Last updated on 2024-08-31 23:49:32 CEST.
| Package | WARN | NOTE | OK |
|---|---|---|---|
| pcalg | 11 | 2 | |
| unifDAG | 1 | 12 |
Current CRAN status: NOTE: 11, OK: 2
Version: 2.7-11
Check: Rd cross-references
Result: NOTE
Found the following Rd file(s) with Rd \link{} targets missing package
anchors:
LINGAM.Rd: fastICA
amatType.Rd: graph-class
corGraph.Rd: graph-class
dag2essgraph.Rd: graphNEL-class
getGraph.Rd: graph-class, graphAM-class
opt.target.Rd: graphNEL-class
pcAlgo-class.Rd: graph-class
randDAG.Rd: igraph
Please provide package anchors for all Rd \link{} targets not in the
package itself and the base packages.
Flavors: r-devel-linux-x86_64-debian-clang, r-devel-linux-x86_64-debian-gcc, r-devel-windows-x86_64
Version: 2.7-11
Check: installed package size
Result: NOTE
installed size is 5.5Mb
sub-directories of 1Mb or more:
data 2.2Mb
Flavors: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang, r-devel-windows-x86_64, r-release-macos-arm64, r-release-macos-x86_64, r-release-windows-x86_64, r-oldrel-macos-arm64, r-oldrel-macos-x86_64, r-oldrel-windows-x86_64
Version: 2.7-11
Check: Rd cross-references
Result: NOTE
Undeclared packages ‘combinat’, ‘unifDAG’ in Rd xrefs
Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang
Version: 2.7-11
Check: tests
Result: NOTE
Running ‘test_LINGAM.R’ [6s/23s]
Running ‘test_addBgKnowledge.R’
Running ‘test_adjustment.R’ [7s/15s]
Running ‘test_ages.R’ [5s/14s]
Running ‘test_amat2dag.R’
Running ‘test_arges.R’ [3s/11s]
Running ‘test_backdoor.R’ [14s/46s]
Comparing ‘test_backdoor.Rout’ to ‘test_backdoor.Rout.save’ ... OK
Running ‘test_bicscore.R’ [4s/13s]
Running ‘test_causalEffect.R’
Running ‘test_coercion.R’
Running ‘test_compareGraphs.R’ [3s/10s]
Running ‘test_dag2cpdag.R’ [4s/11s]
Running ‘test_dag2essgraph.R’ [4s/13s]
Running ‘test_displayAmat.R’ [4s/13s]
Running ‘test_dsep.R’ [4s/11s]
Running ‘test_dsepAM.R’
Running ‘test_dsepAMTest.R’ [4s/11s]
Running ‘test_fci.R’
Running ‘test_fciPlus.R’ [4s/10s]
Running ‘test_gSquareBin.R’
Running ‘test_gSquareDis.R’ [6s/15s]
Running ‘test_gac.R’ [7s/17s]
Running ‘test_getNextSet.R’
Running ‘test_gies.R’ [7s/15s]
Running ‘test_ida.R’ [16s/39s]
Running ‘test_idaFast.R’ [10s/24s]
Running ‘test_isValidGraph.R’ [7s/16s]
Running ‘test_jointIda.R’
Running ‘test_mat2targets.R’ [4s/11s]
Running ‘test_optAdjSet.R’ [5s/12s]
Running ‘test_opttarget.R’
Running ‘test_pag2anc.R’
Running ‘test_pag2conf.R’
Running ‘test_pag2edge.R’
Running ‘test_pc.R’ [5s/17s]
Running ‘test_pcSelect.R’ [6s/17s]
Running ‘test_pcalg2dagitty.R’
Running ‘test_pcorOrder.R’
Running ‘test_pdag2allDags.R’
Running ‘test_pdag2dag.R’ [3s/11s]
Running ‘test_possDeAn.R’
Running ‘test_randDAG.R’ [8s/25s]
Comparing ‘test_randDAG.Rout’ to ‘test_randDAG.Rout.save’ ...1a2,16
> R version 4.3.1 (2023-06-16) -- "Beagle Scouts"
> Copyright (C) 2023 The R Foundation for Statistical Computing
> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
>
> R ist freie Software und kommt OHNE JEGLICHE GARANTIE.
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> R ist ein Gemeinschaftsprojekt mit vielen Beitragenden.
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56c71
< Number of Edges = 21
---
> Number of Edges = 0
61c76
< Number of Edges = 13
---
> Number of Edges = 12
66c81
< Number of Edges = 16
---
> Number of Edges = 13
71c86
< Number of Edges = 19
---
> Number of Edges = 16
90,93c105,108
< $ barabasi : chr "4"
< $ geometric: chr [1:3] "3" "4" "7"
< $ power : chr [1:4] "2" "7" "8" "9"
< $ interEr : chr [1:2] "3" "7"
---
> $ barabasi : chr [1:10] "1" "2" "3" "4" ...
> $ geometric: chr [1:3] "2" "6" "10"
> $ power : chr [1:4] "2" "4" "5" "10"
> $ interEr : chr [1:2] "5" "6"
108,111c123,126
< $ barabasi : chr [1:3] "1" "6" "7"
< $ geometric: chr [1:3] "5" "6" "9"
< $ power : chr [1:3] "4" "5" "10"
< $ interEr : chr [1:2] "2" "4"
---
> $ barabasi : chr [1:10] "1" "2" "3" "4" ...
> $ geometric: chr [1:4] "1" "3" "5" "10"
> $ power : chr [1:4] "1" "6" "7" "8"
> $ interEr : chr [1:3] "1" "3" "8"
145c160
< Number of Edges = 13
---
> Number of Edges = 0
150c165
< Number of Edges = 6
---
> Number of Edges = 12
155c170
< Number of Edges = 11
---
> Number of Edges = 13
160c175
< Number of Edges = 10
---
> Number of Edges = 11
174a190
> Lade nötiges Paket: Matrix
240,242c256,258
< 1 . . . . | . . . | .
< 2 . . . | | . . | | .
< 3 . | . | . . . | | .
---
> 1 . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . .
244,249c260,265
< 5 . . . . . . . | . .
< 6 . | | . | . . . . |
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< 8 . . . | . . . . . .
< 9 . . . | . . . . . .
< 10 . . | . | . . . . .
---
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . .
255,264c271,280
< 1 . . | . . . . . . .
< 2 . . . . . . | . . .
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . . . . .
< 5 . | . . . . | . . |
< 6 . . . . . . . . . |
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . | | . . . . . .
< 9 | . | . . . . | . .
< 10 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . . . . | . | . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . | . | . . . . . .
> 4 . | . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . | .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . | . . . | . . . .
> 8 . . . . . | | . . .
> 9 . . . | . . | . . .
> 10 . . . . . . . . . .
270c286
< 1 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . | . | . . . | .
272,279c288,295
< 3 | | . . . . | | | .
< 4 | . | . . | | . . .
< 5 . . | . . . . . . .
< 6 . . . . . . | . . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . .
< 10 | . | . . . | . | .
---
> 3 . . . | . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . | . . . . . . | .
> 7 . . . | . . . . | |
> 8 . . . | . . . . | .
> 9 . . | . . . . . . |
> 10 . . . . . . . . . .
285,294c301,310
< 1 . . . . . . . . . |
< 2 | . | . . . . . | |
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . | | | | . .
< 5 . . . . . . | . . .
< 6 . . . . | . | | . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . . . | . . . . .
< 9 | . | . . . . . . |
< 10 . . | . . . . . . .
---
> 1 . . . . | . . . . |
> 2 . . . . . | . . | .
> 3 . | . . . | | . | .
> 4 . . . . | . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . | . . . .
> 8 . . . | | | . . . |
> 9 . . . . . | . . . .
> 10 . . . . | . . . . .
369,372c385,388
< 1 . . . . . | . . . . . .
< 2 | . . . . . . . . . | .
< 3 | . . . . . . . . . . |
< 4 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
375,379c391,395
< 7 | . . . . . . . . . . .
< 8 | . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . | | . . . . . .
< 10 . . . | . . . . | . . .
< 11 . . | . . . . . . . . .
---
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
386,387c402,403
< 1 . . . . . . . . | . . .
< 2 . . . | . . . . . | . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
389c405
< 4 . . . . . . . . . | . .
---
> 4 . . | . . . . . . | . .
391c407
< 6 . . . . . . . . . . . |
---
> 6 . | . . . . . | . | . .
393,394c409,410
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 . | . . | . . . . | . .
> 9 . . | | . . . . . . . .
396,397c412,413
< 11 . . | . . . . . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . | . . . . . | . . .
403,407c419,423
< 1 . . . . . | | . . . . |
< 2 . . . . . . | . . . . .
< 3 | . . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . | . . . . .
< 5 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . . . .
410,414c426,430
< 8 . . . . . . | . | . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | . . . . .
< 11 . . . . . . | . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 | | . | | . . . . . . |
> 9 . . | . . . . . . . . .
> 10 . | . . . . . | . . . .
> 11 . . . . . . . . | . . .
> 12 . | . . . | | . | . . .
420,422c436,438
< 1 . . . . . . . . . . . .
< 2 . . . . | . . . . . . .
< 3 . . . . . . | . . . | .
---
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> 3 . . . . . . . . . . . |
425,431c441,447
< 6 . . . . . . . . . . . .
< 7 . . . . | . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 | . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | | . . . .
< 11 . . . . | . . . . . . .
< 12 | . . . . | . . . . . .
---
> 6 | . . . . . . . . . . |
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 | . . . . . . . . . . |
> 9 . . . | | . . . . . . .
> 10 | . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . . . . . . . . . . .
523,525c539,541
< 1 . . . . | . . . | .
< 2 . . . | | . . | | .
< 3 . | . | . . . | | .
---
> 1 . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . .
527,532c543,548
< 5 . . . . . . . | . .
< 6 . | | . | . . . . |
< 7 . | . | . . . . . .
< 8 . . . | . . . . . .
< 9 . . . | . . . . . .
< 10 . . | . | . . . . .
---
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . .
538,547c554,563
< 1 . . | . . . . . . .
< 2 . . . . . . | . . .
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . . . . .
< 5 . | . . . . | . . |
< 6 . . . . . . . . . |
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . | | . . . . . .
< 9 | . | . . . . | . .
< 10 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . . . . | . | . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . | . | . . . . . .
> 4 . | . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . | .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . | . . . | . . . .
> 8 . . . . . | | . . .
> 9 . . . | . . | . . .
> 10 . . . . . . . . . .
553c569
< 1 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . | . | . . . | .
555,562c571,578
< 3 | | . . . . | | | .
< 4 | . | . . | | . . .
< 5 . . | . . . . . . .
< 6 . . . . . . | . . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . .
< 10 | . | . . . | . | .
---
> 3 . . . | . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . | . . . . . . | .
> 7 . . . | . . . . | |
> 8 . . . | . . . . | .
> 9 . . | . . . . . . |
> 10 . . . . . . . . . .
568,577c584,593
< 1 . . . . . . . . . |
< 2 | . | . . . . . | |
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . | | | | . .
< 5 . . . . . . | . . .
< 6 . . . . | . | | . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . . . | . . . . .
< 9 | . | . . . . . . |
< 10 . . | . . . . . . .
---
> 1 . . . . | . . . . |
> 2 . . . . . | . . | .
> 3 . | . . . | | . | .
> 4 . . . . | . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . | . . . .
> 8 . . . | | | . . . |
> 9 . . . . . | . . . .
> 10 . . . . | . . . . .
652,655c668,671
< 1 . . . . . | . . . . . .
< 2 | . . . . . . . . . | .
< 3 | . . . . . . . . . . |
< 4 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
658,662c674,678
< 7 | . . . . . . . . . . .
< 8 | . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . | | . . . . . .
< 10 . . . | . . . . | . . .
< 11 . . | . . . . . . . . .
---
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
669,670c685,686
< 1 . . . . . . . . | . . .
< 2 . . . | . . . . . | . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
672c688
< 4 . . . . . . . . . | . .
---
> 4 . . | . . . . . . | . .
674c690
< 6 . . . . . . . . . . . |
---
> 6 . | . . . . . | . | . .
676,677c692,693
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 . | . . | . . . . | . .
> 9 . . | | . . . . . . . .
679,680c695,696
< 11 . . | . . . . . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . | . . . . . | . . .
686,690c702,706
< 1 . . . . . | | . . . . |
< 2 . . . . . . | . . . . .
< 3 | . . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . | . . . . .
< 5 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . . . .
693,697c709,713
< 8 . . . . . . | . | . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | . . . . .
< 11 . . . . . . | . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 | | . | | . . . . . . |
> 9 . . | . . . . . . . . .
> 10 . | . . . . . | . . . .
> 11 . . . . . . . . | . . .
> 12 . | . . . | | . | . . .
703,705c719,721
< 1 . . . . . . . . . . . .
< 2 . . . . | . . . . . . .
< 3 . . . . . . | . . . | .
---
> 1 . . . . . . . . . . . |
> 2 | . . . . . . | . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . |
708,714c724,730
< 6 . . . . . . . . . . . .
< 7 . . . . | . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 | . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | | . . . .
< 11 . . . . | . . . . . . .
< 12 | . . . . | . . . . . .
---
> 6 | . . . . . . . . . . |
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 | . . . . . . . . . . |
> 9 . . . | | . . . . . . .
> 10 | . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . . . . . . . . . . .
Running ‘test_randomDAG.R’ [3s/10s]
Running ‘test_rfci.R’ [7s/18s]
Running ‘test_rmvDAG.R’ [3s/10s]
Running ‘test_searchAM.R’
Running ‘test_shd.R’
Running ‘test_skeleton.R’ [7s/19s]
Running ‘test_udag2pag.R’
Running ‘test_udag2pdag.R’ [11s/35s]
Running ‘test_wgtMatrix.R’
Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang
Version: 2.7-11
Check: tests
Result: NOTE
Running ‘test_LINGAM.R’ [6s/16s]
Running ‘test_addBgKnowledge.R’ [4s/11s]
Running ‘test_adjustment.R’ [8s/28s]
Running ‘test_ages.R’ [4s/17s]
Running ‘test_amat2dag.R’ [3s/12s]
Running ‘test_arges.R’
Running ‘test_backdoor.R’ [13s/19s]
Comparing ‘test_backdoor.Rout’ to ‘test_backdoor.Rout.save’ ... OK
Running ‘test_bicscore.R’ [4s/16s]
Running ‘test_causalEffect.R’
Running ‘test_coercion.R’
Running ‘test_compareGraphs.R’ [3s/12s]
Running ‘test_dag2cpdag.R’ [3s/14s]
Running ‘test_dag2essgraph.R’ [4s/13s]
Running ‘test_displayAmat.R’ [4s/13s]
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Comparing ‘test_randDAG.Rout’ to ‘test_randDAG.Rout.save’ ...1a2,16
> R version 4.3.1 (2023-06-16) -- "Beagle Scouts"
> Copyright (C) 2023 The R Foundation for Statistical Computing
> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
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> R ist freie Software und kommt OHNE JEGLICHE GARANTIE.
> Sie sind eingeladen, es unter bestimmten Bedingungen weiter zu verbreiten.
> Tippen Sie 'license()' or 'licence()' für Details dazu.
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> R ist ein Gemeinschaftsprojekt mit vielen Beitragenden.
> Tippen Sie 'contributors()' für mehr Information und 'citation()',
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> Tippen Sie 'demo()' für einige Demos, 'help()' für on-line Hilfe, oder
> 'help.start()' für eine HTML Browserschnittstelle zur Hilfe.
> Tippen Sie 'q()', um R zu verlassen.
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Running ‘test_randomDAG.R’
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Check: tests
Result: NOTE
Running 'test_LINGAM.R' [3s]
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Running 'test_adjustment.R' [3s]
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Comparing 'test_randDAG.Rout' to 'test_randDAG.Rout.save' ...1a2,16
> R version 4.3.1 (2023-06-16) -- "Beagle Scouts"
> Copyright (C) 2023 The R Foundation for Statistical Computing
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> Sie sind eingeladen, es unter bestimmten Bedingungen weiter zu verbreiten.
> Tippen Sie 'license()' or 'licence()' für Details dazu.
>
> R ist ein Gemeinschaftsprojekt mit vielen Beitragenden.
> Tippen Sie 'contributors()' für mehr Information und 'citation()',
> um zu erfahren, wie R oder R packages in Publikationen zitiert werden können.
>
> Tippen Sie 'demo()' für einige Demos, 'help()' für on-line Hilfe, oder
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> Tippen Sie 'q()', um R zu verlassen.
56c71
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< Number of Edges = 16
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> Number of Edges = 13
71c86
< Number of Edges = 19
---
> Number of Edges = 16
90,93c105,108
< $ barabasi : chr "4"
< $ geometric: chr [1:3] "3" "4" "7"
< $ power : chr [1:4] "2" "7" "8" "9"
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---
> $ barabasi : chr [1:10] "1" "2" "3" "4" ...
> $ geometric: chr [1:3] "2" "6" "10"
> $ power : chr [1:4] "2" "4" "5" "10"
> $ interEr : chr [1:2] "5" "6"
108,111c123,126
< $ barabasi : chr [1:3] "1" "6" "7"
< $ geometric: chr [1:3] "5" "6" "9"
< $ power : chr [1:3] "4" "5" "10"
< $ interEr : chr [1:2] "2" "4"
---
> $ barabasi : chr [1:10] "1" "2" "3" "4" ...
> $ geometric: chr [1:4] "1" "3" "5" "10"
> $ power : chr [1:4] "1" "6" "7" "8"
> $ interEr : chr [1:3] "1" "3" "8"
145c160
< Number of Edges = 13
---
> Number of Edges = 0
150c165
< Number of Edges = 6
---
> Number of Edges = 12
155c170
< Number of Edges = 11
---
> Number of Edges = 13
160c175
< Number of Edges = 10
---
> Number of Edges = 11
174a190
> Lade nötiges Paket: Matrix
240,242c256,258
< 1 . . . . | . . . | .
< 2 . . . | | . . | | .
< 3 . | . | . . . | | .
---
> 1 . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . .
244,249c260,265
< 5 . . . . . . . | . .
< 6 . | | . | . . . . |
< 7 . | . | . . . . . .
< 8 . . . | . . . . . .
< 9 . . . | . . . . . .
< 10 . . | . | . . . . .
---
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . .
255,264c271,280
< 1 . . | . . . . . . .
< 2 . . . . . . | . . .
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . . . . .
< 5 . | . . . . | . . |
< 6 . . . . . . . . . |
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . | | . . . . . .
< 9 | . | . . . . | . .
< 10 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . . . . | . | . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . | . | . . . . . .
> 4 . | . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . | .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . | . . . | . . . .
> 8 . . . . . | | . . .
> 9 . . . | . . | . . .
> 10 . . . . . . . . . .
270c286
< 1 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . | . | . . . | .
272,279c288,295
< 3 | | . . . . | | | .
< 4 | . | . . | | . . .
< 5 . . | . . . . . . .
< 6 . . . . . . | . . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . .
< 10 | . | . . . | . | .
---
> 3 . . . | . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . | . . . . . . | .
> 7 . . . | . . . . | |
> 8 . . . | . . . . | .
> 9 . . | . . . . . . |
> 10 . . . . . . . . . .
285,294c301,310
< 1 . . . . . . . . . |
< 2 | . | . . . . . | |
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . | | | | . .
< 5 . . . . . . | . . .
< 6 . . . . | . | | . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . . . | . . . . .
< 9 | . | . . . . . . |
< 10 . . | . . . . . . .
---
> 1 . . . . | . . . . |
> 2 . . . . . | . . | .
> 3 . | . . . | | . | .
> 4 . . . . | . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . | . . . .
> 8 . . . | | | . . . |
> 9 . . . . . | . . . .
> 10 . . . . | . . . . .
369,372c385,388
< 1 . . . . . | . . . . . .
< 2 | . . . . . . . . . | .
< 3 | . . . . . . . . . . |
< 4 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
375,379c391,395
< 7 | . . . . . . . . . . .
< 8 | . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . | | . . . . . .
< 10 . . . | . . . . | . . .
< 11 . . | . . . . . . . . .
---
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
386,387c402,403
< 1 . . . . . . . . | . . .
< 2 . . . | . . . . . | . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
389c405
< 4 . . . . . . . . . | . .
---
> 4 . . | . . . . . . | . .
391c407
< 6 . . . . . . . . . . . |
---
> 6 . | . . . . . | . | . .
393,394c409,410
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 . | . . | . . . . | . .
> 9 . . | | . . . . . . . .
396,397c412,413
< 11 . . | . . . . . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . | . . . . . | . . .
403,407c419,423
< 1 . . . . . | | . . . . |
< 2 . . . . . . | . . . . .
< 3 | . . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . | . . . . .
< 5 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . . . .
410,414c426,430
< 8 . . . . . . | . | . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | . . . . .
< 11 . . . . . . | . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 | | . | | . . . . . . |
> 9 . . | . . . . . . . . .
> 10 . | . . . . . | . . . .
> 11 . . . . . . . . | . . .
> 12 . | . . . | | . | . . .
420,422c436,438
< 1 . . . . . . . . . . . .
< 2 . . . . | . . . . . . .
< 3 . . . . . . | . . . | .
---
> 1 . . . . . . . . . . . |
> 2 | . . . . . . | . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . |
425,431c441,447
< 6 . . . . . . . . . . . .
< 7 . . . . | . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 | . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | | . . . .
< 11 . . . . | . . . . . . .
< 12 | . . . . | . . . . . .
---
> 6 | . . . . . . . . . . |
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 | . . . . . . . . . . |
> 9 . . . | | . . . . . . .
> 10 | . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . . . . . . . . . . .
523,525c539,541
< 1 . . . . | . . . | .
< 2 . . . | | . . | | .
< 3 . | . | . . . | | .
---
> 1 . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . .
527,532c543,548
< 5 . . . . . . . | . .
< 6 . | | . | . . . . |
< 7 . | . | . . . . . .
< 8 . . . | . . . . . .
< 9 . . . | . . . . . .
< 10 . . | . | . . . . .
---
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . .
538,547c554,563
< 1 . . | . . . . . . .
< 2 . . . . . . | . . .
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . . . . .
< 5 . | . . . . | . . |
< 6 . . . . . . . . . |
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . | | . . . . . .
< 9 | . | . . . . | . .
< 10 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . . . . | . | . .
> 2 . . . . . . . . . .
> 3 . | . | . . . . . .
> 4 . | . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . | .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . | . . . | . . . .
> 8 . . . . . | | . . .
> 9 . . . | . . | . . .
> 10 . . . . . . . . . .
553c569
< 1 . . . . . . | . . .
---
> 1 . . | . | . . . | .
555,562c571,578
< 3 | | . . . . | | | .
< 4 | . | . . | | . . .
< 5 . . | . . . . . . .
< 6 . . . . . . | . . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . .
< 10 | . | . . . | . | .
---
> 3 . . . | . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . | . . . . . . | .
> 7 . . . | . . . . | |
> 8 . . . | . . . . | .
> 9 . . | . . . . . . |
> 10 . . . . . . . . . .
568,577c584,593
< 1 . . . . . . . . . |
< 2 | . | . . . . . | |
< 3 . . . . . . . . . .
< 4 . . . . | | | | . .
< 5 . . . . . . | . . .
< 6 . . . . | . | | . .
< 7 . . . . . . . . . .
< 8 | . . . | . . . . .
< 9 | . | . . . . . . |
< 10 . . | . . . . . . .
---
> 1 . . . . | . . . . |
> 2 . . . . . | . . | .
> 3 . | . . . | | . | .
> 4 . . . . | . . . . .
> 5 . . . . . . . . . .
> 6 . . . . . . . . . .
> 7 . . . . . | . . . .
> 8 . . . | | | . . . |
> 9 . . . . . | . . . .
> 10 . . . . | . . . . .
652,655c668,671
< 1 . . . . . | . . . . . .
< 2 | . . . . . . . . . | .
< 3 | . . . . . . . . . . |
< 4 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
658,662c674,678
< 7 | . . . . . . . . . . .
< 8 | . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . | | . . . . . .
< 10 . . . | . . . . | . . .
< 11 . . | . . . . . . . . .
---
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 . . . . . . . . . . . .
> 9 . . . . . . . . . . . .
> 10 . . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
669,670c685,686
< 1 . . . . . . . . | . . .
< 2 . . . | . . . . . | . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
672c688
< 4 . . . . . . . . . | . .
---
> 4 . . | . . . . . . | . .
674c690
< 6 . . . . . . . . . . . |
---
> 6 . | . . . . . | . | . .
676,677c692,693
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 . | . . | . . . . | . .
> 9 . . | | . . . . . . . .
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< 11 . . | . . . . . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . | . . . . . | . . .
686,690c702,706
< 1 . . . . . | | . . . . |
< 2 . . . . . . | . . . . .
< 3 | . . . . . . . . . . .
< 4 . . . . . . | . . . . .
< 5 | . . . . . . . . . . .
---
> 1 . . . . . . . . . . . .
> 2 . . . . . . . . . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . .
> 4 . . . . . . . . . . . .
> 5 . . . . . . . . . . . .
693,697c709,713
< 8 . . . . . . | . | . . .
< 9 . . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | . . . . .
< 11 . . . . . . | . . . . .
< 12 . . . . . . . . . . . .
---
> 8 | | . | | . . . . . . |
> 9 . . | . . . . . . . . .
> 10 . | . . . . . | . . . .
> 11 . . . . . . . . | . . .
> 12 . | . . . | | . | . . .
703,705c719,721
< 1 . . . . . . . . . . . .
< 2 . . . . | . . . . . . .
< 3 . . . . . . | . . . | .
---
> 1 . . . . . . . . . . . |
> 2 | . . . . . . | . . . .
> 3 . . . . . . . . . . . |
708,714c724,730
< 6 . . . . . . . . . . . .
< 7 . . . . | . . . . . . .
< 8 . . . . . . . . . . . .
< 9 | . . . . . . . . . . .
< 10 . . . . . . | | . . . .
< 11 . . . . | . . . . . . .
< 12 | . . . . | . . . . . .
---
> 6 | . . . . . . . . . . |
> 7 . . . . . . . . . . . .
> 8 | . . . . . . . . . . |
> 9 . . . | | . . . . . . .
> 10 | . . . . . . . . . . .
> 11 . . . . . . . . . . . .
> 12 . . . . . . . . . . . .
Running 'test_randomDAG.R' [2s]
Running 'test_rfci.R' [3s]
Running 'test_rmvDAG.R' [2s]
Running 'test_searchAM.R' [2s]
Running 'test_shd.R' [2s]
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Running 'test_udag2pag.R' [2s]
Running 'test_udag2pdag.R' [5s]
Running 'test_wgtMatrix.R' [2s]
Flavor: r-devel-windows-x86_64
Current CRAN status: WARN: 1, OK: 12
Version: 1.0.4
Check: re-building of vignette outputs
Result: WARN
Error(s) in re-building vignettes:
...
--- re-building ‘unifDAG-vignette.Rnw’ using knitr
Error: processing vignette 'unifDAG-vignette.Rnw' failed with diagnostics:
Running 'texi2dvi' on 'unifDAG-vignette.tex' failed.
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! Undefined control sequence.
l.159 \hldef
{myWgtFun} \hlkwb{<-} \hlkwa{function}\hldef{(}\hlkwc{m}\hldef{,...
?
! Emergency stop.
l.159
End of file on the terminal!
! ==> Fatal error occurred, no output PDF file produced!
--- failed re-building ‘unifDAG-vignette.Rnw’
SUMMARY: processing the following file failed:
‘unifDAG-vignette.Rnw’
Error: Vignette re-building failed.
Execution halted
Flavor: r-release-macos-x86_64