R + ADE-4 + execution automatique

From: Jean Thioulouse (Jean.Thioulouse@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Wed Mar 21 2001 - 10:08:04 MET


Bonjour,

J'ai teste le lancement des modules d'ADE-4 avec R sous Windows, et tout
marche bien quand on met les bons parametres. On peut donc parfaitement
piloter les modules d'ADE-4 a partir de R, faire des analyses, recuperer
les sorties, etc. On peut bien sur aussi utiliser l'execution automatique
(mode batch).

Avec cette methode, il devient donc tres simple de faire une version des
modules d'ADE-4 pour Unix (Solaris, MacOS X, Linux, ...), pilotes par R
ou par un generateur d'interface comme tcl/tk, ou bien encore par java.

Lancement simple :
> system("d:\\ade-4\\dir_exe\\PCA")

Lancement avec une option de demarrage :
> system("d:\\ade-4\\dir_exe\\PCA -o 3")

Lancement avec une option et un dossier de travail fixe :
> system("d:\\ade-4\\dir_exe\\PCA -o 3 -d d:\\ADE-4\\dir_Para\\")

Lancement avec un fichier de parametres (execution automatique) :
> system("D:\\ade-4\\dir_exe\\PCA -f D:\\ADE-4\\dir_Try\\Doubs\\PCA-x.txt")

Lancement d'un fichier batch qui chainera des modules :
> system("D:\\ADE-4\\dir_Try\\Doubs\\Monbatch")

Si on rajoute les options minimize et invisible, on voit juste
defiler les fenetres des modules d'ADE-4:
> system("D:\\ADE-4\\dir_Try\\Doubs\\Monbatch", min=T, invis=T)

On peut aussi utiliser l'ordre shell.

Jean

-- 
Jean Thioulouse - Laboratoire de Biometrie et Biologie Evolutive
Universite Lyon 1 - Bat  711 - 69622 Villeurbanne Cedex - France
Fax: (33) 4 78 89 27 19              Tel/Fax: (33) 4 72 43 27 56
          http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/JTHome.html



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