Bibliographie sommaire

Observation (datant du 15/02/2000) : Cette bibliographie est loin d'être complète. Tous les participants sont cordialement invités à y ajouter d'autres références s'ils le souhaitent (ou des pointeurs sur des programmes ou pages web). Il suffit de me les envoyer à l'adresse : sagot@pasteur.fr. Merci d'avance.

Hlavacek W. S., and Savageau M. A. (1996) Rules for coupled expression of regulator and effector genes in inducible circuits. J. Mol. Biol. 255:121-139.

Mendoza L., Thieffry D. and Alvarez-Buylla E. R. (1999) Genetic control of flower morphogenesis in Arabidopsis thaliana: a logical analysis. Bioinformatics 15:593-606.

Sánchez L., van Helden J. & Thieffry D. (1997) Establishment of the dorso-ventral pattern during the embryonic development of Drosophila melagonaster: a logical analysis. Journal of Theoretical Biology 189:377-389.

Savageau M. A. (1998) Demand theory of gene regulation: Quantitative development of the theory. Genetics 149:1665-1676.

Savageau M. A. (1998) Demand theory of gene regulation: Quantitative application to the lactose and maltose operons of Escherichia coli. Genetics 149:1677-1691.

Thieffry D. and Thomas R. (1995) Dynamical behaviour of biological regulatory networks. II. Immunity control in bacteriophage lambda. Bulletin of Mathematical Biology 57:277-295.

Thieffry D., Huerta A., Peréz-Rueda E. and Collado-Vides, J. (1998) From specific gene regulation to global regulatory networks: a characterisation of Escherichia coli transcriptional network. BioEssays 20:433-440.

Thieffry, D. and Thomas R. (1995) Dynamical behaviour of biological regulatory networks. II. Immunity control in bacteriophage lambda. Bulletin of Mathematical Biology 57:277-295.

van Helden J., André B. and Collado-Vides J. (1998) Extracting regulatory sites from the upstream region of yeast genes by computational analysis of oligonucleotide frequencies. J. Mol. Biol. 281(5):827-42.

van Helden J., André B. and Collado-Vides J. (2000) A web site for the computational analysis of yeast regulatory sequences. Yeast 16(2):177-187.

van Helden J. , del Olmo M. and Pérez-Ortín J. E. (2000) Genomic computational analysis of yeast downstream sequences reveals putative polyadenylation efficiency elements. Nucleic Acids Research 28(4):1000-1010.

van Helden J., Rios A. and Collado-Vides J. (2000). Extracting cis-acting regulatory elements from yeast non-coding sequences by analysis of spaced dyads. accepted in Nucleic Acids Research.



Concernant le travail de Jacques van Helden, vous pouvez également consulter
cette page (EBI) et celle-ci (Université Libre de Bruxelles).

Concernant le travail de l'équipe de Claude Jacq à l'ENS Ulm, Paris, dont fait partie Philippe Marc, vous pouvez également consulter cette page (version française) ou celle-ci (version anglaise).

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