AFC avant CAH ?? (si oui combien d'axes ?)

From: Joseph Le Cuziat (jlecuziat@yahoo.fr)
Date: Thu Nov 07 2002 - 16:44:20 MET


Bonjour.

J'ai un problème a résoudre pour lequel j'ai reçu deux
avis différents. Pourriez vous m'aider en m'éclairant
de vos lumières.

Je cherche à mettre en évidence des groupes de relevés
de végétation en fonction de leur composition
floristique.
Je dispose pour cela d'un tableau Relevés / Espèces
(relevés en lignes), chaque espèce apparaissant dans
les relevés suivant un indice d'abondance.

La solution proposée, est de réaliser une AFC pour
laquelle on conserve un maximun d'axes factoriels,
puis d'utiliser les coordonnées des relevés sur
l'ensemble de ces axes pour réaliser une CAH (méthode
de Ward).
La critique qui est faite est la suivante : pourquoi
réaliser une AFC si l'on conserve tous les axes ?
pourquoi ne pas tout simplement réaliser une CAH sur
le tableau initial pour lequel on calcule une matrice
de distance ?

Merci d'avance pour vos remarques et vos explications.

Joseph Le Cuziat.

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Joseph LE CUZIAT

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