>Bonjour,
>
>Je suis une toute nouvelle (ou plutôt future) utilisatrice de votre logiciel.
>
>J'ai tout d'abord une question de base à vous poser: Comment je dois
>organiser mes données dans Excel pour ensuite qu'elles soient
>reconnues par ADE4 ? Je n'ai pas trouvé la réponse dans la doc..
il faut eliminer les eventuels noms des lignes et des colonnes et
enregistrer les données numeriques sous la forme d'un fichier texte
(separateur tabulation).
>Je vous décris en gros le problème. Je voudrais "quantifier" à
>l'aide d'une ACP le rôle joué par les facteurs physico-chimiques
>hydrologiques (environ 7: Température, Salinité, densité, vitesse du
>vent..) dans la structure de mes communautés planctoniques (j'ai 5
>espèces différentes de plancton). Tout cela à partir de 250 stations
>échantillonées le long d'une grille à la surface de l'océan. Soient
>12 colonnes et 250 lignes ...
Pourquoi pas 2 tableaux et un couplage ?
>1er problème: certains paramètres ne sont pas disponibles pour
>toutes les stations, et vu que les données absentes ne sont pas
>les mêmes pour tous les paramètres, je ne peux pas me permettre de
>supprimer purement et simplement les stations "incomplètes", sinon
>il ne me reste plus grand chose. Est-ce que le logiciel gère
>les cellules vides ?
non, pour faire une acp avec données manquantes, il faut utiliser
l'algorithme nipals (a condition que les données manquantes ne soit
pas trop nombreuses). Cet algorithme n'est pas (encore ?) disponible
dans ADE. Par contre, j'ai un petite fonction programmée en R qui
fait du nipals.
>2nd problème: j'ai 2 espèves très localisées et donc qui présentent
>beaucoup de valeurs de concentration nulles. Est-ce que cela risque
>de biaiser l'ACP?
ca depend du sens qu'on veut donner à ces 0.. est-ce qu'une absence a
une signification ou non (cf. message de Gael Grenouillet
25/juillet/2000 et suivants sur adelist).
>Voilà mes questions peuvent paraître naïves mais j'ai vraiment besoin d'aide
>Merci beaucoup
>Céline
-- Stéphane DRAY --------------------------------------------------------------- Biométrie et Biologie évolutive - Equipe "Écologie Statistique" Universite Lyon 1 - Bat 711 - 69622 Villeurbanne CEDEX - FranceTel : 04 72 43 27 56 Fax : 04 78 89 27 19 04 72 43 27 57 E-mail : dray@biomserv.univ-lyon1.fr --------------------------------------------------------------- ADE-4 http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4F.html ---------------------------------------------------------------
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