Initiation à la phylogénie moléculaire


Partie 1: Alignement et recherche de similarité


Partie 2: Calcul de phylogénies: parcimonie, distances, max de vraisemblance, bayesien


Partie 3: Utilisation de jModelTest pour choisir le modèle d'évolution des séquences approprié à l'analyse d'un jeu de données nucléique


Partie 4: Tests de comparaison de phylogénies


Partie 5: Estimation du dN/dS et détection de l'adaptation