Daniel Chessel wrote:
> Samir Messad dit :
>
> >Je veux réaliser une typologie de formations végétales à partir
> >d'observations phytosociologiques codées en abondance-dominance (de 1 =
> >absence à 7 = 100 % de couverture).
> >J'ai un tableau avec 172 espèces en lignes et 162 relevés en colonnes. Je
> >voudrais savoir comment préparer le tableau avec ADE-4 pour réaliser une
> >ACM sur variables à codage flou (fuzzy variables).
>
> La question est mal posée (je pense) et il n'y a aucune raison de faire une ACM floue sur un tableau phyto-sociologique.
> (...)
> On ne sait toujours pas ce qu'il FAUT faire, mais juste ce qu'on PEUT faire.
> C'est tout le charme (discret) de l'écologie des communautés.
>
Ce qu'il FAUT faire dépend essentellement des objectifs et du type de données. Si le but est de réaliser une typologie sur la base de données phytosociologiques (abondances d'espèces), les techniques de groupement (clustering) sont beaucoup plus indiquées que les techniques
d'ordination (ACP, AFC, ACM...)!
Toutefois, il peut être intéressant de partir d'une ordination (AFC ou analyse en coordonnées principales) et de réaliser le groupement agglomératif hiérarchique (ou classification hiérarchique ascendante) sur les coordonnées des relevés sur les axes factoriels.
Je ne sais pas toutefois comment réaliser cela simplement sur ADE-4, étant donné que j'utilise plutôt un programme spécialisé (Mulva-5 de Wildi et Orloci) pour ce type de traitement. J'ai mis au point une procédure standardisée pour la classification automatique des relevés
phytosociologiques que je tiens à la disposition des personnes intéressées.
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* Francois Gillet
* Maître-assistant
* Laboratoire d'écologie végétale
* Institut de Botanique
* Université de Neuchâtel
* Emile-Argand 11
* CH-2007 NEUCHATEL
* Switzerland
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* E-mail: francois.gillet@bota.unine.ch
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* Tel: +41 32 718 23 17
* Fax: +41 32 718 21 01
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