Bandelt H.-J., Dress A. W. M., Split decomposition: A new and useful approach to phylogenetic analysis of distance data. Mol. Phyl. Evol., 3:242-252, 1992.
Barriel V., Les relations de parenté au sein des Hominoidea et la place de Pan paniscus : comparaison et analyse méthodologique des phylogénies morphologique et moléculaire. Thèse de Doctorat de l'Université de Pierre et Marie Curie, 1994.
Barriel V., Phylogénies moléculaires et insertions-délétions de nucléotides. C. R. Acad. Sci. III., 317: 693-701, 1994.
Barthélémy J.-P., Guénoche A., Trees and Proximity Representations. Wiley, 1991 (aussi publié chez Masson en 1988 sous le titre Les Arbres et les Représentations des Proximités).
Darlu P., Tassy P., La Reconstruction Phylogénétique. Concepts et Méthodes. Masson, 1993.
Dopazo J., Dress A., von Haeseler A., Split decomposition: a new technique to analyse viral evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:10320-10324, 1993.
Dress A., Wetzel R., The human organism - a place to thrive for the immuno-deficiency virus. in: Proceedings of IFCS, Paris, 1993.
Dress A. W. M., Huson D. H., and Moulton V., Analyzing and visualizing sequence and distance data using SplitsTree. Discrete and Applied Mathematics, 71:95-109, 1996. (programme et documentation - ce programme est également disponible en ligne sur le site de l'Institut Pasteur (accès local uniquement))
Ferretti V., Sankoff D., Phylogenetic invariants for more general evolutionary models. J. Theor. Biol., 173:147-162, 1995.
Fu Y. X.,Linear invariants under Jukes' and Cantor's one-parameter model. J. Theor. Biol., 173:339-352, 1995.
Gascuel O., BIONJ: an improved version of the NJ algorithm based on a simple model of sequence data. Mol. Biol. Evol., 14:685-695, 1997. (programme)
Lake, J. A., A rate-independent technique for analysis of nucleic acid sequences: evolutionary parsimony. Mol. Biol. Evol., 4:167-191, 1987.
Pezo V., Wain-Hobson S., HIV genetic variation: life at the edge. J. Infect., 34:201-203, 1997. 391:531-532, 1998.
Tassy P. (ed.), L'Ordre et la Diversité du Vivant, Fondation Diderot, Fayard, 1986.
Wain-Hobson S., Immunodeficiency viruses. 1959 and all that. Nature, 391:531-532, 1998.
Wain-Hobson S., Running the gamut of retroviral variation. Trends in Microbiology, 4:135-141, 1996.
