Michel Vennetier <vennetier@servaix1.aix.cemagref.fr>ecrit:
>Je cherche à utiliser la CAH pour faire une typologie de transects
>(transects dans une végétation). J'ai 880 observations avec 8 variables.
>Est-il possible dans ADE d'obtenir simplement la liste des placettes par
>groupes agrégés, à un niveau donné d'aggrégation (par exemple si je choisi
>le niveau de regroupement me donnant 10 groupes au final).
Clusters : Prepare convex hulls. C'est explique dans la doc du module.
>D'autre part, existe-t-il dans ADE une méthode qui permet de faire une CAH
>directement sur des observations avec des variables purement qualitatives.
Dans Clusters, il n'y a que la methode de Ward qui travaille directement
sur le tableau de donnees, en utilisant la metrique canonique. On peut
aussi utiliser toutes les distances du module DMAUtil, et en particuler
Triplet to distance, ce qui permet de faire ensuite une CAH sur la distance
de n'importe quelle analyse de base. On peut aussi faire une analyse de
base (par exemple une ACM si on a des variables qualitatives), et faire
ensuite la CAH sur les coordonnees factorielles, c'est du classique.
Jean
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Jean Thioulouse - Laboratoire de Biometrie et Biologie Evolutive
Universite Lyon 1 - Bat 711 - 69622 Villeurbanne Cedex - France
Fax: (33) 4 78 89 27 19 Tel/Fax: (33) 4 72 43 27 56
http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/JTHome.html
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