Logiciels disponibles sur le site de l'Institut
Pasteur concernant la phylogénie
Grâce à Catherine Letondal, un certain nombre de logiciels concernant la phylogénie sont
disponibles sur le site de l'Institut Pasteur. Certains sont
directement accessibles sur le serveur. Parmi tous ceux-là, les logiciels
suivants ont été installés par Catherine, ou une nouvelle version récupérée, en
prévision des séminaires des 8 et 9 Avril 1998 :
- BIONJ
(disponible sur le WEB)
[02 Apr 1998] :
- Version : 3.b.
- Calcul d'arbre par la méthode "neighbor-joining". Cette version effectue un calcul des
distances plus précis. (Gascuel O.)
- SplitsTree
(accès local uniquement) [02 Apr 1998] :
- Version : 1
- Un programme pour analyser et visualiser des données
d'évolution (Dress A. W. M., Huson D. H., Moulton V.).
- PUZZLE
(accès local uniquement)
[02 Apr 1998] :
- Version : 4.0.
- Recherche de topologies par test de maximum de vraisemblance. Cartes de
vraisemblance. (Strimmer K. et Häseler A. v.)
- PAUP
(GCG)
(accès local uniquement)
[02 Apr 1998] :
- PAUP (GCG) est une version sous GCG de cet analyseur phylogénétique
qui utilise une méthode de parcimonie pour la construction d'arbre.
Si vous souhaitez obtenir des renseignements supplémentaires
concernant ces logiciels, ou en connaissez un qui ne se trouve pas
disponible à l'heure actuelle sur le site de l'Institut et que vous pensez
qu'il serait intéressant d'obtenir, vous pouvez adresser vos questions
ou suggestions à :
gensoft@pasteur.fr
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