Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- p -

• p : bpp::BrentOneDimension
• p_ : bpp::BfgsMultiDimensions , bpp::DirectionFunction , bpp::InvariantMixedDiscreteDistribution
• parameter() : bpp::AbstractParametrizable , bpp::FunctionWrapper
• Parameter() : bpp::Parameter
• parameter() : bpp::ParameterEvent , bpp::ParameterException , bpp::ParameterList , bpp::ParameterNotFoundException , bpp::Parametrizable , bpp::ParametrizableAdapter
• parameter_ : bpp::ParameterEvent , bpp::ParameterException , bpp::ParameterNotFoundException , bpp::ParametrizableAdapter
• ParameterAliasable() : bpp::ParameterAliasable
• ParameterAliasableAdapter() : bpp::ParameterAliasableAdapter
• parameterConstraintChanged() : bpp::AliasParameterListener , bpp::ParameterListener
• ParameterEvent() : bpp::ParameterEvent
• ParameterException() : bpp::ParameterException
• parameterExists() : bpp::ApplicationTools
• ParameterGrid() : bpp::ParameterGrid
• ParameterList() : bpp::ParameterList
• parameterNameChanged() : bpp::AliasParameterListener , bpp::ParameterListener
• parameterNames_ : bpp::MetaOptimizerInfos
• ParameterNotFoundException() : bpp::ParameterNotFoundException
• parameters_ : bpp::AbstractOptimizer , bpp::AbstractParametrizable , bpp::DownhillSimplexMethod::Simplex , bpp::ParameterList , bpp::ParametrizableAdapter
• ParametersStopCondition() : bpp::ParametersStopCondition
• parameterValueChanged() : bpp::AliasParameterListener , bpp::ParameterListener
• Parametrizable() : bpp::Parametrizable
• ParametrizableAdapter() : bpp::ParametrizableAdapter
• ParametrizableCollection() : bpp::ParametrizableCollection< N >
• params_ : bpp::BppApplication , bpp::DirectionFunction
• parseOptions() : bpp::AttributesTools
• parseProcedure() : bpp::KeyvalTools
• partialD2LogLikelihoods_ : bpp::LogsumHmmLikelihood
• partialDLogLikelihoods_ : bpp::LogsumHmmLikelihood
• partialLogLikelihoods_ : bpp::LogsumHmmLikelihood
• paste() : bpp::VectorTools
• pBeta() : bpp::RandomTools
• pChisq() : bpp::RandomTools
• pcom_ : bpp::PowellMultiDimensions
• permuteCopy() : bpp::LUDecomposition< Real >
• pGamma() : bpp::RandomTools
• PgfGraphicDevice() : bpp::PgfGraphicDevice
• PI() : bpp::NumConstants
• pickFromCumSum() : bpp::RandomTools
• pickOne() : bpp::RandomTools
• PICO() : bpp::NumConstants
• Pij() : bpp::AutoCorrelationTransitionMatrix , bpp::FullHmmTransitionMatrix , bpp::HmmTransitionMatrix
• pij_ : bpp::AbstractHmmTransitionMatrix
• pilot_ : bpp::AdaptiveKernelDensityEstimation
• PINF() : bpp::NumConstants
• piv : bpp::LUDecomposition< Real >
• pivsign : bpp::LUDecomposition< Real >
• pl_ : bpp::AliasParameterListener
• PlaceboTransformedParameter() : bpp::PlaceboTransformedParameter
• PMDStopCondition : bpp::PowellMultiDimensions , bpp::PowellMultiDimensions::PMDStopCondition
• pNorm() : bpp::RandomTools
• Point2D() : bpp::Point2D< T >
• pointSize_ : bpp::AbstractGraphicDevice
• positive_ : bpp::RTransformedParameter
• postscriptFontManager_ : bpp::XFigGraphicDevice
• pow() : bpp::MatrixTools , bpp::VectorTools
• PowellMultiDimensions() : bpp::PowellMultiDimensions
• ppalAxes_ : bpp::DualityDiagram
• ppalComponents_ : bpp::DualityDiagram
• pProb() : bpp::BetaDiscreteDistribution , bpp::ConstantDistribution , bpp::DiscreteDistributionInterface , bpp::ExponentialDiscreteDistribution , bpp::GammaDiscreteDistribution , bpp::GaussianDiscreteDistribution , bpp::InvariantMixedDiscreteDistribution , bpp::MixtureOfDiscreteDistributions , bpp::SimpleDiscreteDistribution , bpp::TruncatedExponentialDiscreteDistribution , bpp::UniformDiscreteDistribution
• precision() : bpp::AbstractDiscreteDistribution::Order , bpp::AbstractDiscreteDistribution
• precision_ : bpp::AbstractDiscreteDistribution::Order , bpp::AbstractOutputStream , bpp::IntervalConstraint , bpp::Parameter
• precisionStep_ : bpp::MetaOptimizer
• prefix_ : bpp::AbstractParametrizable
• prepend() : bpp::VectorTools
• PrincipalComponentAnalysis() : bpp::PrincipalComponentAnalysis
• print() : bpp::AbstractDiscreteDistribution , bpp::DiscreteDistributionInterface , bpp::MatrixTools , bpp::VectorTools
• printForR() : bpp::MatrixTools , bpp::VectorTools
• printMessage() : bpp::AbstractOptimizer
• printParameters() : bpp::ParameterList
• printPoint() : bpp::AbstractOptimizer
• printRange() : bpp::VectorTools
• prob() : bpp::Simplex
• probas_ : bpp::MixtureOfDiscreteDistributions
• prod() : bpp::VectorTools
• profile() : bpp::AbstractOptimizer
• profileln() : bpp::AbstractOptimizer
• profiler_ : bpp::AbstractOptimizer
• PROP_CONSTRAINT_EX : bpp::Parameter
• PROP_CONSTRAINT_IN : bpp::Parameter
• propagateDirection_() : bpp::DAGraphImpl< GraphImpl > , bpp::TreeGraphImpl< GraphImpl >
• pSum_ : bpp::DownhillSimplexMethod
• pt_ : bpp::PowellMultiDimensions
• putStreamIntoVectorOfStrings() : bpp::FileTools
• pvalue_ : bpp::ContingencyTableTest , bpp::StatTools::PValue_
• PValue_() : bpp::StatTools::PValue_