RE: dispersion relative de pop.

From: Daniel Chessel (chessel@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Fri Jun 13 2003 - 10:56:18 MEST


At 09:46 13/06/2003 +0200, Sylvain Dolédec wrote:
>Bonjour,
>
>En fait si je crois que l'utilitaire existe sous la version ne nécessitant
>pas d'étudiants de DEA (ceci dit que cela ne soit pas un encouragement à ne
>pas modifier ses habitudes).
>
>- Récupérer le fichier Iris sous R (là il faut quand même savoir se servir
>de R)
>- Après diverses opérations habituelles faire un fichier binaire des données
>et un fichier des espèces en catégorie
>- faire l'ACP non centrée des données
>- Utiliser le module Discrimin option "Initialize:LinkPrep" et obtenir le
>résultat avec l'option "Within Parameters" du même module (très largement
>utilisé dans une célèbre "issue spéciale")
>
>sous ADE-4
>setosa 0.12176 0.14082 0.029556 0.010884
>versicolor 0.2611 0.0965 0.2164 0.038324
>virginica 0.39626 0.10192 0.2985 0.073924
>
>sous R
>> setosa versicolor virginica
>> 0.1242490 0.2664327 0.4043429
>> setosa versicolor virginica
>> 0.14368980 0.09846939 0.10400408
>> setosa versicolor virginica
>> 0.03015918 0.22081633 0.30458776
>> setosa versicolor virginica
>> 0.01110612 0.03910612 0.07543265
>
>Tiens cela ne donne pas tout à fait le même résultat. Ai-je fait une erreur
>de calcul où y-a-t-il des considérations théoriques sous-jacentes ?

La fonction var de R est évidemment la variance en 1/(n-1)
Celle d'ade4 est en 1/n

Si n=50

 0.1242490*49/50
[1] 0.12176
 0.2664327*49/50
[1] 0.2611
...

Daniel Chessel - chessel@biomserv.univ-lyon1.fr



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