9h30-10h30 | A few problems of comparative genomics in yeasts | |
Bernard Dujon - Laboratoire de Génétique Moléculaire des Levures, Institut Pasteur | ||
10h30-11h | Pause café | |
11h-12h | Promoter consensus prediction from a whole prokaryote genome | |
Marie-France Sagot - Institut Pasteur (travail réalisé avec Anne Vanet - Institut de Biologie Physico-Chimique, Laurent Marsan - Institut Gaspard Monge, et Agnès Labigne - Institut Pasteur) | ||
12h-14h | Déjeuner | |
14h-15h | Genome functional annotation from the point of view of a biologist/bioinformatician: the questions we wish to ask | |
Bernard Jacq - Laboratoire de Génétique et Physiologie du Développement, Institut de Biologie du Développement de Marseille | ||
15h-15h20 | Pause café | |
15h20-16h20 | EuGene: a tool for gene prediction (Arabidopsis thaliana) which exploits other tools | |
Thomas Schiex - Département de Biométrie et Intelligence Artificielle, INRA Toulouse | ||
16h20-16h40 | Pause café | |
16h40-17h40 | From bags of codons to real genes: translation from B. subtilis point of view | |
Eduardo Rocha - Unité de Régulation de l'Expression Génétique, Institut Pasteur; Atelier de BioInformatique, Université de Paris VI | ||
17h40-18h | Pause café | |
18h-19h | Présentations de problèmes (Propositions de collaboration)(I) | |
18h-18h30 : Problème 1 | ||
18h30-19h : Problème 2 | ||
20h | Dîner (entre 120 et 150 francs) |
9h30-10h30 | Evaluation of gene finding programs using gene contigs and application to the genome of Arabidopsis thaliana | |
Pierre Rouzé - Laboratoire Associé à l'INRA, Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology, Gand | ||
10h30-11h | Pause café | |
11h-12h | An integration infrastructure for genome annotation | |
Christian Overton - Department of Genetics and Department of Computer and Information Science, University of Pennsylvania, États-Unis | ||
12h-14h | Déjeuner | |
14h-15h | Comparison of coding DNA - Combining DNA and protein information | |
Christian N. S. Pedersen - University of Århus, Danemark | ||
15h-15h20 | Pause café | |
15h20-16h20 | Annotation of the Arabidopsis genome: State of art and future ways | |
Sébastien Aubourg - Laboratoire Associé à l'INRA, Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology, Gand | ||
16h20-16h40 | Pause café | |
16h40-17h40 | Comparison of a completely automatic and a clean annotation of the Lactococcus lactis genome: how we did it and the results | |
Alexei Sorokin - INRA, Jouy-en-Josas | ||
17h40-18h | Pause café | |
18h-19h | Présentations de problèmes (Propositions de collaboration)(II) | |
18h-18h30 : Problème 3 | ||
18h30-19h : Problème 4 |
9h30-10h30 | Genomic localization and genetic information | |
Christian Gautier - Laboratoire de Biométrie, Génétique et Biologie des Populations, Université Claude Bernard, Lyon | ||
10h30-11h | Pause café | |
11h-12h | Reconstitution des systèmes complets dans l'annotation : un exemple les transporteurs de type ABC | |
Gwennaele Fichant - Laboratoire Chimie Bactérienne, Institut Fédératif de Recherche du CNRS, Biologie Structurale et Microbiologie, Marseille | ||
12h-14h | Déjeuner | |
14h-15h | Approche statistique de la comparaison de génomes complets | |
Laurent Bize - Département de Biométrie et Intelligence Artificielle, INRA Toulouse | ||
15h-15h20 | Pause café | |
15h20-16h20 | Stratégie d'annotation de génomes non-finis | |
Lionel Frangeul - Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes, Institut Pasteur | ||
16h20-16h40 | Pause café | |
16h40-17h40 | La copie de travail du projet de séquencage du Génome humain | |
William Saurin - Centre National de Séquençage, Évry | ||