Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique

Les 10 et 11 janvier 2011 se tiendront à Rennes les journées "Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique"

Ces journées sont organisées conjointement par l’axe "analyse de séquence" du GDR Bio-Informatique Moléculaire (3003) et le groupe de travail COMATEGE du GDR Informatique Mathématique.

Ce workshop francophone est axé sur la combinatoire des mots et l’algorithmique du texte. Les travaux présentés peuvent être fondamentaux, et/ou avec des applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité :
  combinatoire des mots et applications
  algorithmes du texte
  structures d’indexation
  analyse des données de séquençage haut-débit (SHD, NGS)
  recherche, découverte et analyse de motifs

  mots sturmiens et leurs généralisations
  structures abéliennes dans les mots
  statistique des mots
  méthodes de génomique comparative
  outils d’analyse des répétitions génomiques
  cartographie et annotation des génomes
  haplotypes et polymorphismes
  approches ab initio