Logiciels disponibles sur le site de l'Institut
Pasteur concernant les
structures d'ARN
Un certain nombre de logiciels concernant les structures d'ARN sont
disponibles sur le site de l'Institut Pasteur. Certains sont
directement accessibles sur le serveur. Parmi tous ceux-là, les logiciels
suivants ont été installés, ou une nouvelle version récupérée, à la suite des séminaires des 18 et 19
Décembre 1997 :
- ESSA
- Logiciel d'édition et d'aide à la prédiction de structure
secondaire d'ARN (Chetouani et al.)
- FAStRNA [22 Dec 1997] :
- Version : 1
- Logiciel de recherche de tRNA potentiels dans
des séquences génomiques (El Mabrouk).
FAStRNA-CM s'appuie sur un modèle probabiliste,
FAStRNA-CLASS sur une approche par recherche de motifs.
- MFOLD [22 Dec 1997] :
- Version : 2.3
- Prédiction de la structure secondaire d'ARN par
minimisation d'énergie (Zuker).
- PALINGOL [22 Dec 1997] :
- Nouvelle version : 1.3
- Logiciel de recherche sur banque avec une description de
structure (Billoud et al.).
- ViennaRNA [22 Dec 1997] :
- Version : 1.2.1
- Suite de logiciels du "Vienna RNA package" (Schuster
et al.).
Prédiction de la structure secondaire, repliement inverse,
calcul de température de fusion et d'énergie.
- RNAlib: librarie de functions pour programeurs.
Si vous souhaitez obtenir des renseignements supplémentaires
concernant ces logiciels, ou en connaissez un qui ne se trouve pas
disponible à l'heure actuelle sur le site de l'Institut et que vous pensez
qu'il serait intéressant d'obtenir, vous pouvez adresser vos questions
ou suggestions à :
gensoft@pasteur.fr
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