Correspondance mnémoniques / espèces

 

Bactéries
Mnémonique Espèce Souche Division Subdivision
AMY2_ECOLI Escherichia coli K12 Protéobactérie Gamma
Q8FGL8_ECOL6 Escherichia coli O6 Protéobactérie Gamma
Q7AD04_ECO57 Escherichia coli O157:H7 Protéobactérie Gamma
Q8XBB6_ECO57 Escherichia coli O157:H7 Protéobactérie Gamma
Q7UAB0_SHIFL Shigella flexneri 2457T Protéobactérie Gamma
Q83R40_SHIFL Shigella flexneri 301 Protéobactérie Gamma
Q5PHZ6_SALPA Salmonella paratyphi A Protéobactérie Gamma
AMY2_SALTY Salmonella typhimurium SJW1103 Protéobactérie Gamma
Q8Z5S5_SALTI Salmonella typhi CT18 Protéobactérie Gamma
Q87HG6_VIBPA Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 Protéobactérie Gamma
Q6WUB6_9ENTR Alkaliphilic bacterium N10 Protéobactérie Gamma
Q8U916_AGRT5 Agrobacterium tumefaciens C58 Protéobactérie Alpha
Q7CTL9_AGRT5 Agrobacterium tumefaciens C58 Protéobactérie Alpha
Q8YUZ1_ANASP Anabaena sp. PCC 7120 Cyanobactérie  
Q5M393_STRT2 Streptococcus thermophilus LMG 18311 Gram positive Bas G+C
Q5LYN0_STRT1 Streptococcus thermophilus CNRZ 1066 Gram positive Bas G+C
Q8E696_STRA3 Streptococcus agalactiae NEM316 Gram positive Bas G+C
Q8E0M2_STRA5 Streptococcus agalactiae 2603 V/R Gram positive Bas G+C
Q8DT08_STRMU Streptococcus mutans UA159 Gram positive Bas G+C
O68875_STRMU Streptococcus mutans LT11 Gram positive Bas G+C
Q97Q49_STRPN Streptococcus pneumoniae TIGR4 Gram positive Bas G+C
Q8DPC8_STRR6 Streptococcus pneumoniae R6 Gram positive Bas G+C
Q53786_STRBO Streptococcus bovis JB1 Gram positive Bas G+C
Q93I48_9BACI Bacillus sp. KSM-K38 Gram positive Bas G+C
P71034_9BACI Bacillus sp. MK 716 Gram positive Bas G+C
AMT6_BACS7 Bacillus sp. 707 Gram positive Bas G+C
Q59222_9BACI Bacillus sp. TS-23 Gram positive Bas G+C
O82839_BACSP Bacillus sp. KSM-1378 Gram positive Bas G+C
Q03657_BACCI Bacillus circulans   Gram positive Bas G+C
O31193_BACST Bacillus stearothermophilus ATCC 31195 Gram positive Bas G+C
Q9KWY6_BACST Bacillus stearothermophilus US100 Gram positive Bas G+C
AMY_BACST Bacillus stearothermophilus DY-5 Gram positive Bas G+C
Q65MX0_BACLD Bacillus licheniformis DSM 13 Gram positive Bas G+C
AMY_BACLI Bacillus licheniformis ATCC 27811 Gram positive Bas G+C
Q9AQ54_BACME Bacillus megaterium   Gram positive Bas G+C
Q81AS4_BACCR Bacillus cereus DSM 31 Gram positive Bas G+C
Q81YJ4_BACAN Bacillus anthracis Ames Gram positive Bas G+C
Q6HFU3_BACHK Bacillus thuringiensis 97-27 Gram positive Bas G+C
AMY_BACAM Bacillus amyloliquefaciens IH Gram positive Bas G+C
Q9CG59_LACLA Lactococcus lactis IL1403 Gram positive Bas G+C
Q9RQT8_9SPHI Cytophaga sp.   CFB* Cytophagales
Q89YP1_BACTN Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 CFB* Bactéroides
Q64RC7_BACFR Bacteroides fragilis YCH46 CFB* Bactéroides
* = Cytophagales / Flavobactéries / Bactéroides

 

Archées
Mnémonique Espèce Souche Division Subdivision
Q8NKR5_9EURY Thermococcus sp. GU5L5 Euryarchée Thermococcales
Q8NKR4_9EURY Thermococcus sp. AEPII 1a Euryarchée Thermococcales
Q66SB4_9EURY Thermococcus sp. OGL-20P Euryarchée Thermococcales
O50200_9EURY Thermococcus sp. Rt3 Euryarchée Thermococcales
O93647_THEHY Thermococcus hydrothermalis AL662 Euryarchée Thermococcales
O33476_9EURY Pyrococcus sp. KOD1 Euryarchée Thermococcales
Q9P9L0_PYRWO Pyrococcus woesei   Euryarchée Thermococcales
Q7LYT7_PYRWO Pyrococcus woesei DSM 3773 Euryarchée Thermococcales
Q8U3I9_PYRFU Pyrococcus furiosus JCM 8422 Euryarchée Thermococcales
O08452_PYRFU Pyrococcus furiosus DSM 3638 Euryarchée Thermococcales
Q5JER7_PYRKO Pyrococcus kodakaraensis KOD1 Euryarchée Thermococcales