SignalP V1.1 World Wide Web Server



************************* SignalP predictions *************************
Using networks trained on euk data

>protein      length = 110

# pos  aa    C       S       Y
    1   M   0.012   0.975   0.000
    2   A   0.012   0.975   0.000
    3   L   0.013   0.974   0.006
    4   W   0.012   0.982   0.014
    5   M   0.012   0.982   0.016
    6   R   0.012   0.987   0.018
    7   L   0.013   0.992   0.025
    8   L   0.012   0.991   0.033
    9   P   0.012   0.992   0.040
   10   L   0.013   0.992   0.049
   11   L   0.014   0.989   0.058
   12   A   0.014   0.991   0.063
   13   L   0.028   0.992   0.097
   14   L   0.031   0.987   0.107
   15   A   0.033   0.963   0.118
   16   L   0.066   0.939   0.178
   17   W   0.041   0.962   0.146
   18   G   0.158   0.943   0.301
   19   P   0.116   0.866   0.267
   20   D   0.244   0.750   0.397
   21   P   0.031   0.894   0.144
   22   A   0.103   0.886   0.268
   23   A   0.254   0.622   0.432
   24   A   0.316   0.386   0.483
   25   F   0.871   0.163   0.787
   26   V   0.124   0.156   0.286
   27   N   0.040   0.129   0.157
   28   Q   0.072   0.200   0.200
   29   H   0.028   0.199   0.121
   30   L   0.018   0.240   0.093
   31   C   0.020   0.124   0.092
   32   G   0.078   0.119   0.174
   33   S   0.072   0.099   0.156
   34   H   0.039   0.122   0.108
   35   L   0.014   0.244   0.060
   36   V   0.027   0.198   0.077
   37   E   0.018   0.174   0.058
   38   A   0.013   0.259   0.046
   39   L   0.188   0.158   0.160
   40   Y   0.013   0.196   0.036
   41   L   0.019   0.278   0.040
   42   V   0.041   0.171   0.062
   43   C   0.015   0.218   0.039
   44   G   0.039   0.152   0.068
   45   E   0.221   0.102   0.165
   46   R   0.016   0.130   0.043
   47   G   0.115   0.117   0.119
   48   F   0.090   0.098   0.104
   49   F   0.025   0.065   0.056
   50   Y   0.045   0.044   0.074
   51   T   0.050   0.062   0.077
   52   P   0.019   0.056   0.047
   53   K   0.018   0.042   0.044
   54   T   0.015   0.062   0.038
   55   R   0.019   0.060   0.042
   56   R   0.024   0.038   0.044
   57   E   0.081   0.024   0.078
   58   A   0.016   0.025   0.032
   59   E   0.050   0.034   0.049
   60   D   0.013   0.034   0.022
   61   L   0.017   0.062   0.021
   62   Q   0.014   0.048   0.018
   63   V   0.012   0.031   0.016
   64   G   0.015   0.033   0.015
   65   Q   0.015   0.026   0.011
   66   V   0.013   0.027   0.005
   67   E   0.013   0.040   0.000
   68   L   0.012   0.034   0.000
   69   G   0.015   0.046   0.000
   70   G   0.018   0.036   0.000
   71   G   0.026   0.034   0.000
   72   P   0.016   0.026   0.000
   73   G   0.012   0.042   0.000
   74   A   0.024   0.058   0.000
   75   G   0.015   0.051   0.000
   76   S   0.016   0.048   0.000
   77   L   0.043   0.045   0.000
   78   Q   0.062   0.042   0.000
   79   P   0.014   0.048   0.000
   80   L   0.014   0.026   0.000
   81   A   0.012   0.063   0.000
   82   L   0.015   0.051   0.000
   83   E   0.043   0.046   0.000
   84   G   0.030   0.054   0.000
   85   S   0.027   0.063   0.000
   86   L   0.022   0.106   0.000
   87   Q   0.021   0.147   0.000
   88   K   0.071   0.088   0.000
   89   R   0.017   0.114   0.000
   90   G   0.039   0.126   0.000
   91   I   0.034   0.050   0.004
   92   V   0.022   0.092   0.000
   93   E   0.048   0.066   0.000
   94   Q   0.027   0.044   0.000
   95   C   0.020   0.051   0.000
   96   C   0.013   0.039   0.000
   97   T   0.016   0.038   0.000
   98   S   0.026   0.055   0.000
   99   I   0.021   0.055   0.000
  100   C   0.012   0.068   0.000
  101   S   0.018   0.086   0.000
  102   L   0.036   0.103   0.000
  103   Y   0.039   0.103   0.000
  104   Q   0.031   0.087   0.000
  105   L   0.016   0.079   0.000
  106   E   0.021   0.053   0.000
  107   N   0.015   0.097   0.000
  108   Y   0.022   0.130   0.000
  109   C   0.031   0.103   0.000
  110   N   0.017   0.098   0.000

< Is the sequence a signal peptide?
# Measure  Position  Value  Cutoff  Conclusion 
  max. C    25       0.871   0.37   YES
  max. Y    25       0.787   0.34   YES
  max. S    10       0.992   0.88   YES
  mean S     1-24    0.917   0.48   YES
# Most likely cleavage site between pos. 24 and 25: AAA-FV


Please cite:
Henrik Nielsen, Jacob Engelbrecht, Søren Brunak and Gunnar von Heijne: Identification of prokaryotic and eukaryotic signal peptides and prediction of their cleavage sites. To appear, Protein Engineering, 10, 1-6 (1997).


GOGOTO Email