Une approche bioinformatique de l'étude des réseaux d'interactions génétiques et moléculaires a l'échelle des génomes
La Bioinformatique
Diapositive PPT
Acquisition assistée et semi-automatisée de données sur les interactions moléculaires chez la drosophile puis la souris à partir de documents textuels sous forme electronique Pourquoi ?
Mise en place d’une méthodologie permettant l’acquisition semi-automatique de données sur les interactions génétiques et moléculaires à partir de documents textuels informatisés
Extraction d’informations par une approche basée sur la statistique textuelle Principe général de l’analyse
Principe de la chaîne de traitements
Base de données de départ : FlyBase
Exemple d’une entrée de gène dans la base FlyBase
LA CHAINE DE TRAITEMENTS EN ACTION
LA CHAINE DE TRAITEMENTS EN ACTION (suite)
LA CHAINE DE TRAITEMENTS EN ACTION (suite et fin)
Fichier des 1199 phrases validées et lemmatisées
Méthodologie de détermination d’un vocabulaire relatif aux interactions et stratégies de prédiction d’interactions
AFC : Analyse Factorielle des Correspondances
Pondération des termes (issus de l’AFC)
Pondération basée sur la fréquence des termes présents dans les 1200 phrases
Représentation graphique d’un réseau d’interactions directes
Conclusions et perspectives
Messagerie: jacq@lgpd.univ-mrs.fr