Re: probleme avec l'utilisation de la fonction mstree

From: Daniel Chessel (chessel@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Tue May 23 2006 - 16:00:36 MEST

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    Peut être qu'un coup d'oeil à la définition d'un arbre de longueur
    minimale serait utile.
    Les points superposés, comme dit Stéphane, nuisent beaucoup à l'affaire.

    L'exemple en appelle un voisin qui permettra de mieux comprendre :

    library(ade4)
    x <- c(-1.12,-1.03,-0.77,-0.97,-1.24,1.17,0.74,1.08,1.17,1.45)
    y <- c(-0.14 ,0.14,0.17,0.35,0.24,-0.19,0.22,0.18,0.27,0.20)
    data<-data.frame(x,y)
    s.label(data,neig=mstree(dist(data)))

    Il y a deux groupes ET un arbre de longueur minimale.
    C'est la ligne téléphonique qui connecte toutes les maisons de deux
    villages et qui est la plus courte.
    C'est joli, non ?
    D. Chessel

    Nicolas Turenne a écrit :
    > Bonjour à tous,
    >
    > Je suis un nouvel utilisateur d'ADE-4.
    > Je souhaite utiliser la fonction mstree qui calcule une
    > matrice de liens adjacents avec l'algorithme du minimum spanning tree.
    > ...
    >
    >
    > en appliquant la routine je m'attends a trouver deux branches
    > (clusters) et en fait tout est lie'
    > par le biais des individus 7 et 2:

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