PRÉSENTATION
Nouveau : JOBIM 2006 à Bordeaux
JOBIM est une conférence ouverte à toutes les personnes travaillant aux frontières de la biologie, de l'informatique, des mathématiques et de la physique et s'intéressant à l'analyse, la comparaison et l'exploitation des données génomiques et post-génomiques.
JOBIM se veut un lieu de rencontre annuel pour la communauté des biologistes / informaticiens / mathématiciens, ceci dans un cadre agréable favorisant les échanges. Par ailleurs, la variété des types de présentations favorise les interactions formelles et informelles entre tous les participants (conférenciers invités, communications orales sélectionnées, communications par poster).
JOBIM est aussi une occasion d'avoir un aperçu des formations et des emplois dans le domaine, ainsi que des travaux des jeunes chercheurs, dont le comité de programme encourage les soumissions. Des frais d'inscription très bas et des séjours à tarifs réduits (dans des hôtels situés à proximité du lieu de la conférence) sont ainsi proposés aux étudiants.
JOBIM constitue donc à la fois une réunion francophone multi-disciplinaire de grande ampleur et une occasion unique de décloisonner la bioinformatique, en confrontant des chercheurs (confirmés ou en cours de formation) d'origine très diverse (biologie, informatique, recherche publique et privée).
La sixième édition de ces journées est organisée par le PBIL (Pôle Bioinformatique Lyonnais) et aura lieu du 6 au 8 juillet 2005 à Lyon à l'amphithéâtre Charles Mérieux (campus de Lyon-Gerland). Plusieurs réunions et évènements satellites seront organisés autour de JOBIM (ontologies et intégration sémantique, modélisation des réseaux de régulation).
Les objectifs visés par ce congrès sont ceux qui l’ont caractérisé depuis le début. Ils comprennent :
La volonté de garder un caractère généraliste, à savoir
aborder autant que possible les divers thèmes de la bioinformatique.
Préserver un format favorisant les interactions entre participants.
L'ouverture de la communauté scientifique française vers l'extérieur à
travers l'invitation de chercheurs étrangers.
Favoriser l'intégration des jeunes chercheurs (master, doctorat) et plus
généralement des jeunes en formation au monde de la recherche et au
monde de l'industrie.
Le public visé consiste en l'ensemble des personnes intéressées, activement ou en tant que néophyte, par la recherche en bioinformatique : chercheurs ou enseignants-chercheurs du public, ingénieurs, étudiants de tous niveau, personnel des entreprises privées ayant des activités de recherche ou de service en bioinformatique ou en biotechnologie.
Les thèmes de JOBIM recouvrent tous les domaines de recherche propres à la communauté bioinformatique, incluant, sans y être limité :
- La cartographie et l’annotation des génomes.
- La recherche et la découverte de motifs.
- La modélisation et la prédiction de structure (structures secondaires et tertiaires des ARN, des ADN et des protéines).
- La génomique comparative.
- L'expression des gènes et des réseaux de régulation.
- Les haplotypes et les polymorphismes (SNP).
- Les interactions macromoléculaires (protéine-protéine, ADN-protéine, ARN-protéine, ...)
- La classification fonctionnelle des protéines.
- L'évolution et la phylogénie.
- L'analyse et classification du métabolisme.
- L'algorithmique des mots.
- Les bases de données et de connaissances.
- Les méthodes statistiques et probabilistes.
- La théorie des graphes et l'analyse combinatoire des données.
- L'apprentissage automatique.
- Les systèmes par contraintes.
- La représentation des connaissances et les ontologies.