I cannot understand French. Sorry I used the Queens English and taught
myself German in my teens.
DAVRON
----- Original Message -----
From: "Olivier Beauchard" <olivier_beauchard@hotmail.com>
To: <adelist@biomserv.univ-lyon1.fr>
Sent: Thursday, December 26, 2002 1:41 PM
Subject: Plan d'échantillonnage (2) - ACPVI
> Bonjour,
>
> Suite à ma question précédente sur un plan d'échantillonnage, je
souhaiterai
> obtenir quelques précisions sur l'ACP sous contrainte. Un bref rappel sur
le
> tableau des données :
> 29 colonnes dont :
> 4 facteurs fixés prenant chacun un certain nombre de modalités (de 2 à 6
> suivant les facteurs) et 25 colonnes des abondances de 25 espèces. Chaque
> ligne est une combinaison des 4 facteurs ; chaque ligne est répliquée 3
> fois. Le total des lignes est donc de (3*5*6*2)*3 = 540 lignes.
>
> Le but étant de hiérarchiser et de décrire les effets des facteurs sur la
> faune, une ACPVI pourrait permet de répondre à la question. Il s'agit de
> coupler l'ACM du tableau disjonctif des facteurs (16 colonnes-modalité) à
> l'ACP centrée du tableau des espèces (25 colonnes).
>
> 1) Cependant, j'ai lu dans les archives que cette analyse pouvait manquer
de
> fiabilité suivant le nombre de facteurs (et de réplicats ?). L'ACPVI
> est-elle crédible sur un tel tableau ? En général, comment savoir si une
> ACPVI est réalisable sur un tableau donné ?
>
> 2) Si l'ACPVI est réalisable, l'ensemble des effets devient complexe. Ces
> effets se trouvent-ils à l'intérieur de l'effet conjoint des 4 facteurs (=
> effet de l'ACP inter-classe avec la partition en 3*5*6*2 = 180 classes) ?
si
> c'est le cas, alors je suppose que cette effet est (la somme des 4 effets
> simples) + (la somme des interactions d'ordre 2, 3 et 4 soit 11 en tout).
On
> se retrouve avec 15 effets différents. Le module « Triplet Inertia
> Decomposition » permet de quantifier l'effet des facteurs en comparant la
> variabilité intra à la variabilité inter qu'il engendre. Donc, si je veux
> répondre à ma question, je dois faire 15 ACPVI. Si cela reste crédible,
> peut-on faire l'ACP du tableau suivant pour répondre à la question :
> 25 lignes-espèce,
> 15 colonnes-effet,
> chaque cellule présentant l'effet (=rapport inter/intra).
> Cette cuisine tient-elle vraiment la route ? Je suppose également que
> l'analyse de variance sur mon tableau de départ aboutirait au même
résultat
> mais serait-elle crédible quant aux degrés de liberté ?
>
> 2) Dans le cas où l'ACPVI n'est pas réalisable, on lui préfère l'analyse
de
> co-inertie couplant l'ACM et l'ACP. Comment quantifier les effets des
> facteurs ? Est-ce la somme des contributions des modalités de chaque
facteur
> dans le plan de l'analyse de co-inertie ?
>
> Je vous remercie bien de votre attention.
>
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