA -GGG-ACGA- -AAGCTGGGG ---------- ----GAGCA- AAGGGGATTA G---------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- -----CC-CG A--CGGT-GA -GGG-GCGA- -AAGCCGGGG ---------- ----GAGCA- AAGGGGATTA G---------
Halobacter.halob ---------- ---------- -----TC-CG A--CAGT-GA -GGG-ACGA- -AAGCTAGGG ---------- ----TCTCG- AACCGGATTA G---------
Halobacter.maris ---------- ---------- -----CC-CG A--CGGT-GA -GGG-ACGA- -AAGCTAGGG ---------- ----TCTCG- AACCGGATTA G---------
Halococcus.morrh ---------- ---------- -----CC-CG A--CGGT-GA -GGG-ACGA- -AAGCTTGGG ---------- ----TCTCG- AACCGGATTA G---------
Natronobac.magad ---------- ---------- -----TC-CG A--CGGT-GA -GGG-ACGA- -AAGCTCGGG ---------- ----TCACG- AACCGGATTA G---------
Methanococ.janna ---------- ---------- -----TC-CG A--CGGT-GA -GGG-ACGA- -AGGCCAGGG ---------- ----GAGCA- AACCGGATTA G---------
Methanococ.vanni ---------- ---------- -----TC-CG A--CGGT-GA -GGG-ACGA- -AAGCCAGGG ---------- ----GCGCG- AACCGGATTA G---------
Xenopus.laevi ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTCGGAG ---------- ----GTTCG- AAGACGATCA G---------
Homo.sapie ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTCGGAG ---------- ----GTTCG- AAGACGATCA G---------
Candida.albic ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTAGGG ---------- ----GATCG- AAGATGATCA G---------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTAGGG ---------- ----GATCG- AAGATGATCT G---------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTAGGG ---------- ----GATCG- AAGACGATCA G---------
Oryza.sativ ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTGGGG ---------- ----GCTCG- AAGACGATCA G---------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTGGGG ---------- ----GCTCG- AAGACGATCA G---------
Fragaria.anana ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTGGGG ---------- ----GCTCG- AAGACGATCA G---------
Chlorella.ellip ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTGGGG ---------- ----GCTCG- AAGACGATTA G---------
Euglena.graci ---------- ---------- -----GT-CG A-TCAA--GA -----ATGA- -GAGTTCGGG ---------- ----GAGCA- AAGATGATCA G---------
Entamoeba.histo ---------- ---------- -----AT-TA A-TCAA--GA -----ACGA- -AAGTTAGGG ---------- ----GATCG- AAGACGATCA G---------
Giardia.intes ---------- ---------- -----GT-CA A-TMAA--GG -----GCGA- -AGGCCGGGG ---------- ----GCTAG- AAGGCGATCA G---------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- -----CT-CA A-TCAA--GA -----ACCA- -AAGTGTGGG ---------- ----GATCA- AAGATGATTA G---------
**********************************************************************************
3701
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--TGCC
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CACC
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- G-----TAGT -CCA--CGCT
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCA--CGCC
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCT--GGCT
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AGACCC-CA- G-----TAGT -CCT--AGCC
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TA- G-----TAGT -CCC--AGCC
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-TG- ------TAGT -CTT--GGCC
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCC--GGCT
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-CG- G-----TAGT -CCC--GGCT
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-CC- G-----TAGT -CCC--AGCT
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-CT- G-----TAGT -CCC--GGCC
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCT--AGCT
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCT--AGCT
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCA--AGCT
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCG--AGCT
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCT--GGCT
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCC-GG- G-----TAGT -CCT--GGCC
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- G-----TAGT -TCC--GACC
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- G-----TAGT -TCC--GACC
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- G-----TAGT -CTT--AACC
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GTACCG-TC- G-----TAGT -CTT--AACC
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- G-----TAGT -CTT--AACC
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- C-----TAGT -CTC--AACC
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- C-----TAGT -CTC--AACC
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- C-----TAGT -CTC--AACC
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- C-----TAGT -CTC--AACC
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ACACCG-TC- G-----TAGT -CCGGCCACT
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ATACCG-TC- G-----TAGT -CCT--AACT
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ACACCA-CC- G-----TATT -CCC--GGCC
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- AGACCA-TT- G-----TAGT -CCA--CACT
*************************************************************************************************************
3801
Mycobacter.lepra GT-AAAC-GG TGGG-TACT- AGGT--GTGG GTTTC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise GT-AAAC-GT TGGG-AACT- AGGT--GTTG GCGAC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti GT-AAAC-GA TGAG-TGCT- AAGT--GTTA GGGGGT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr GT-AAAC-GA TGAG-CGCT- AGGT--GTTG GGGAC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen GT-AAAC-GA TGAA-CACT- AGGT--GTTA GGAGG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu GT-AAAC-GA TGAG-TGCT- AAGT--GTTA GGGGG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil GT-AAAC-GA TGAA-TGTT- AGCC--GTCG GGCAG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus GT-AAAC-GA TGAA-TGCC- AGCC--GTTA GTGGG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke GT-AAAC-GA TGAG-TGCT- AGAT--ATCG GAAGA----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc CT-AAAC-GA TGTC-AACT- AGCT--GTTG GGGCC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli GT-AAAC-GA TGTC-GACT- TGGA--GGTT GTGCC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ GT-AAAC-GC TGTC-GATT- TGGG--GGTT GGGGT----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm CT-AAAC-GA TGCG-CGCT- AGGT--CTCT GGG------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit GT-AAAC-GA TGCC-CACT- AGGT--GTGG GGGGG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP GT-AAAC-GA TGGA-TACT- AGGT--GCTG TGCG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP GT-AAAC-TA TGGA-GACT- AAGT--GCTG C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP GT-AAAC-TA TGGA-TACT- AAGT--GGTG C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil GT-AAAC-GA TGCG-GGCT- AGGT--GTTG GGTGGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido GT-AAAC-GA TGCG-GGCT- AGGT--GTCG AGTAGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende GT-AAAC-GA TGCG-GGCT- AGGT--GTTG GACGGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax GT-AAAC-GA TGCG-GGCT- AGCT--GTCG GCCGGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob GT-AAAC-GA TGTC-CGCT- AGGT--GTGG CGCAGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris GT-AAAC-GA TGCT-CGCT- AGGT--GTGC CGTAGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh GT-AAAC-GA TGCT-CGCT- AGGT--GTGG CGTTGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad GT-AAAC-GA TGTC-TGCT- AGGT--GTGA CACAGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna GT-AAAC-TC TGCG-GACT- AGGT--GTCG CGTCGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni GT-AAAC-TC TGCG-AACT- AGGT--GTCA CCTGGGC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi AT-AAAC-GA TGCC-GACT- AGCG--ATCC GGCGGC---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie AT-AAAC-GA TGCC-GACC- GGCG--ATGC GGCGGC---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic AT-AAAC-TA TGCC-GACT- AGGG--ATCG GTTGTT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev AT-AAAC-TA TGCC-GACT- AG----ATCG GGTGGT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe AT-AAAC-TA TGCC-GACT- AGGG--ATCG GGCAAT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ AT-AAAC-GA TGCC-GACC- AGGG--ATCG GCGGAT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali AT-AAAC-GA TGCC-GACC- AGGG--ATCA GCGGAT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana AT-AAAC-GA TGCC-GACC- AGGG--ATCG GCGGAT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip AT-AAAC-GA TGCC-GACT- AGGG--ATTG GTGGAT---- -----GTT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci GT-AAAC-GA TGCC-GGCC- AGGC--CTTG GCAGAG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo AT-AAAC-GA TGTC-AACC- AAGG--ATTG GATGAA-ATT CAGATGTACA AAGATAGAGA AGC------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes GT-AAAC-GG TGCC-GCCC- CGCG--GCCG GCG------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce GC-AAAC-CA TGAC-ACCC- ATGA--ATTG GGGAAC-ATC ATTGGGTGCC CGTGTGGCGG CCTTTTGTGC CGACCCT--- ---------- -----CG-GC
********************************
3901
Mycobacter.lepra ---------- --------CT -TC-CTT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- --------AT -TC-CAC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------T -TC-C----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- --------TT -TC-CA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- --------TT -TC-CG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- --------TT -TC-CG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------T -TT-A----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------T -TT-A----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------T -TC------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------T -TC-G----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------C -TT-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------T -TA------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- -TC-T----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- -TA-A----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- --------AC -TC-GACC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- --C-GCAA-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- --------TG -AA-AGT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------T -TA-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------T -TA-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------T -TC-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------T -TA-GG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------T -AC-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------T -AC-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------T -AC-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------T -AC-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------T -TC-GG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------C -TC-GA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- --------AT -TC-CCAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Homo.sapie ---------- --------AT -TC-CCAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Candida.albic ---------- --------CT -TT-TATT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Saccharomy.cerev ---------- --------TT -TT-TAAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Schizosacc.pombe ---------- --------TC -ATTTATC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Oryza.sativ ---------- --------GC -TT-ATAG-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Arabidopsi.thali ---------- --------GC -TT-ATAG-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Fragaria.anana ---------- --------AC -TT-TTAG-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Chlorella.ellip ---------- ---------T -AT-TGAT-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------GA
Euglena.graci ---------- ----CAAGAA -TC-CTAGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------A -TT------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- -----CGCGC -GT-CC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce CCCAATTTAT TTATCAATTT -AC-GTGCCT ATTCT----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
4001
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGAT-C CGT-GCCGTA -----GC-TA
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GTCGT-C GGT-GCCGCA -----GC-TA
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GCCCCT-T AGT-GCTGCA -----GC-TA
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GTCCT-C AGT-GCCGCA -----GC-AA
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---CCTCT-T AGT-GCCNAA -----GC-TA
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---CCCCT-T AGT-GCTGCA -----GC-TA
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTGCT-C GGT-GGCGCA ----CGT--A
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTCAC-T AGT-GGCGCA -----GC-TA
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---TCTTT-C GGT-TTCGCA -----GC-TA
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGCCT-T GGT-AGCGCA -----GC-TA
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGCGT-G GCT-TCCGGA -----GC-TA
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---ACTCT-G GCA-CCCGTA -----GC-TA
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CCT-G GGG-GCCGAA -----GC-TA
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---TCCCT-C CGT-GCTGAA -----GC-TA
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----CGTG-C AGT-GCTGTA -----GC-TA
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------G-C AGT-GCTGTA -----GC-TA
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------G-C ACT-GCTGTA -----GT-TA
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCCACC-C AGT-GCCGCA -----GG-GA
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCTACT-C GGT-GCCGCA -----GG-GA
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCCGTC-C AGT-GCCGTA -----GG-GA
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCCGGC-C GGT-GGCGTA -----GG-GA
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCTGCG-C TGT-GCCGTA -----GG-GA
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCTGCG-C TGC-GCCCTA -----GG-GA
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCAGCG-C TGT-GCCGTA -----GG-GA
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCTGTG-T TGT-GCCGTA -----GG-GA
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCNGACG-C GGT-GCCGAA -----GG-GA
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -GCCCAGG-T GGT-GCCGAA -----GG-GA
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CCCGCC-G AGC-AGCTTC ----CGG-GA
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CCCGCC-G GGC-AGCTTC ----CGG-GA
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CGCAAT-C GGC-ACCTTA ----CGA-GA
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CCCACT-C GGT-ACCTTA ----CGA-GA
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CTTGCT-C GGC-ACCTTA ----CGA-GA
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CTCCGC-C GGC-ACCTTA ----TGA-GA
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CTCCGC-T GGC-ACCTTA ----TGA-GA
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CTCCGC-C GGC-ACCTTA ----TGA-GA
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CTTCAC-C AGC-ACCTTA ----TGA-GA
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CTCTGTCA GGGCCACT-C CTC-CCACAA ----CGA-GA
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ----GTTTCT AGATCTGAGT ATATCAATAT TACCTTGTTC AGA-ACTTAA ----AGA-GA
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CGC-C GGC-CGCCC- ----AGG-GA
Trypanosom.bruce ---------- ATCACCCCCG GTTCCCTCTT TTGAGGTTCT TCCGGGGTTT TTTACGGGAA TATCCTCAGC ACGTTTCT-T -ACTTCTTCA ----CGC-GA
***********************
4101
Mycobacter.lepra ACGCA-TTAA GT----A-CC CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGCT-- AAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Streptomyc.grise ACGCA-TTAA GT----T-CC CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGCT-- AAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Bacillus.subti ACGCA-TTAA GC----A-CT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGACT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Lactobacil.delbr ACGCA-TTAA GC----N-NT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGA-CCG- CA-AGGTT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Leuconosto.mesen ACGCA-TTAA GT----G-TT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGA-CCG- CA-AGGTT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-A-CC
Staphyloco.aureu ACGCA-TTAA GC----A-CT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGA-CCG- CA-AGGTT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-A-CC
Bartonella.bacil ACGCG-TTAA AC----A-TT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGATT-- AAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Rhodopseud.palus ACGCT-TTAA GC----A-TT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGATT-- AAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Rickettsia.ricke ACGCA-TTAA GC----A-CT CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGATT-- AAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CT
Bordetella.bronc ACGCG-TGAA GT----T-GA CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGATT-- AAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-A-CC
Escherichi.coli ACGCG-TTAA GT----C-GA CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGTT-- AAAAC-TCAA A--------- TGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Haemophilu.influ ACGTG-ATAA AT----C-GA CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGTT-- AAAAC-TCAA A--------- TGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Thermus.therm ACGCG-TTAA GC----G-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Thermotoga.marit ACGCG-TTAA GT----G-GG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGC-CCG- CA-AGGGT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Zea.mays.CP ACGCG-TTAA GT----A-TC CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGT-TCG- CA-AGAAT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Chlamydomo.reinh.CP ACGCG-TTAA GT----C-TC CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --TGC-TCG- CA-AGAGT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A C-GGG-A--C
Euglena.graci.CP ACACG-TTAA GT----A-TC CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGC-TTG- CA-CAAGT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-A CGGGG-G-CC
Desulfuroc.mobil AGCCG-TTAA GC----C-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TCAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Sulfolobus.acido AGCCG-TTAA GC----C-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGACT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Thermofilu.pende AGCCG-TTAA GC----C-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Thermoprot.tenax AACCG-TTAA GC----C-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-CCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-GG
Halobacter.halob AGCCG-AGAA GC----G-GA CC-GCCT--G GG-AA-GTA- --CGT-CTG- CA-AGGAT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Halobacter.maris AGCCG-AGAA GC----G-AG CC-GCCT--G GG-AA-GTA- --CGT-CTG- CA-AGGAT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Halococcus.morrh AGCCG-AGAA GC----G-AG CC-GCCT--G GG-AA-GTA- --CGT-CCG- CA-AGGAT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Natronobac.magad AGCCG-TGAA GC----A-GA CC-GCCT--G GG-AA-GTA- --CGT-CCG- CA-AGGAT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Methanococ.janna AGCCG-TTAA GT----C-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGACT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Methanococ.vanni AGCCG-TTAA GT----T-CG CC-GCCT--G GG-GA-GTA- --CGG-TCG- CA-AGACT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-G CGGGG-G-AG
Xenopus.laevi AACCA--AAG TC-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TTG- CA-AAGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Homo.sapie AACCA--AAG TC-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TTG- CA-AAGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Candida.albic AATCA--AAG TC-TTTG-GG TT-CTGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Saccharomy.cerev AATCA--AAG TC-TTTG-GG TT-CTGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Schizosacc.pombe AATCA--AAG TC-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Oryza.sativ AATCA--AAG TC-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Arabidopsi.thali AATCA--AAG TT-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Fragaria.anana AATCA--AAG TT-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Chlorella.ellip AATCA--AAG TT-TTTG-GG TT-CCGG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Euglena.graci AATCC-ACAG CC-TGTG-GG TT-CAGG--G GG-GA-GTA- -CTG--TCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-T-GG
Entamoeba.histo AATCT-TGAG TT-TATG-GA CT-TCAG--G GG-GA-GTA- --TGG-TCA- CA-AGGCT-- GAAAC-TTAA A--------- GGAA-TTG-A CGGAA-G-GG
Giardia.intes AACCG-GGAG GC-TCCG-GG CT-CTGG--G GG-GA-GTA- --TGG-CCG- CA-AGGCT-- GAAAC-TTGA A--------- GGCA-TTG-A CGGAG-G-GG
Trypanosom.bruce AAGCTTGGAG GT-TACA-GT CT-CAGG--G GG-GA-GTA- --CGT-TCG- CA-AGAGT-- GAAAC-TTAA A--------- GAAA-TTG-A CGGAA-T-GG
*************************************************************************************************************
4201
Mycobacter.lepra CG--C-ACAA ---GCGG-CG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------ATT- AATT-CGATG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Streptomyc.grise CG--C-ACAA ---GCAG-CG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-CGACG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Bacillus.subti CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGAAG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Lactobacil.delbr NG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGAAG NAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Leuconosto.mesen CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGAAG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Staphyloco.aureu CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGAAG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Bartonella.bacil CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGAAG CAAC-G-CGC -A--GAA-CC
Rhodopseud.palus CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGACG CAAC-G-CGC -A--GAA-CC
Rickettsia.ricke CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGATG TTAC-G-CGA -A--AAA-CC
Bordetella.bronc CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-T-GA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------ATT- AATT-CGATG CAAC-G-CGA -A--AAA-CC
Escherichi.coli CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGATG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Haemophilu.influ NG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGATG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Thermus.therm CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGAAG CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Thermotoga.marit CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CG- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGATG CTAA-G-CCA -A--GAA-CC
Zea.mays.CP CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGATG CAAG-G-CGA -A--GAA-CC
Chlamydomo.reinh.CP CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-T-TA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------ATT- AATT-CGATA CAAC-G-CGA -A--GAA-CC
Euglena.graci.CP CG--C-ACAA ---GCGG-TG --GA-G-CA- T--GTGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-CGATG CAAC-A-CGA -A--GAA-CC
Desulfuroc.mobil CAC-C-ACAA ---GGGG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTC- AATT-GGAGT CAAC-G-CCG -G--GAA-TC
Sulfolobus.acido CAC-C-ACAA ---GGGG-TG --GA-A-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTC- AATT-GGAGT CAAC-G-CCT -G--GAA-TC
Thermofilu.pende CAC-C-ACAA ---GGGG-TG --AA-G-CT- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGAGT CAAC-G-CCG -G--AAA-CC
Thermoprot.tenax CAC-C-ACAA ---GGGG-TG --AA-G-CT- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-GGAGT CAAC-G-CCG -G--AAA-CC
Halobacter.halob CAC-T-ACAA ---CCGG-AG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGACT CAAC-G-CCG -G--ACA-TC
Halobacter.maris CAC-C-ACAA ---CCGG-AG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGACT CAAC-G-CCG -G--ACA-TC
Halococcus.morrh CAC-T-ACAA ---CCGG-AG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGACT CAAC-G-CCG -G--ACA-TC
Natronobac.magad CAC-T-ACAA ---CCGG-AG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGACT CAAC-G-CCG -G--ACA-TC
Methanococ.janna CAC-T-ACAA ---CGGG-TG --GN-N-AC- C--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGATT CAAC-G-CCG -G--GCA-TC
Methanococ.vanni CAC-C-ACAA ---CGGG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-GGATT CAAC-G-CCG -G--GCA-TC
Xenopus.laevi CAC-C-ACCA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--AAA-CC
Homo.sapie CAC-C-ACCA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--AAA-CC
Candida.albic CAC-C-ACCA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-AC
Saccharomy.cerev CAC-C-ACTA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------C-T- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-AC
Schizosacc.pombe CAC-C-ACAA --TGGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-AC
Oryza.sativ CAC-C-ACCA ---GGCG-TG --GG-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-AC
Arabidopsi.thali CAC-C-ACCA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-AC
Fragaria.anana CAC-C-ACCA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GC-G--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-AC
Chlorella.ellip CAC-C-ACCA ---GGCG-TG --GA-A-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--AAA-AC
Euglena.graci CAC-C-ACAA ---GGCG-TG --GA-G-TA- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-G-CGG -G--GAA-TG
Entamoeba.histo CAC---ACCA ---GGAG-TG --GA-G-CC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--AAA-AC
Giardia.intes TAC-C-ACCA ---GACG-TG --GA-G-TC- T--GCGG--- ---------- ---------- ------CTC- AATC-TGACT CAAC-G-CGC -G---CA-CC
Trypanosom.bruce CAC-C-ACAA ---GACG-TG --GA-G-CG- T--GCGG--- ---------- ---------- ------TTT- AATT-TGACT CAAC-A-CGG -G--GAA-CT
*************************************************************************************************************
4301
Mycobacter.lepra TTA-CC-TGG GTTT-GACA- TGC----A-C AGG------- ------ATGC GT-CTAGA-- -GATAGG-CA CT-------- --CCCTTG-- ----------
Streptomyc.grise TTA-CC-AAG GCTT-GACA- TAT----A-C CGG------- ------AAAG CA-TCAGA-- -GATGGT-GC C-------CC ---CCTTG-- ----------
Bacillus.subti TTA-CC-AGG TCTT-GACA- TC-----C-T CTG------- ------ACAA TC-CTAGA-- -GATAGG-AC -------GT- -CCCCTTC-- ----------
Lactobacil.delbr TTA-CC-AGG TCTT-GACA- TC-----C-T GCG------- ------CTAC AC-CTAGA-- -GATAGG-TN G-------T- -TCCCTTC-- ----------
Leuconosto.mesen TTA-CC-AGG TCTT-GACA- TC-----C-T TTG------- ------AAGC TT-TTAGA-- -GATAGA-AG T------GT- -TCTCTTC-- ----------
Staphyloco.aureu TTA-CC-AAA TCTT-GACA- TC-----C-T TTG------- ------ACAA CT-CTAGA-- -GATAGA-GC -------CTT -CCCCTTC-- ----------
Bartonella.bacil TTA-CC-AGC CCTT-GACA- TC-----C-C GATCG----- ------CGGA GA-GTGGA-- -GACACT-TT CC------TT -CAGTTA--- ----------
Rhodopseud.palus TTA-CC-AGC CCTT-GACA- TG-----T-C CAGGAC---- ------CGGT -C-GCAGA-- -GATGTG--A CC------TT -CTCTTC--- ----------
Rickettsia.ricke TTA-CC-AAC CCTT-GACA- TG-----G-T GGTTG----- ------CGGA TC-GCAGA-- -GATGCT-TT TC------TT -CAGCTC--- ----------
Bordetella.bronc TTA-CC-TAC CCTT-GACA- TG-----T-C TGG------- ------AATC CC-GAAGA-- -GATTTG-GG A------GTG -CTCGCA--- ----------
Escherichi.coli TTA-CC-TGG TCTT-GACA- TC-----C-A CGG------- ------AAGT TT-TCAGA-- -GATGAG-AA T------GTG --CCTTC--- ----------
Haemophilu.influ TTA-CC-TAC TCTT-GACA- TC-----C-T AAG------- ------AAGA GC-TCAGA-- -GATGAG-CT T------GTG --CCTTC--- ----------
Thermus.therm TTA-CC-AGG CCTT-GACA- TGC----T-A GGG------- ------AACC CG-GGTGA-- -AAGCCT-GG G------GTG -CCCCGCG-- ----------
Thermotoga.marit TTA-CC-AGG GCTT-GACA- TGC----C-G GTGG------ ------TACC TC-CCCGA-- -AAGGGGTAG G----GACCC AGTCCTTC-- ----------
Zea.mays.CP TTA-CC-AGG GCTT-GACA- TG-----C-C GCG------- ------AATC CT-CTTGA-- -AAGAGA-GG G------GTG CCCTC----- ----------
Chlamydomo.reinh.CP TTA-CC-AGG GTTT-GACA- TG-------T CAA------- ----GAANCC TC-TCAGA-- -AATGGG-AG G------GTG CCCTAA---- ----------
Euglena.graci.CP TTA-CC-AGG ATTT-GACAG GAT----C-T AGG------- ---------A AG-TTTGA-- -AAGAAC-GC A------GTA CCTTC----- ----------
Desulfuroc.mobil TCA-CC-GGG GGA--GACA- -G-----C-A GGA------- -------TGA CG-GCCAG-G -TTAAA---- --------GG -CCTTGC--- ----------
Sulfolobus.acido TTA-CC-GGG GGA--GACC- -G-----C-A GTA------- -------TGA CG-GCCAG-G -CTAAC---- --------GA -CCTTGC--- ----------
Thermofilu.pende TTA-CC-GGG GGC--GACA- -G-----C-A GGA------- -------TGA AG-GCCAG-G -CTGAC---- --------GA -CCTTGC--- ----------
Thermoprot.tenax TTA-CC-CGG GGC--GACA- -G-----C-A GGA------- -------TGA AG-GCCAG-G -CTAAC---- --------GA -CCTTGC--- ----------
Halobacter.halob TCA-CC-AGC CCC--GACA- -G-----T-A GTAA------ -------TGA CG-GTCAG-G -TTGAT---- --------GA -CCTTAC--- ----------
Halobacter.maris TCA-CC-GGT CCC--GACA- -G-----T-A GTAA------ -------TGA CA-GTCAG-G -TTGAC---- --------GA -CTTTAC--- ----------
Halococcus.morrh TCA-CC-GGC ACC--GACA- -G-----T-G TGCAG----- -------TGA CA-GTCAG-T -CCGAT---- --------GG -GCTTAC--- ----------
Natronobac.magad TCA-CC-AGC ACC--GACA- -A-----T-A GTAA------ -------TGA CG-GTCAG-T -GTGAT---- --------GA -GCTTAC--- ----------
Methanococ.janna TTA-CC-AGG GGC--GACG- -G-----C-A GGA------- -------TGA AG-GCCAG-G -TTGAC---- --------GA -CCTTGC--- ----------
Methanococ.vanni TCA-CC-ACG AGC--GACA- -G-----C-A TGA------- -------TGA CG-GCCAG-G -TTGAC---- --------GA -CCTTGC--- ----------
Xenopus.laevi TCA-CC-CGG CCCG-GACA- -------C-G GAAA------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAT---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Homo.sapie TCA-CC-CGG CCCG-GACA- -------C-G GACA------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAT---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Candida.albic TCA-CC-AGG TCCA-GACA- -------C-A ATAA------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Saccharomy.cerev TCA-CC-AGG TCCA-GACA- -------C-A ATAA------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Schizosacc.pombe TCA-CC-AGG TCCA-GACA- -------T-A GTAA------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Oryza.sativ TTA-CC-AGG TCCA-GACA- -------T-A GCAA------ -------GGA TT-GACAG-A -CTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Arabidopsi.thali TTA-CC-AGG TCCA-GACA- -------T-A GTAA------ -------GGA TT-GACAG-A -CTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Fragaria.anana TTA-CC-AGG TCCA-GACA- -------T-A GTAA------ -------GGA TT-GACAG-A -CTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Chlorella.ellip TTA-CC-AGG TCCA-GACA- -------T-A GTGA------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Euglena.graci TTA-CC-AGG TCAG-GACG- -------C-A ACTG------ -------GGA TT-GACAG-A -TTGAG---- -------AGC -TCTTTC--- ----------
Entamoeba.histo TTA-CC-AAG ACCG-AACA- -------G-T AGAA------ -------GGA AT-GACAG-A -TTAAG---- -------AGT -TCTTTC--- ----------
Giardia.intes TCA-CC-AGG CCCG-GACG- -------C-G CGGA------ -------GGA CC-GACAG-C -CGGG----- -------CGC -GCTTTC--- ----------
Trypanosom.bruce TTA-CC-AGA TCCG-GACA- -------G-G GTGA------ -------GGA TT-GACAG-A -TGGAG---- -------TGT -TCTTTC--- ----------
******************
4401
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---TGG----
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---TGG----
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGGG--
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGGA--
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGAGA--
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGGGA-
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGCTG--
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GGAG--
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGCTG--
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----AGAGA-
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GGGA--
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GGGA--
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---AGGGGAG
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---GGGACTG
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GGGA
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------CGGA
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------GGGT
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
4501
Mycobacter.lepra ----C--CTG T-GTG----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Streptomyc.grise ----T--CGG T-ATA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Bacillus.subti ----C--AGA G-TGA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GTT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Lactobacil.delbr ----C--GCA G-AGA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Leuconosto.mesen ----C--AAA G-TGA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GTC G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Staphyloco.aureu ----C--AAA G-TGA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GTT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Bartonella.bacil ---GA--TCG G-AGA----- CAGG-TGCTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Rhodopseud.palus ---CC--TGG A-GCA----- CAGG-TGCTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Rickettsia.ricke ---GA--CCA C-ACA----- CAGG-TGTTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Bordetella.bronc ---AC--CGG A-ACA----- CAGG-TGCTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Escherichi.coli ---AC--CGT G-AGA----- CAGG-TGCTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TTG--T GAAATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Haemophilu.influ ---AC--TTA G-AGA----- CAGG-TGCTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TTG--T GAAATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Thermus.therm ----C--CCT A-GCA----- CAGG-TGCTG -CA-TG-GCC G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-CCG--T GAGGTG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Thermotoga.marit G-G-A--GCC G-GCA----- CAGG-TGGTG -CA-CG-GCC G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-CCG--T GAGGTG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Zea.mays.CP A---C--GCG G-ACA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-CCG--T AAGGTG-TT- GGG-TTAAGT CTCGC-----
Chlamydomo.reinh.CP C---T--TGA --ACA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-CTG--T GAAGTG-TA- TAG-TTAAGT CTCAT-----
Euglena.graci.CP A---T--CTA G-ACA----- CAGG-TGGTG -CA-TG-GCT G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-TCG--T GAGATG-TT- GGG-TTAAGT CCCGC-----
Desulfuroc.mobil C-TGA-CGCG C-TGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--TC-GCC- AGC-TC---G -TG-CTG--T GAAGTG-TC- CGG-TTAAGT CCGGA-----
Sulfolobus.acido C-TGA-CTCG C-GGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--TC-GCC- AGC-TC---G -TG-TTG--T GAAATG-TC- CGG-TTAAGT CCGGC-----
Thermofilu.pende C-AGA-CGAG C-TGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--TC-GCC- GGC-TC---G -TG-CCG--T GAGGTG-TC- CTG-TTAAGT CAGGG-----
Thermoprot.tenax C-GGA-CGAG C-TGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--TC-GTC- AGC-TC---G -TG-CCG--T GAGGTG-TC- CGG-TTAAGT CCGGC-----
Halobacter.halob C-CGA-GGCT ACTGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--CC-GTC- AGC-TC---G -TA-CCG--T GAGGCG-TC- CTG-TTAAGT CAGGC-----
Halobacter.maris T-CGA-CGCT ACTGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--CC-GTC- AGC-TC---G -TA-CCG--T GAGGCG-TC- CTG-TTAAGT CAGGC-----
Halococcus.morrh T-TGA--GCC ACTGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--CC-GTC- AGC-TC---G -TA-CCG--T GAGGCG-TC- CTG-TTAAGT CAGGC-----
Natronobac.magad T-GGA-GGCT ATTGAG---- -AGG-AGGTG -CA-TG-GCC G--CC-GTC- AGC-TC---G -TA-CCG--T GAGGCG-TC- CTG-TTAAGT CAGGC-----
Methanococ.janna C-AGA-CGCG C-CGAG---- -AGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TC-GTC- AGC-TC---G -TA-CCG--T GAGGCG-TC- CTG-TTAAGT CAGGT-----
Methanococ.vanni C-TGA-AGCG C-TGAG---- -AGG-TGGTG -CA-TG-GCC A--TC-GTC- AGC-TC---G -TA-CCG--C GAGGCG-TC- CTG-TTAAGT CAGGT-----
Xenopus.laevi T-CGA-TTCT G-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--C GATTTG-TC- TGG-TTAATT CCGAT-----
Homo.sapie T-CGA-TTCC G-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--C GATTTG-TC- TGG-TTAATT CCGAT-----
Candida.albic T-TGA-TTTT G-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--T GATTTG-TC- TGC-TTAATT GCGAT-----
Saccharomy.cerev T-TGA-TTTT G-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TTTCTC- AGT-TG---G -TG-GAG--T GATTTG-TC- TGC-TTAATT GCGAT-----
Schizosacc.pombe T-TGA-TTCT A-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--T GATTTG-TC- TGC-TTAATT GCGAT-----
Oryza.sativ T-TGA-TTCT A-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--C GATTTG-TC- TGG-TTAATT CCGTT-----
Arabidopsi.thali T-TGA-TTCT A-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--C GATTTG-TC- TGG-TTAATT CCGTT-----
Fragaria.anana T-TGA-TTCT A-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--C GATTTG-TC- TGG-TTAATT CCGTT-----
Chlorella.ellip T-TGA-TTCT A-TGGG---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GGT--T GCCTTG-TC- AGG-TTGATT CCGGT-----
Euglena.graci T-TGA-TCTT G-TGGA---- -CGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--CT-CCT- GAT-TG---G -TG-GAG--T GATTTG-TC- TGG-TTGATT CCGAT-----
Entamoeba.histo A-TGA-TTTA T-TGGG---- -TAG-TGGTG -CA-TG-GCC G--TT-CTT- AGT-TG---G -TG-GAG--T GATTTG-TC- AGG-TTAATT CCGGT-----
Giardia.intes G-CGA-TCGC G-CGGG---- -CGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--CT-CCC- AGC-CC---G -TG-GCG--C GAGCCG-TC- TGC-TCCATT GCGAC-----
Trypanosom.bruce T-CGA-TCCC C-TGAA---- -TGG-TGGTG -CA-TG-GCC G--CT-TTT- GGT-CG---G -TG-GAG--T GATTTG-TT- TGG-TTGATT CCGTC-----
**************************************************************************************
4601
Mycobacter.lepra ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TG-- TCT-CATG-T TG-CCAGCA- CGTA------ ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TG-- TTC-TGTG-T TG-CCAGCA- TGCC------ ---TTCG--- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TG-- ATC-TTAG-T TG-CCAGCA- TT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TG-- TCT-TTAG-T TG-CCATCA- TT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TA-- TTG-TTAG-T TG-CCAGCA- TT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TA-- AGC-TTAG-T TG-CCATCA- TT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-CG-- CCC-TTAG-T TG-CCAGCA- TT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---AACGAG- CGCA------ ACCCC-CG-- TCC-TTAG-T TG-CTACCA- TT-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-CA-- TTC-TTAT-T TG-CCAGCG- GG-------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TG-- TCA-TTAG-T TG-CTACGA- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TA-- TCC-TTTG-T TG-CCAGCG- GTC------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TA-- TCC-TTTG-T TG-CCAGCG- ACT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---AACGAG- CGCA------ ACCCC-CG-- CCG-TTAG-T TG-CCAGCG- GTT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---AACGAG- CGCA------ ACCCC-TG-- CCC-CTAG-T TG-CCAGCG- GTT------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-CG-- TGT-TTAG-T TG-CCACTA- T--------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-CG-- TCT-TTAG-T TG-CCATTT- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---AACGAG- CGCA------ ACCCT-TT-- TTT-TTAA-T TA-ACG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---AACGAG- CGAG------ ACCCC-CA-- CCC-CTAG-T TG-CTACCC- GGGGC----- --TACG---- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---AACGAG- CGAG------ ACCCC-CA-- CCC-CTAG-T TG-GTATTC- TGGAC----- --TCCG---- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---AACGAG- CGAG------ ACCCC-CG-- CCC-CTAG-T TG-CTACCC- AGCCC----- --TTCG---- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---AACGAG- CGAG------ ACCCC-CA-- CCC-CTAG-T TG-CTACCC- CGCTC----- --TTCG---- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---AACGAG- CGAG------ ACCCG-CA-- CTC-CTAA-T TG-CCAGCG- GTACC----- --CTTT---- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---AACGAG- CGAG------ ACCCG-CA-- CTT-CTAG-T TG-CCAGCA- ATACC----- --CTTG---- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---AACGAG- CGAG------ ACCCG-CG-- TCC-CTAA-T TG-CCAGCA- GCAGC----- --CTTG---- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---AACGAG- CGAG------ ACCCG-CT-- CTC-CTAA-T TG-CCAGCA- ACGAC----- --CTTT---- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---AACGAG- CGAG------ ACCCG-TG-- CCC-CATG-T TG-CTACCT- CCTCC----- --GNCC---- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---AACGAG- CGAG------ ACCCG-TG-- CCC-TATG-T TG-CGACTA- CTTTC----- --TCCG---- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---AACGAA- CGAG------ ACTCC-TCC- ATG-CTAA-C TA-GTTACG- CGACC----- --C------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---AACGAA- CGAG------ ACTCT-GGC- ATG-CTAA-C TA-GTTACG- CGACC----- --C------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---AACGAA- CGAG------ ACCTT-AAC- CTA-CTAA-A TA-GTGCTG- CTAGC----- --A------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---AACGAA- CGAG------ ACCTT-AAC- CTA-CTAA-A TA-GTGGTG- CTAGC----- --A------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---AACGAA- CGAG------ ACCTT-AAC- CTG-CTAA-A TA-GCTGGA- TCAGC----- --CATT---- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---AACGAA- CGAG------ ACCTC-AGC- CTG-CTAA-C TA-GCTATG- CGGAG----- --C------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---AACGAA- CGAG------ ACCTC-AGC- CTG-CTAA-C TA-GCTACG- TGGAG----- --G------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---AACGAA- CGAG------ ACCTC-AGC- CTG-CTAA-C TA-GCTATC- GGGAG----- --G------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---AACGAA- CGAG------ ACCTC-AAC- CTG-CTAA-A TA-GTCACG- GTCGA----- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---AACGAG- TGAG------ ACATC-TG-- CCT-CCCA-C TA-GCCTGA- GGCTC----- --GCATTTGG TAGGGTTCGG CTGCTCGGTG GCAGCCCCCT
Entamoeba.histo ---AACGAA- CGAG------ ACTGA-AAC- CTA-TTAA-T TA-GTTTTC- TGCCT----- --A-TAAGAC AGAAATGTTC GCAAGAACAG GTGCGTAAGT
Giardia.intes ---AACGAG- CGAG------ ACCCC-GG-- CCG-CGGG-C G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---AACGGA- CGAG------ ATCCA-AG-- CTG-CCCA-G TA-GGTGCC- GGGAT----- --T-GTCCAC ACAGGACAGC A--GTCCCTC CGGCGGGGAT
*************************** ******
4701
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci GGCAA----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ACCACT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce TTTT------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
4801
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
4901
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
5001
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
5101
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --ATG----G TGGGGAC--- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GGGTG----A TGGGGAC--- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CAG----T TGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AAG----T TGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CAG----A TGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --AAG----T TGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CAG----T TGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --TAG----T TGAGCAC--- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- TAATG----C CGGGAAC--- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A AGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CGG----C CGGGAAC--- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --TGG----T CGGGAAC--- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CGG----C CGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --CGG----C CGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GAG----T TTGGAAC--- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --GGTTC--- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTTGTCA--- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GCTC-----C GGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GTCC-----A GAACCAC--- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GGGC-----T GGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GGGCG----G GGGGCAC--- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G GGTAG----C TGGGTAC--- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A GGTAG----T TGGGTAC--- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T GCTGG----C TGGGTAC--- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GGTGG----T TGGGTAC--- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G GGAG-----G AGNGCAC--- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GAAG-----G TAAGCAC--- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- --------CC G-GCGGTCGG CGT------- CCAACTT--- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- --------CC GAGCGGTCGG CGTCC----C CCAACTT--- ---------- ---------- ----------
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTTGC TGGTAT---A GTCACTT--- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTTGC TGGTTA---- TCCACTT--- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- -----TTGGC TGATCA---- TTAGCTT--- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---CATCCCT CCGCAG---- CTAGCTT--- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---CATCCCT TCACGG---- CCGGCTT--- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- -----T-CTC CTCGGG---- CCAGCTT--- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---TTTTTTC GGCTGG---- CCGACTT--- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci ---------- ----CAGGGG GAGATGTACC GGTGCATGCT CCCGAGAGCC TCCAG----T TCAGCTT--- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo ---------- TCTTAAAGGG ACACATTTCA ATTGTCCTAT TTTAATTGTA GTTAT----C TAATTTC-G- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce ---------- ---------- -TCCCCAACG GTGGTCGTCA -TCCTTCTTT TTACA----G GCCCCTT--- ---------- ---------- ----------
5201
Mycobacter.lepra --T-CGTGAG AG--A-CT-G CCG--CG--- --------GT ------CAA- ---------- -C-TCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Streptomyc.grise --T-CACAGG AG--A-CT-G CCG--GG--- --------GT ------CAA- ---------- -C-TCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-CGACG TCA--AGTC-
Bacillus.subti --T-CTAAGG TG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------CAA- ---------- -A-CCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AATC-
Lactobacil.delbr --T-CTAAAG AG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------CAA- ---------- -A-CCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Leuconosto.mesen --T-CTAGCG AG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------CAA- ---------- -A-CCG-GAG GA--AGGCG- GGGA-CGACG TCA--GATC-
Staphyloco.aureu --T-CTAAGT TG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------CAA- ---------- -A-CCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AATC-
Bartonella.bacil --T-CTAAGG GG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------TAA- ---------- -G-CCGAGAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Rhodopseud.palus --T-CTAAGG AG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------TAA- ---------- -G-CCGCGAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Rickettsia.ricke --T-ATAAGA AA--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------TAA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-CGACG TCA--AGTC-
Bordetella.bronc --T-CTAATG AG--A-CT-G CCG--GT--- --------GA ------CAA- ---------- -A-CCG-GAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Escherichi.coli --T-CAAAGG AG--A-CT-G CCA--GT--- --------GA ------TAA- ---------- -A-CTG-GAG GA--AGGTG- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Haemophilu.influ --T-CAAAGG AG--A-CT-G CCA--GT--- --------GA ------TAA- ---------- -A-CTG-GAG GA--AGGTN- GGGA-TGACG TCA--AGTC-
Thermus.therm --T-CTAACG GG--A-CT-G CCC--GC--- --------GA -------AA- ---------- -G-CGG-GAG GA--AGGAG- GGGA-CGACG TCT--GGTC-
Thermotoga.marit --T-CTAGGG GG--A-CT-G CCG--GC--- --------GA ------CGA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGAG- GGGA-TGACG TCA--GGTA-
Zea.mays.CP --C-CTGAAC AG--A-CC-G CCG--GT--- --------GT ------TAA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGAG- AGGA-TGAGG CCA--AGTC-
Chlamydomo.reinh.CP --T-CTAAAG AG--A-CT-G CCA--GT--- --------GT ------NAA- ---------- -G-CTG-GAG GA--AGGTG- AGGA-TGACG TCA--AGTC-
Euglena.graci.CP --T-TTAGAA AT--A-CT-G CTG--GT--- --------TA ------TT-- ---------- -A-CCG-GAG GA--AGGTG- AGGA-CGACG TCA--AGTC-
Desulfuroc.mobil --A-CTAGGG GG--A-CT-G CCG--CC--- --------GT T-----TAA- ---------- -G-GCG-GAG GA--AGGAG- GGGG-CCACG GCA--GGTC-
Sulfolobus.acido --A-CTAGGG GG--A-CT-G CCG--GC--- --------G- ------TAA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGAG- GGGG-CCACG GCA--GGTC-
Thermofilu.pende --T-CTAGGG GG--A-CT-G CCG--GC--- --------GA ------TAA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGTG- GGGG-CTACG GCA--GGTC-
Thermoprot.tenax --A-CTAGGG GG--A-CT-G CCG--GC--- --------G- ------TAA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGAG- GGGG-CGACG GCA--GGTC-
Halobacter.halob --A-TTAGGT GG--A-CT-G CCG--CT--- --------GC ------CAA- ---------- -A-GCG-GAG GA--AGGAA- CGGG-CAACG GTA--GGTC-
Halobacter.maris --A-CTAGGA GG--A-CT-G CCG--CT--- --------GC ------TAA- ---------- -A-GCG-GAG GA--AGGAA- CGGG-CAACG GTA--GGTC-
Halococcus.morrh --A-TTAGGG AG--A-CT-G CCG--TC--- --------GC ------TAA- ---------- -G-ACG-GAG GA--AGGAA- CGGG-CAACG GTA--GGTC-
Natronobac.magad --A-TTAGGA GG--A-CT-G CCG--CT--- --------GC ------CAA- ---------- -A-GCG-GAG GA--AGGAA- CGGG-CAACG GTA--GGTC-
Methanococ.janna --T-CATGGG GN--A-CC-G NCG--GC--- --------GC ------TAA- ---------- -G-CCG-GAG GA--AGGTG- CGGG-CAACG ACA--GGTC-
Methanococ.vanni --T-CATAGG GG--A-CC-G CTA--GC--- --------GC ------TAA- ---------- -G-CTA-GAG GA--AGGAG- CGGG-CAACG ATA--GGTC-
Xenopus.laevi --C-TTAGAG GG--A-CA-A GTG--GC--- --------GT ------TCA- ---------- -G-CCA-CAC GA--GATC-- -GAG-CAATA ACA--GGTC-
Homo.sapie --C-TTAGAG GG--A-CA-A GTG--GC--- --------GT ------TCA- ---------- -G-CCA-CCC GA--GATT-- -GAG-CAATA ACA--GGTC-
Candida.albic --C-TTAGAG GG--A-CT-A TCG--AC--- --------TC ------CAA- ---------- -G-TCG-ATG GA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Saccharomy.cerev --C-TTAGAG GG--A-CT-A TCG--GT--- --------TT ------CAA- ---------- -G-CCG-ATG GA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Schizosacc.pombe --C-TTAGAG GG--A-CT-A TTG--GC--- --------AT ------AAA- ---------- -G-CCA-ATG GA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Oryza.sativ --C-TTAGAG GG--A-CT-A TGG--CC--- --------GT ------TTA- ---------- -G-GCC-ACG GA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Arabidopsi.thali --C-TTAGAG GG--A-CT-A TGG--CC--- --------GT ------TTA- ---------- -G-GCC-AAG GA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Fragaria.anana --C-TTAGAG GG--A-CT-A TGG--CC--- --------GC ------TTA- ---------- ---GCG-AAC CA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Chlorella.ellip --C-TTAGAG GG--A-CT-G TTG--GC--- --------GA ------CTA- ---------- -G-CCA-ATG GA--AGTTT- GAGG-CAATA ACA--GGTC-
Euglena.graci --C-TCTGAG GT--G-CT-G TGT--CC--- --------GC C---A-CAAA ---------- -G-GGC-ATG CA--TGCTA- G-AGCCAACA GCA--GGTC-
Entamoeba.histo --G-TTAGA- ----C-CT-C TTT--T---- -----AACGT G---GGAAAA A--------- -G-AAA-AAG GA--AGCAT- TCAG-CAATA ACA--GGTC-
Giardia.intes -----CCGCG GG--A-CG-G CCC--GC--- ---------- G---C-GA-- ---------- -G-CGG-GAG GA--CGG-C- GGGG-CGATA GCA--GGTC-
Trypanosom.bruce --C-TCTGCG GG--A-TT-C CTT--GC--- -------TTT T---C-GC-- ---------- -G-CAA-GGT GA--GATTT- TGGG-CAACA GCA--GGTC-
************************ **************** ********************
5301
Mycobacter.lepra --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-TCCA-G G-GCT-TCAC ACATG-CTA- -CAATG---G CCGGTAC-AA A-GGG----- ---------- ----------
Streptomyc.grise --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-TCTT-G G-GCT-GCAC ACGTG-CTA- -CAATG---G CCGGTAC-AA T-GAG----- ---------- ----------
Bacillus.subti --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-ACCT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G ACAGAAC-AA A-GGG----- ---------- ----------
Lactobacil.delbr --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-ACCT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G GCAGTAC-AA C-GAG----- ---------- ----------
Leuconosto.mesen --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-ACCT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G CGTATAC-AA C-GAG----- ---------- ----------
Staphyloco.aureu --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-ATTT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G ACAATAC-AA A-GGG----- ---------- ----------
Bartonella.bacil --CTCATGG- CC-CTTA--- -CG-GGCT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G TGGTGAC-AG T-GGG----- ---------- ----------
Rhodopseud.palus --CTCATGG- CC-CTTA--- -CG-GGCT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G CGGTGAC-AA T-GGG----- ---------- ----------
Rickettsia.ricke --ATCATGG- CC-CTTA--- -CG-GGTT-G G-GCT-ACAC GCGTG-CTA- -CAATG---G TGTTTAC-AG A-GGG----- ---------- ----------
Bordetella.bronc --CTCATGG- CC-CTTA--- -TG-GGTA-G G-GCT-TCAC ACGTC-ATA- -CAATG---G TCGGGAC-AG A-GGG----- ---------- ----------
Escherichi.coli --ATCATGG- CC-CTTA--- -CG-ACCA-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G CGCATAC-AA A-GAG----- ---------- ----------
Haemophilu.influ --ATCATGG- CC-CTTA--- -CG-AGTA-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G CGTATAC-AG A-GGG----- ---------- ----------
Thermus.therm --AGCATGG- CC-CTTA--- -CG-GCCT-G G-GCG-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---C CCACTAC-AA A-GCG----- ---------- ----------
Thermotoga.marit --CTCGTGC- CC-CTTA--- -TG-CCCT-G G-GCG-ACAC ACGCG-CTA- -CAATG---G GCGGTAC-AA T-GGG----- ---------- ----------
Zea.mays.CP --ATCATGC- CC-CTTA--- -TG-CCCT-G G-GCG-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G GCGGGAC-AA A-GGG----- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP --AGCATGC- CC-CTTA--- -CA-TCCT-G G-GCT-TCAC ACGTA-ATA- -CAATG---G TTGGGAC-AA T-CAG----- ---------- ----------
Euglena.graci.CP --ATCATGC- CC-CTTA--- -TA-TCCT-G G-GCT-ACAC ACGTG-CTA- -CAATG---G TTAAGAC-AA T-AAG----- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil --AGCATGC- CC-CGAA--- -CC-CCCC-G G-GCT-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G CGGGGAC-AG C-GGG----- ---------- ----------
Sulfolobus.acido --AGCATGC- CC-CGAA--- -AC-TCCC-G G-GCC-GCAC GCGGG-TTA- -CAATG---G CAGGGAC-AA C-GGG----- ---------- ----------
Thermofilu.pende --AGTATGC- CC-CGAA--- -AC-CCCC-G G-GCT-ACAC GCGAG-CTG- -CAATG---G CGGGGAC-AG C-GGG----- ---------- ----------
Thermoprot.tenax --AGTATGC- CC-CGAA--- -AC-CCCG-G G-GCT-GCAC GCGAG-CTG- -CAATG---G CGGGGAC-AG C-GGG----- ---------- ----------
Halobacter.halob --AGTATGC- CC-CGAA--- -TG-GGCT-G G-GCA-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G TCGAGAC-AA T-GGG----- ---------- ----------
Halobacter.maris --AGTATGC- CC-CGAA--- -TG-GACC-G G-GCA-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G CTATGAC-AG T-GGG----- ---------- ----------
Halococcus.morrh --AGTATGC- CC-CGAA--- -TG-TGCC-G G-GCG-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G CCGAGAC-AG T-GGG----- ---------- ----------
Natronobac.magad --AGTATGC- CC-CGAA--- -TG-TGCT-G G-GCA-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G CCACGAC-AG T-GGG----- ---------- ----------
Methanococ.janna --CGCATGC- CC-CGAA--- -TC-CCCT-G G-GCT-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G CCGGGAC-AA T-GGG----- ---------- ----------
Methanococ.vanni --CGCATGC- CC-CGAA--- -TC-TCCT-G G-GCT-ACAC GCGGG-CTA- -CAATG---G CTAGGAC-AA T-GGG----- ---------- ----------
Xenopus.laevi T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -TG-TCCG-G G-GCT-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A ACGGATC-AG C-GTGT---- ---------- ----------
Homo.sapie T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -TG-TCCG-G G-GCT-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A CTGGCTC-AG C-GTGT---- ---------- ----------
Candida.albic T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -CG-TTCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A CGGAGCC-AG C-GAGT---- ---------- ----------
Saccharomy.cerev T-GTGATGC- CC-TTAGAA- -CG-TTCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A CGGAGCC-AG C-GAGT---- ---------- ----------
Schizosacc.pombe T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -TG-TTCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A CGGAGCC-AA C-GAGTTGAA AAAAAT---- ----------
Oryza.sativ T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -TG-TTCT-G G-GC--GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A TGTATCC-AA C-GAGT---- ---------- ----------
Arabidopsi.thali T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -TG-TTCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A TGTATTC-AA C-GAGT---- ---------- ----------
Fragaria.anana T-GTCATGC- CC-TTAGA-- -TG-TTCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---A TGTATTC-AA C-GAGT---- ---------- ----------
Chlorella.ellip T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -TG-TTCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-TTA- -CACTG---A TGCATTC-AA C-GAGC---- ---------- ----------
Euglena.graci T-GTGATGC- TC-CCAGA-- -TG-TCCT-G G-GCC-GCAC GCGCA-CTA- -CATTG---T CACAGTG-A- --AGGTGTCG ACATG-CCCA C---------
Entamoeba.histo T-GTGATGC- CC-TTAGA-- -CA-TCTT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CAATG---G AGTTACT-AG A-GAGTATTT ---TA-TCAT TTACA--CCT
Giardia.intes T-GTGATGC- CC-TCAGA-- -CG-CCCT-G G-GCC-GCAC GCGCG-CTA- -CACTG---G CGGGGCC-A- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce T-GTGATGC- TC-CTCAA-- -TG-TTCT-G G-GCG-ACAC GCGCA-CTA- -CAATG---T CAGTGAG-AA C-AAGAGTCC GAGCG-GCAC T---------
***************************************************************************
5401
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------T -GCGA--TGC CGC--AA-GG
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------T -GCGA--TGC -GC--GA-GG
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------A -GCGA--AAC CGC--GA-GG
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------A -GCGA--ACC CGC--GA-GG
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------T -GCCA--ACC CGC--GA-GG
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------A -GCGA--AAC CGC--GA-GG
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------A -GCGA--AAC CGC--AA-GG
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -GCTA--AGG GGC--GA-CC
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------A -GCAA--GAC GGC--GA-CG
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------C -GCCA--ACC CGC--GA-GG
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------A -GCGA--CCT CGC--GA-GA
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------A -GCGA--AGC TGC--GA-GG
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -GCCA--CCC GGC--AA-CG
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------T -GCGA--CCC CGC--GA-GG
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------C -GCGA--TCT CGC--GA-GG
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------A -GCGA--NCT CGT--GA-GN
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------T -GCAA--TTT TGT--GA-AA
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -CCGA--CCC CGA--AA-GG
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -GCTA--CCT CGA--AA-GG
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------T -CCGA--CCC CGA--AA-GG
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -CCGA--CCC CGA--AA-GG
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------A -GCCA--CTC CGA--GA-GG
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -GCAA--CGC CGA--GA-GG
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------C -GCTA--CCC CGA--GA-GG
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------T -GCAA--CGC CGA--AA-GG
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A ---------- ---------- ---------C -GCGA--CCC CGA--AA-GG
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------T -GCTA--CCC TGA--AA-AG
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ------GTCT ---------- ---------- ---------A CCCTG--CGC CGA--CA-GG
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ------GCCT ---------- ---------- ---------A CCCTA--CGC CGG--CA-GG
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- -------ATA ---------- ---------- ---------A GCCTT--GGC CGA--GA-GG
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- --------CT ---------- ---------- ---------A ACCTT--GGC CGA--GA-GG
Schizosacc.pombe ---------- -CTTTT---- ---------- ---------- --GATTTTTT ---------- ---------- ---------A TCCTT--GGC CGG--AA-GG
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ------ATAT ---------- ---------- ---------A GCCTG--GTC CGA--CA-GG
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ------TCAC ---------- ---------- ---------A -CCTT---GC CGA--CA-GG
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ------CTAT ---------- ---------- ---------A GCCTT--GGC CGA--CC-A-
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- --------CT ---------- ---------- ---------A TCCTT--GAC CGA--GA-GG
Euglena.graci ---------- -TCCG----- ---------- ------GTGG GC-------- ---------- ---------- ---------- -CCTG--GCC TGA--AG-AG
Entamoeba.histo TATTTATTAG GC-TTT---- -GTCTAATAA TTAAGGATAG TAAGTGGT-G ---------- ---------- ---------T ACCGA--GAT TGA--AATAG
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GCCGG-CGCG CGC--GA-GG
Trypanosom.bruce ---------- --TCAC---- ---------- --------AA TGTCGCTC-C ---------- ---------- ---------C GCTTG--A-T CAA--AA-GA
*******************
5501
Mycobacter.lepra TTA---AGCG -A-------- -ATC-CT--- ---T--TTAA AGCCGGT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- CGGGGTC--- ---------- ----------
Streptomyc.grise CGG---AGCG -A-------- -ATC-TC--- ------AAAA AGCCGGT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGGGGTC--- ---------- ----------
Bacillus.subti TTA---AGCC -A-------- -ATC-CC--- ------ACAA ATCTGTT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- CGCAGTC--- ---------- ----------
Lactobacil.delbr GTA---AGCG -G-------- -ATC-TC--- ------TTAA AGCTGYT-CT -CAGTTC--- -----GGAC- TGCAGGC--- ---------- ----------
Leuconosto.mesen GTG---AGCT -A-------- -ATC-TC--- ------TTAA AGTACGT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGTAGTC--- ---------- ----------
Staphyloco.aureu TCA---AGCA -A-------- -ATC-CC--- ------ATAA AGTTGTT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGTAGTC--- ---------- ----------
Bartonella.bacil TCG---AGCT -A-------- -ATC-TC--- ------CAAA -AGCCAT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGCACTC--- ---------- ----------
Rhodopseud.palus CTT---CGCA -A-------- -ATC-TC--- ------AAAA -AACCGT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGGAGTC--- ---------- ----------
Rickettsia.ricke TGG---AGCA -A-------- -ATC-CC--- ------TAAA -AGACAT-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGTTCTC--- ---------- ----------
Bordetella.bronc GGG---AGCC -A-------- -ATC-CC--- ------AGAA ACCCGAT-CG -TAGTCC--- -----GGAT- CGCAGTC--- ---------- ----------
Escherichi.coli GCA---AGCG -G-------- -ACC-TC--- ------ATAA AGTGCGT-CG -TAGTCC--- -----GGAT- TGGAGTC--- ---------- ----------
Haemophilu.influ TGG---AGCG -A-------- -ATC-TC--- ------ATAA AGTACGT-CT -AAGTCC--- -----GGAT- TGGAGTC--- ---------- ----------
Thermus.therm GGG---AGCT -A-------- -ATC-GC--- ------AAAA AGGTGGG-CC -CAGTTC--- -----GGAT- TGGGGTC--- ---------- ----------
Thermotoga.marit GGG---AGCC -A-------- -ATC-CC--- -------CAA AGCCGCC-CT -CAGTTC--- -----GGAT- CGCAGGC--- ---------- ----------
Zea.mays.CP GTG---AGCT -A-------- -ACT-CC--- ------AAAA ACCCGTC-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGCAGGC--- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP NNN---AGCT -A-----GCG GCTC-TG--- ------TTAA ACCCAAC-CT -CAGTTC--- -----GGAT- TGTAGGC--- ---------- ----------
Euglena.graci.CP ATG---AGCT -A-------- -ATC-TT--- -------AAA ACTTAGC-CT -AAGTTC--- -----GGAT- TGTAGGC--- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil GGG---AGGC -A-------- -ATC-CC--- ------TCAA ACCCCGC-CG -TGGTTG--- -----GGAT- CGAGGGC--- ---------- ----------
Sulfolobus.acido GGG---AGCC -A-------- -ATC-CT--- -------TAA ACCCTGC-CG -CAGTTG--- -----GGAT- CGAGGGC--- ---------- ----------
Thermofilu.pende GGG---AGGT -A-------- -ATC-CC--- ------TTAA ACCCCGC-CT -CAGTAG--- -----GAAT- CGAGGGC--- ---------- ----------
Thermoprot.tenax GGG---AGGC -A-------- -ATC-CC--- ------GTAA ACCCCGC-CC -CAGTAG--- -----GGAT- CGAGGGC--- ---------- ----------
Halobacter.halob AGG---CGCT -A-------- -ATC-TC--- ------CTAA ACTCGAT-CG -TAGTTC--- -----GGAT- TGAGGGC--- ---------- ----------
Halobacter.maris CGA---CGCT -A-------- -ATC-TC--- ------C-AA ACGTAGT-CG -TAGTTC--- -----GGAT- TGCGGGC--- ---------- ----------
Halococcus.morrh GGA---CGCT -A-------- -ATC-TC--- ------CTAA CCTCGGT-CG -TAGTTC--- -----GGAT- TGCGGGT--- ---------- ----------
Natronobac.magad CGA---CGCT -A-------- -ATC-TC--- ------CTAA ACGTGGT-CG -TACTTC--- -----GGAT- TGAGGGC--- ---------- ----------
Methanococ.janna GGG---AGCG -A-------- -ATC-CC--- ------CTAA ACCGGGT-CG -TAGTCC--- -----GGAT- CGAGGGC--- ---------- ----------
Methanococ.vanni GGA---CGCG -A-------- -ATC-TC--- ------CGAA ACCTAGT-CG -TAGTTC--- -----GGAT- CGTGGGC--- ---------- ----------
Xenopus.laevi TGC---GGGT -A-------- -ACC-CG--- ---C--TGAA CCCCGTT-CG -TGATAG--- -----GGAT- CGGGGAT--- ---------- ----------
Homo.sapie CGC---GGGT -A-------- -ACC-CG--- ---T--TGAA CCCCATT-CG -TGATGG--- -----GGAT- CGGGGAT--- ---------- ----------
Candida.albic TCT---GGGA -A-------- -ATC-TT--- ---G--TGAA ACTCCGT-CG -TGCTGG--- -----GGAT- AGAGCAT--- ---------- ----------
Saccharomy.cerev TCT---TGGT -A-------- -ATC-TT--- ---G--TGAA ACTCCGT-CG -TGCTGG--- -----GGAT- AGAGCAT--- ---------- ----------
Schizosacc.pombe TCT---GGGT -A-------- -ATC-TT--- ---G--TTAA ACTCCGT-CG -TGCTGG--- -----GGAT- AGAGCAT--- ---------- ----------
Oryza.sativ CCC---GGGT -A-------- -ATC-TT--- ---G--GGAA ATTTCAT-CG -TGATGG--- -----GGAT- AGATCAT--- ---------- ----------
Arabidopsi.thali CCC---GGGT -A-------- -ATC-TT--- ---T---GAA ATTTCAT-CG -TGATGG--- -----GGAT- AGATCAT--- ---------- ----------
Fragaria.anana -CG---GGGT -A-------- -ATC-TT--- ---T---GAA ATTTCAT-CG -TGATGG--- -----GGAT- AGATCAT--- ---------- ----------
Chlorella.ellip TCC---GGGT -A-------- -ATC-TG--- ------CGAA ACTGCAT-CG -TGATGG--- -----GGAT- AGATTAT--- ---------- ----------
Euglena.graci GCT---GGGA -A-------- -ATC-CT--- ---G--CAAG CCTGTGA-CG -TACTGG--- -----GGAT- AGATGGT--- ---------- ----------
Entamoeba.histo TTA---AGGA -A-------- -AAC-TC--- -------AAA AGAACGTACA -TGACAG--- -----GGAT- AAATGAT--- ---------- ----------
Giardia.intes ACGCG-CGGA -G-------- ---------- ---------- CCCCCGC-CG -TGGCCG--- -----GGAC- CGCGGGC--- ---------- ----------
Trypanosom.bruce -GC---GGGG -A-------- -AAC-CA-CG ---G--AATC ACGTAGA-CC -CACTTG--- -----GGAC- CGAGTAT--- ---------- ----------
*****************************
5601
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACCC C-GT-GAAG- TCGGAGTCGC TAG-TAAT-C GCAGATC-AG CA-----ACG CT-GCGG-T-
Streptomyc.grise ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACCC C-AT-GAAG- TCGGAGTTGC TAG-TAAT-C GCAGATC-AG CA-----TTG CT-GCGG-T-
Bacillus.subti ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTG C-GT-GAAG- CTGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG C------ATG CC-GCGG-T-
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-CCTG C-AC-GAAG- CTGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG C------ACG CC-GCGG-T-
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTA C-AT-GAAG- TCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG C------ACG CC-GCGG-T-
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTA C-AT-GAAG- CTGGAATCGC TAG-TAAT-C GTAGATC-AG C------ATG CT-ACGG-T-
Bartonella.bacil ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-AGTG C-AT-GAAG- TCGGAATCGC TAG-TAAT-C GTGGATC-AG C------ATG CC-ACGG-T-
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTC C-AT-GAAG- TTGGAATCGC TAG-TAAT-C GTGGATC-AG C------ATG CC-ACGG-T-
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-AGAG C-AT-GAAG- TTGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG C------ATG CC-GCGG-T-
Bordetella.bronc ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTG C-GT-GAAG- TCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG C------ATG TC-GCGG-T-
Escherichi.coli ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTC C-AT-GAAG- TCGGAATCGC TAG-TAAT-C GTGGATC-AG A------ATG CC-ACGG-T-
Haemophilu.influ ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-ACTC C-AT-GAAG- TCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGAATC-AG A------ATG TC-GCGG-T-
Thermus.therm ---------- ---------- ----TGCAAC C--CG-ACCC C-AT-GAAG- CCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG CC-----ATG CC-GCGG-T-
Thermotoga.marit ---------- ---------- ----TGCAAC C--CG-CCTG C-GT-GAAG- CCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCGGATC-AG CC-----ATG CC-GCGG-T-
Zea.mays.CP ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-CCTG C-AT-GAAG- CAGGAATCGC TAG-TAAT-C GCCGGTC-AG CC-----ATA CG-GCGG-C-
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-CCTA C-AT-GAAG- CCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCCAGTC-AG CT-----ATA TG-GCGG-T-
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ----TGAAAC T--CG-CCTA C-AT-GAAG- CCGGAATCGC TAG-TAAT-C GCCGGTC-AG CT-----ATA CG-GCGG-T-
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-CCCT C-GT-GAAC- GAGGAATCCC TAG-TAAC-C GCGCGTC-AA C------ATC GC-GCGG-T-
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ----TGAAAC C--CG-CCCT C-GT-GAAC- GAGGAATCCC TAG-TAAC-C GCGGGTC-AA C------AAC CC-GCGG-T-
Thermofilu.pende ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-CCCT C-GT-GAAC- GTGGAATCCC TAG-TAAC-C GCGTGTC-AC C------AAC GC-GCGG-T-
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ----TGCAAC T--CG-CCCT C-GT-GAAC- GTGGAATCCC TAG-TAAC-C GCGTGTC-AC C------AAC GC-GCGG-T-
Halobacter.halob ---------- ---------- ----TGAAAC T--CG-CCCT C-AT-GAAG- CTGGATTCGG TAG-TAAT-C GCGTGTC-AG C------AGC GC-GCGG-T-
Halobacter.maris ---------- ---------- ----TGAAAC C--CG-CCCG C-AT-GAAG- CTGGATTCGG TAG-TAAT-C GCGTGTC-AG A------AGC GC-GCGG-T-
Halococcus.morrh ---------- ---------- ----TGAAAC C--CA-CCCG C-AT-GAAG- CTGGATTCGG TAG-TAAT-C GCATTTC-AG A------AGA GT-GCGG-T-
Natronobac.magad ---------- ---------- ----TGAAAC T--CG-CCCT C-AT-GAAG- CTGGATTCGG TAG-TAAT-C GCGCCTC-AG A------AGG GC-GCGG-T-
Methanococ.janna ---------- ---------- ----TGTAAC T--CG-CCCT C-GT-GAAG- CCGGAATCCG TAG-TAAT-C GCGCCTC-AC C------ATG GC-GCGG-T-
Methanococ.vanni ---------- ---------- ----TGTAAC T--CG-CCCA C-GT-GAAG- CTGGAATCCG TAG-TAAT-C GCAGTTC-AT A------ATA CT-GCGG-T-
Xenopus.laevi ---------- ---------- ----TGCAAT T--AT-TTCC C-AT-GAAC- GAGGAATTCC CAG-TAAG-T GCGGGTC-AT A------AGC TC-GCGT-T-
Homo.sapie ---------- ---------- ----TGCAAT T--AT-TCCC C-AT-GAAC- GAGGAATTCC CAG-TAAG-T GCGGGTC-AT A------AGC TT-GCGT-T-
Candida.albic ---------- ---------- ----TGTAAT T--GT-TGCT C-TT-CAAC- GAGGAATTCC TAG-TAAG-C GCAAGTC-AT C------AGC TT-GCGT-T-
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ----TGTAAT T--AT-TGCT C-TT-CAAC- GAGGAATTCC TAG-TAAG-C GCAAGTC-AT C------AGC TT-GCGT-T-
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ----TGCAAT T--AT-TGCT C-TT-CAAC- GAGGAATTCC TAG-TAAG-C GCAAGTC-AT C------AGC TT-GCGT-T-
Oryza.sativ ---------- ---------- ----TGCAAT T--GT-TGGT C-TT-CAAC- GAGGAATGCC TAG-TAAG-C GCGAGTC-AT C------AGC TC-GCGT-T-
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ----TGCAAT T--GT-TGGT C-TT-CAAC- GAGGAATTCC TAG-TAAG-C GCGAGTC-AT C------AGC TC-GCGT-T-
Fragaria.anana ---------- ---------- ----TGCAAT T--GT-TGGT C-TT-CAAC- GAGGAATTCC TAG-TAAG-C GCGAGTC-AT C------AGC TC-GCGT-T-
Chlorella.ellip ---------- ---------- ----TGCAAT T--AT-TAAT C-TT-CAAC- GAGGAATGCC TAG-TAAG-C GCAAGTC-AT C------AGC TT-GCGT-T-
Euglena.graci ---------- ---------- ----TGCAAC T--GT-CTGC C-TT-GAAC- GTGGAATGCC TAG-TATG-C CTGGGTC-AT C------AGC CC-AGAC-C-
Entamoeba.histo ---------- ---------- ----TGGAAT T--AT-TTGT T-TT-GAAC- GAGGAATTCC TTG-TAAT-A TCGAGTC-AT T------AAC TC-GAGA-T-
Giardia.intes ---------- ---------- ----TGGAAC G-----CCCC C-GC-GCAC- CAGGAATGTC TTG-TAGG-C GCCCGCC-CC C------ACC GC-GCGC-C-
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ----TGCAAT T--AT-TGGT C-GCGCAAC- GAGGAATGTC TCG-TAGG-C GCAGCTC-AT C------AAA CT-GTGC-C-
***********************************************************************************
5701
Mycobacter.lepra GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CG--TCA TG-AAA--G- -TCGGTAAC- ACC--CGA-- ----AGC-CA GTG-GCC-TA
Streptomyc.grise GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CG--TCA CG-AAA--G- -TCGGTAAC- ACC--CGA-- ----AGC-CG GTG-GCC-CA
Bacillus.subti GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA CG-AGA--G- -TTTGTAAC- ACC--CGA-- ----AGT-CG GTG-AGG-TA
Lactobacil.delbr GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GAA--G- -TCTGCAAT- GCC--CAA-- ----AGT-CG GTG-AGA-TA
Leuconosto.mesen GAATAC-GTT -CCCGGGTCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GGA--G- -TTTGTAAT- GCC--CAA-- ----AGC-CG GTG-GCC-TA
Staphyloco.aureu GAATAC-GTT -CCCGGGTAT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA CG-AGA--G- -TTTGTAAC- ACC--CGA-- ----AGC-CG GTG-GAG-TA
Bartonella.bacil GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GGA--G- -TTGGTTTT- ACC--CGA-- ----AGG-TG CTG-TGC-TA
Rhodopseud.palus GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GGA--G- -TTGGTTCT- ACC--TGA-- ----AGG-CA GTG-CGC-TA
Rickettsia.ricke GAATAC-GTT -CTCGGGCCT -TGTACACAC TG-CCCGTCA ---CG--CCA TG-GGA--G- -TTAGTTTT- ACC--TGA-- ----AGG-TG GTG-AGC-TA
Bordetella.bronc GAATAC-GTT -CCCGGGTCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GGA--G- -TGGGTTTT- ACC--AGA-- ----AGT-AG TTA-GCC-TA
Escherichi.coli GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GGA--G- -TGGGTTGC- AAA--AGA-- ----AGT-AG GTA-GCT-TA
Haemophilu.influ GAATAC-GTT -CCCGGGCNT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GGA--G- -TGGGTTGT- ACC--AGA-- ----AGT-AG ATA-GCT-TA
Thermus.therm GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CG--CCA TG-GGA--G- -CGGGCTCT- ACC--CGA-- ----AGT-CG CCG-GGA-GC
Thermotoga.marit GAATAC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CG--CCA CC-CGA--G- -TCGGGGGC- TCC--CGA-- ----AGA-CA CCT---A-CC
Zea.mays.CP GAATCC-GTT -CCCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CTA TA-GGA--G- -CTGGCCAG- GTT--TGA-- ----AGT-CA TTA-CCCTTA
Chlamydomo.reinh.CP GAATAC-GTT -CCCGGGTCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GAA--G- -CTGGTTCT- GCT--CCA-- ----AGT-CG TTA-C-CCTA
Euglena.graci.CP GAATAC-GTT -CTCGGGCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA TG-GAA--G- -TCGGCTGT- GCC--CGA-- ----AGT-TA TTA-T-CTTG
Desulfuroc.mobil GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCA CC-CGA--G- -GGGAGGGG- GAG--TGA-- -----GG-CC CGG-CCC---
Sulfolobus.acido GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCA CC-CGA--G- -CGAGAAAG- GGG--TGA-- -----GG-TC CCT-TGC---
Thermofilu.pende GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCA CC-CGA--G- -GGAGGCCT- AGG--TGA-- -----GG-CC TCC-TGCC--
Thermoprot.tenax GAATAC-GTC -CCTGCCCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCG ---CA--CCA CC-CGA--G- -GGAGTTCT- CTG--CGA-- -----GG-CC CCT-CGCTTG
Halobacter.halob GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCA ---AA--TCA CC-CGA--G- -TGGGGTTC- GGA--TGA-- -----GG-CC GGC-------
Halobacter.maris GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCA ---AA--GCA CC-CGA--G- -TGGGGTCC- GGA--TGA-- -----GG-CC GTC-------
Halococcus.morrh GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCA ---AA--TCA CC-CGA--G- -TGAGGTCC- GGA--TGA-- -----GG-CC GGC-G-----
Natronobac.magad GAATAC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCA ---AA--GCA CC-CGA--G- -TGGGGTCC- GGA--TGA-- -----GG-CC CGG-------
Methanococ.janna GAATGC-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCA ---CG--CCA CC-CGA--G- -TTGAGCCC- AAG--TGA-- -----GG-CC CTG-TCC---
Methanococ.vanni GAATGT-GTC -CCTGCTCCT -TGCACACAC CG-CCCGTCA ---CA--CCA CC-CGA--G- -TTGGGTTC- AGG--TGA-- -----GG-CC TTG-GCC---
Xenopus.laevi GATTAA-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--ACT AC-CGA-TT- -GGATGGTT- TAG--TGA-- -----GG-TC CTC-GGATCG
Homo.sapie GATTAA-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--ACT AC-CGA-TT- -GGATGGTT- TAG--TGA-- -----GG-CC CTC-GGATCG
Candida.albic GATTAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--ACT AC-CGA-TT- -GAATGGCT- TAG--TGA-- -----GG-CC TCC-GGATTG
Saccharomy.cerev GATTAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--AGT AC-CGA-TT- -GAATGGCT- TAG--TGA-- -----GG-CC TCA-GGATCT
Schizosacc.pombe GAATAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--ACT AC-CGA-TT- -GAATGGCT- TAG--TGA-- -----GG-CC TCT-GGATTG
Oryza.sativ GACTAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCT AC-CGA-TT- -GAATGGTC- CGG--TGA-- -----AG-TG TTC-GGATCG
Arabidopsi.thali GACTAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCT AC-CGA-TT- -GAATGATC- CGG--TGA-- -----AG-TG TTC-GGATCG
Fragaria.anana GACTAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCT AC-CGA-TT- -GAATGGTC- CGG--TGA-- -----AGTTG TTC-GGATCG
Chlorella.ellip GATTAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCT AC-CGA-TT- -GGATGTGC- TGG--TGA-- -----AG-CG TCC-GGACTG
Euglena.graci GATTGT-GTC -CCTGCCATT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---TT--GCT AC-CGA-T-- -GGTGGCTG- GAT--AGA-- -----GT-CA TCA-GGAGGT
Entamoeba.histo GAATAC-GTC -CCTGCCCTT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCT AC-CGA-TT- -GAATAAAG- AGG--TGA-- -----AA-TT CTA-GGATTC
Giardia.intes GGACGC-GTC -CCTGCCCCT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---CT--CCT AC-CGA-CT- -GGGCGCGG- CGG--CGA-- -----GC-GC CCC-GGAC--
Trypanosom.bruce GATTAC-GTC -CCTGCCATT -TGTACACAC CG-CCCGTCG ---TT--GTT TC-CGA-T-- -GATGGTGC- AAT--ACA-- -----GG-TG ATC-GGACCG
**
5801
Mycobacter.lepra ACC------- ---------- ---------- ---------- --CTCG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise ACCC------ ---------- ---------- ---------- --CTTGT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti ACCT------ ---------- ---------- ---------- --TTT----- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr ACCT------ ---------- ---------- ---------- --TTAT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen ACCT------ ---------- ---------- ---------- --TTT----- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu ACC------- ---------- ---------- ---------- -TTTTA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil ACC------- ---------- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus ACCC------ ---------- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke AC-------- ---------- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc ACC------- ---------- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli ACC------- ---------- ---------- ---------- -TTCG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ ACC------- ---------- ---------- ---------- --TTTT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm C--------- ---------- ---------- ---------- --TACG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit CCAACCC--- ---------- ---------- ---------- --GAAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP ACC------- ---------- ---------- ---------- --GTAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP ACCTT----- ---------- ---------- ---------- ---CGG---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP CCT------- ---------- ---------- ---------- --GAAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---CTT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- -GATAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- -GACGA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax GG-------- ---------- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- --ATGC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- --ATGC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---CAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- --TTTA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- --TTT----- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi GCCCCGCCGG GGTCG----- ---------- ---------- --GCCA---- ---------- ---------- CGGCCCT-GG CG-------- ----------
Homo.sapie GCCCCGCCGG GGTCG----- ---------- ---------- --GCCCA--- ---------- ---------- CGGCCCT-GG CG-------- ----------
Candida.albic GTTT-AGGAA AGGGG----- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- --CTCCA-TT CT-------- ----------
Saccharomy.cerev GCTT-AGAGA AGGGG----- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- --CTCCA-TC TC-------- ----------
Schizosacc.pombe GCTT-GTTTC TGCTG----- ---------- ---------- --GCAA---- ---------- ---------- --CGGCG-GA AA-------- ----------
Oryza.sativ CGGCGACGGG GGCGG----- ---------- ---------- --TTCG---- ---------- ---------- --CCGCC-CC CG-------- ----------
Arabidopsi.thali CGGCGACGTG GGTGG----- ---------- ---------- --TTCG---- ---------- ---------- --CCGCC-CG CG-------- ----------
Fragaria.anana CGGCGACGGG GGGCCGG--- ---------- ---------- --TTCG---- ---------- ---------- --CTGCC-CG CG-------- ----------
Chlorella.ellip GTAA-CAGGT GACGG----- ---------- ---------- -TTCG----- ---------- ---------- --CCGC--TG CC-------- ----------
Euglena.graci TGTGGAGGCG GCCTCT---- ---------- ---------- ---CGG---- ---------- ---------- --GGCAG-TA GA-------- ---------G
Entamoeba.histo TGTCT----- ---------- ---------- ---------- ---TAT---- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- --GCG----- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce TCGCTCG--- ---------- ---------- ---------- --TCT----- ---------- ---------- ---------C GG-------- ----------
5901
Mycobacter.lepra --------GG AG-GGA---- ---------- ---------- GCTGTCC--A AGG----TGG -GAT-CGGCG --ATTGGGA- CGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Streptomyc.grise -------GGG AG-GGA---- ---------- ---------- GCTGTCG--A AGG----TGG -GAC-TGGCG --ATTGGGA- CGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Bacillus.subti -------AGG AG-CCA---- ---------- ---------- GCCGCCG--A AGG----TGG -GAC-AGATG --ATTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Lactobacil.delbr -------AGG AG-TCA---- ---------- ---------- GCCGCCT--A AGG----CAG -GGC-AGATG --ACNGGGO- OOOOO-OOOO OOOOO-OOOO
Leuconosto.mesen -------AGG AA-GGA---- ---------- ---------- GCCGTCT--A AGG----CAG -GAC-AGATG --ACCGGGG- OOOOO-OOGT AACAA-GOOO
Staphyloco.aureu --------GG AG-CTA---- ---------- ---------- GCCGTCG--A AGG----TGG -GAC-AAATG --ATTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Bartonella.bacil --------GG AA-GCA---- ---------- ---------- GGCAACC--A CGG----TAG -GGT-CAGCG --ACTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Rhodopseud.palus --------GG AG-GCA---- ---------- ---------- GCTGACC--A CGG----TAG -GGT-CAGCG --ACTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Rickettsia.ricke ---------G AG-GCA---- ---------- ---------- GCCAACC--A CGG----TAA -AAT-TAGCG --ACTGGGG- TGAAG-TCGT AAOOO-OOOO
Bordetella.bronc --------GG GG-GGC---- ---------- ---------- GATTACC--A CGG----TAG -GAT-TCATG --ACTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Escherichi.coli --------GG AG-GGC---- ---------- ---------- GCTTACC--A CTT----TGT -GAT-TCATG --ACTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Haemophilu.influ --------GG AG-GGC---- ---------- ---------- GTTTACC--A CGG----TAT -GAT-TCATG --ACTGGGG- OOOOO-OOOO OOOOO-OOOO
Thermus.therm ---------- -G-GCA---- ---------- ---------- GGCGCCG--A GGG----TAG -GGC-CCGTG --ACTGGGG- CGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Thermotoga.marit ------GGGA GG-GGG---- ---------- ---------- GGTGTCG--A GGG----AGA -ACC-TGGCG --AGGGGGG- CGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Zea.mays.CP --------GG AG-GGG---- ---------- ---------- GATGCCT--A AGG----CTA -GGC-TTGCG --ACTGGAG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Chlamydomo.reinh.CP ------GAGG -G-GGG---- ---------- ---------- CNNGCCT--A AAG----CAG -GGC-TAGTG --ACTAGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Euglena.graci.CP --------AG AG-GGA---- ---------- ---------- AATACCT--A AGG----CCT -GGC-TGGTG --ACTGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Desulfuroc.mobil ---------- GG-GT----- ---------- ---------- CGGGTCG--A ACT----CCC -CCT-CCCTG --AGGGGGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Sulfolobus.acido ---------- GT-GG----- ---------- ---------- GGGATCG--A ACT----CCT -TTC-CCGCG --AGGGGGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Thermofilu.pende ---------G GT-GG----- ---------- ---------- GAGGTCG--A ACC----TGG -GCC-TCCCA --AGGGGGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTG
Thermoprot.tenax -----CCCAG GT-GG----- ---------- ---------- GGGGACG--A GCA----GAG -AAC-TCCCG --AGGGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Halobacter.halob ---------- ----G----- ---------- ---------- CTGGTCA--A ATC----TGG -GCT-CCGCA --AGGGGGA- TTAAG-TCGT AACAA-GGTA
Halobacter.maris ---------- ----G----- ---------- ---------- ACGGTCG--A ATC----TGG -GCT-CCGCA --AGGGGGC- TTAAG-TCGT AACAA-GGTA
Halococcus.morrh ---------- ---CG----- ---------- ---------- CCGGTCG--A ATC----TGG -GCT-TCGCA --AGGGGGA- TTAAG-TCGT AACAA-GGTA
Natronobac.magad ---------- ----C----- ---------- ---------- CGGGTCG--A ATC----TGG --CT-CCGCA --AGGGGGC- TTAAG-TCGT AACAA-GGTA
Methanococ.janna ---------- GG-GC----- ---------- ---------- AGGGTCG--A ACT----TGG -TAA-CAAOO --OOOOOOO- OOOOO-OOOO OOOOO-OOOO
Methanococ.vanni ---------- GG-CT----- ---------- ---------- AGGGTCG--A ACC----TGG -GCT-CAGCG --AGGGGGG- TGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Xenopus.laevi -GAGC-GCCG AG-AAG---- ---------- ---------- ACGATCA--A ACT----TGA -CTA-TCTAG --AGGAAGT- AAAAG-TCGT AACAA-GGTT
Homo.sapie -GAGC-GCTG AG-AAG---- ---------- ---------- ACGGTCG--A ACT----TGA -CTA-TCTAG --AGGAAGT- AAAAG-TCGT AACAA-GGTT
Candida.albic -G-GA-ACCG AG-AAG---- ---------- ---------- CTGGTCA--A ACT----TGG -TCA-TTTAG --AGGAAGT- AAAAG-TCGT AACAA-GGTT
Saccharomy.cerev -A-GA-GCGG AG-AAT---- ---------- ---------- TTGGACA--A ACT----TGG -TCA-TTTAG --AGGAACT- AAAAG-TCGT AACAA-GGTT
Schizosacc.pombe -C-ATTGCCG AG-AAG---- ---------- ---------- TTGGACA--A ACT----TGG -TCA-TTTAG --AGGAAGT- AAAAG-TCGT AACAA-GGTT
Oryza.sativ -ACGT-CGCG AG-AAG---- ---------- ---------- TCCATTG--A ACC----TTA -TCA-TTTAG --AGGAAGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTT
Arabidopsi.thali -ACGT-CGCG AG-AAG---- ---------- ---------- TCCACTA--A ACC----TTA -TCA-TTTAG --AGGAAGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTT
Fragaria.anana -ACGT-CGCG AG-AAG--T- ---------- ---------- TCCACTG--A ACC----TTA -TCA-TTTAG --AGGAAGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTT
Chlorella.ellip -TGCT-TCCG GG-AAG---- ---------- ---------- TTCGTTA--A ACC----CTC -CCA-TCTAG --AGGAAGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTT
Euglena.graci CATCCCAGCC GA-AAT---- ---------- ---------- TGGAC-G--A TGT----CCA -GCC-ACTAG --AGGAAGC- AAAAG-TCGT AACAA-GGTT
Entamoeba.histo --AGA-TAGA AA-AAT---- ---------- ---------- GGATTTA--A ATC----TCC -TTA-TTTAG --AGGAAGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTT
Giardia.intes ---------- CG-AAG---- ---------- ---------- GGCCGCG--A GCC----CCC -GCG-CCTGG --AGGAAGG- AGAAG-TCGT AACAA-GGTA
Trypanosom.bruce -GC---GACC GA-AAG---- ---------- ---------- TTCACCG--A TAT----TGC -TTC-AATAG --AGGAAGC- AAAAG-TCGT AACAA-GGTA
6001
Mycobacter.lepra G-CCGT-ACC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTTC T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Streptomyc.grise G-CCGT-ACC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTTC T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bacillus.subti G-CCGT-ATC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTTC T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Lactobacil.delbr O-OOOO-OOO OOOO-OOO-O OOOOOOOOOO OOOOOOOOOO O--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Leuconosto.mesen O-OOOO-OOO OGAA-CCT-G OOOOOOGATC ACCTCCTTTC T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Staphyloco.aureu G-CCGT-ATC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTTC T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bartonella.bacil G-CCGT-AGG -GAA-CCT-G CGGCTGGATC ACCT------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rhodopseud.palus G-CCGT-AGG GGAA-CCT-G CGGCTGGATC OOOOOOOOOO O--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Rickettsia.ricke O-OOOO-OOO OOOO-OOO-O OOOOOOOOOO OOOOOOOOO- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Bordetella.bronc G-CCGT-ATC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTT- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Escherichi.coli A-CCGT-AGG GGAA-CCT-G CGGTTGGATC ACCTCCTTA- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Haemophilu.influ O-OOOO-OOO OOOO-OOO-O OOOOOOOOOO OOOOOOOOO- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermus.therm G-CTGT-ACC GOOO-OOO-O OOOOOOOOOO OOOOOOOOOO O--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermotoga.marit G-CCGT-ACC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTTC T--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Zea.mays.CP G-CCGT-ACT GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCCTTT- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlamydomo.reinh.CP G-GGCT-ACT GGAA-GGT-G GCCCTGGCTC ACCTCCTTC- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci.CP G-CCGT-ACT GGAA-GGT-G TGGCTGGAAC AACTCCC--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Desulfuroc.mobil G-CCGT-ACC GGAA-GGT-G CGGCTGGATC ACCTCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Sulfolobus.acido G-CCGT-AGG GGAA-CCT-G CGGCTGGATC ACCTCA---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermofilu.pende G-CCGT-AGG GGAA-CCT-G CGGCCGGATC ACCTC----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Thermoprot.tenax G-CCGT-AGG GGAA-CCT-G CGGTTGGATC ACCTCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.halob G-CCGT-AGG GGAA-TCT-G CGGCTGGATC ACCTCCT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halobacter.maris G-CCGT-AGA GGAA-TCT-G TGGCTGGATC ACCTCCT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Halococcus.morrh G-CCGT-AGG GGAA-TCT-G CGGCTGGATC ACCTCCT--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Natronobac.magad G-CCGT-AGG GGAA-TCT-G CGGCTGGATC ACCTCCA--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.janna O-OOOO-OOO GGAA-CCT-G OOOOOOGATC ACCTCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Methanococ.vanni G-CCGT-AGG GGAA-CCT-G CGGCTGGATC ACCTCC---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Xenopus.laevi T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Homo.sapie T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Candida.albic T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Saccharomy.cerev T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Schizosacc.pombe T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CAGAAGGATC ATTA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Oryza.sativ T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Arabidopsi.thali T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Fragaria.anana T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Chlorella.ellip TTCCGT-AGG TGAA-CCT-G CAGAAGGATC AA-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Euglena.graci G-CTGT-AGG TGAA-CCT-G CAGCAGGATC ATTG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Entamoeba.histo T-CCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGAAGGATC ATTA------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Giardia.intes TTCCGT-AGG TGAA-CCT-G CGGATGGATC CCTC------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
Trypanosom.bruce G-CTGT-AGG TGAA-CCT-G CAGCTGGATC ATTT------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----------
6101
Mycobacter.lepra ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Streptomyc.grise ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Bacillus.subti ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Lactobacil.delbr ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Leuconosto.mesen ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Staphyloco.aureu ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Bartonella.bacil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Rhodopseud.palus ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Rickettsia.ricke ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Bordetella.bronc ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Escherichi.coli ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Haemophilu.influ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Thermus.therm ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Thermotoga.marit ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Zea.mays.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Chlamydomo.reinh.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Euglena.graci.CP ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Desulfuroc.mobil ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Sulfolobus.acido ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Thermofilu.pende ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Thermoprot.tenax ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Halobacter.halob ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Halobacter.maris ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Halococcus.morrh ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Natronobac.magad ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Methanococ.janna ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Methanococ.vanni ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Xenopus.laevi ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Homo.sapie ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Candida.albic ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Saccharomy.cerev ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Schizosacc.pombe ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Oryza.sativ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Arabidopsi.thali ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Fragaria.anana ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Chlorella.ellip ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Euglena.graci ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Entamoeba.histo ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Giardia.intes ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --
Trypanosom.bruce ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --