seq1 = Seq1, 653 bp
seq2 = Seq2 (Seq2), 3864 bp

>Seq1
>Seq2

11-421  (1664-2070)   98% ->
422-640  (3217-3435)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     11 GCGATCTAGAACTAGGGCCATCAAGCAGGTCTGTTCCAAGGGCCTTTGCG
        ||-|||-|||| -|||-|||||||||||||||||||||||||||||||||
   1664 GC ATC AGAAG AGG CCATCAAGCAGGTCTGTTCCAAGGGCCTTTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     61 TCAGGTGGGCTCAGGGTTCCAGGGTGGCTGGACCCCAGGCCCCAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1710 TCAGGTGGGCTCAGGGTTCCAGGGTGGCTGGACCCCAGGCCCCAGCTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    111 CAGCAGGGAGGACGTGGCTGGGCTCGTGAAGCATGTGGGGGTGAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1760 CAGCAGGGAGGACGTGGCTGGGCTCGTGAAGCATGTGGGGGTGAGCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    161 GGGCCCCAAGGCAGGGCACCTGGCCTTCAGCCTGCCTCAGCCCTGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1810 GGGCCCCAAGGCAGGGCACCTGGCCTTCAGCCTGCCTCAGCCCTGCCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    211 CTCCCAGATCACTGTCCTTCTGCCATGGCCCTGTGGATGCGCCTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1860 CTCCCAGATCACTGTCCTTCTGCCATGGCCCTGTGGATGCGCCTCCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    261 CCTGCTGGCGCTGCTGGCCCTCTGGGGACCTGACCCAGCCGCAGCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1910 CCTGCTGGCGCTGCTGGCCCTCTGGGGACCTGACCCAGCCGCAGCCTTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    311 TGAACCAACACCTGTGCGGCTCACACCTGGTGGAAGCTCTCTACCTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1960 TGAACCAACACCTGTGCGGCTCACACCTGGTGGAAGCTCTCTACCTAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    361 TGCGGGGAACGAGGCTTCTTCTACACACCCAAGACCCGCCGGGAGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2010 TGCGGGGAACGAGGCTTCTTCTACACACCCAAGACCCGCCGGGAGGCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    411 GGACCTGCAGG         TGGGGCAGGTGGAGCTGGGCGGGGGCCCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
   2060 GGACCTGCAGGGTG...CAGTGGGGCAGGTGGAGCTGGGCGGGGGCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    452 GTGCAGGCAGCCTGCAGCCCTTGGCCCTGGAGGGGTCCCTGCAGAAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3247 GTGCAGGCAGCCTGCAGCCCTTGGCCCTGGAGGGGTCCCTGCAGAAGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    502 GGCATTGTGGAACAATGCTGTACCAGCATCTGCTCCCTCTACCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3297 GGCATTGTGGAACAATGCTGTACCAGCATCTGCTCCCTCTACCAGCTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    552 GAACTACTGCAACTAGACGCAGCCCGCAGGCAGCCCCACACCCGCCGCCT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
   3347 GAACTACTGCAACTAGACGCAGCCTGCAGGCAGCCCCACACCCGCCGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .
    602 CCTGCACCGAGAGAGATGGAATAAAGCCCTTGAACCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3397 CCTGCACCGAGAGAGATGGAATAAAGCCCTTGAACCAGC

EXONS

> 1664 3435 Seq1
1664 2070
3217 3435