Logiciels disponibles sur le site de l'Institut
Pasteur concernant les structures de protéines
Grâce à Louis Jones, un certain nombre de logiciels concernant l'analyse
de structures de protéines et la prédiction
sont
disponibles sur le site de l'Institut Pasteur. Certains sont, grâce à
Catherine Letondal,
directement accessibles sur le serveur. Parmi tous ceux-là, les logiciels
suivants ont été installés, une nouvelle version récupérée ou une page
web créée, en
prévision des séminaires des 14, 15 et 16 Septembre 1998 :
- ASC (accès local uniquement)
[14 Mai 1998] :
- Version : 2.12.
- Le paquet de programmes ASC/GM est conçu afin d'effectuer des
calculs moléculaires/mécaniques ainsi que des calculs de surface (F. Eisenhaber).
- NNSSP
(page web disponible) [23 Juin 1998] :
- Version : nnssp
- Programme de rédiction de structure secondaire de protéine qui
combine alignement multiple de séquence avec un algorithme
du type "plus-proche-voisin"
(A.A. Salamov, V.V. Solovyev).
- Predator
(page web disponible)
[14 Mai 1998] :
- Version : 2.1.2.
- Programme de prédiction de structure secondaire
(D. Frishman, P. Argos).
- ProFit
(accès local uniquement)
[14 Mai 1998] :
- Nouvelle version : 1.8.
- Algorithme de mise en correspondance de structures de protéines par la méthode des moindres carrés (A.C.R. Martin).
- Stride
(page web disponible)
[14 Mai 1998] :
- Version : 1.0.
- Programme de reconnaissance des éléments de structure secondaire
d'une protéine à partir de ses coordonnées atomiques (D. Frishman, P. Argos).
Si vous souhaitez obtenir des renseignements supplémentaires
concernant ces logiciels, ou en connaissez un qui ne se trouve pas
disponible à l'heure actuelle sur le site de l'Institut et que vous pensez
qu'il serait intéressant d'obtenir, vous pouvez adresser vos questions
ou suggestions à :
gensoft@pasteur.fr
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