Re: CCA ou autre analyse ?

From: Stephane Dray (dray@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Fri Aug 16 2002 - 13:24:02 MEST


>Bonjour,
>
>nous avons une Stagiaire de DESS qui travaille sur les cistudes
>d'Europe en Béarn.
>
>Elle a découpé les berges d'un étang étudié en 6 tronçons.
>Pour ces tronçons (les colonnes), elle dispose d'une part d'un
>relevé des cistudes présentes en basking (posées au soleil)(ligne 1)
>et en déplacement (ligne 2).
>D'autre part un deuxième tableau est constitué du relevé de
>paramètres environnementaux (hauteur de vase, ensoleillement, ....)
>en lignes avec toujours les 6 tronçons en colonnes.
>

la coutume et l'usage veut qu'on apparie les tableaux par lignes. La
plupart du temps, on a deux tableaux faunistique et environmentaux
concernant les memes sites (troncons) => troncons en lignes et
variables en colonne.

>Nous souhaitons comparer ces paramètres environnementaux avec la
>présence des cistudes soit en basking soit en déplacement.
>Une CCA est-elle la méthode adaptée ?
>
>Rem :
>Le tableau 1 est issu de données quantitatives.
>Le tableau 2 est issu de données quantitatives (hauteur de vase et
>d'eau..) et de données disjonctées (importance de l'ensoleillement
>pour une journée, qualité des zones de basking...)

si je comprends bien, le tableau faunistique ne concerne qu'une seule
espece ? toutefois, on peut considerer deux especes correspondant aux
2 positions. La cca va simplement calculer les moyennes des variables
environmentales pour chaque position et trouver des combinaisons des
variables separant au mieux ces deux centres de gravités. Le peu
d'individus (6) par rapport au nombre de variables (en plus il y a
des qualitatives avec plusieurs modalités), contraint fortement le
type d'analyse à mettre en oeuvre. La cca n'est pas adapté, la
realisation d'un modele type glm est egalement compromise par les
conditions numériques. A la rigueur une co-inertie mais je reste
sceptique car le nombre d'individus est vraiment tres faible (si
c'est bien 6)...

Cordialement.

>
>************************************************************
>Mathieu Détaint
>Ecologue, coresponsable études & chargé des NTIC
>Association Cistude Nature
>Moulin du Moulinat, Chemin du Moulinat
>F-33185 Le Haillan
>05 56 28 47 72
>************************************************************

-- 
Stéphane DRAY
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Biométrie et Biologie évolutive - Equipe "Écologie Statistique"
Universite Lyon 1 - Bat 711 - 69622 Villeurbanne CEDEX - France

Tel : 04 72 43 27 56 Fax : 04 78 89 27 19 04 72 43 27 57 E-mail : dray@biomserv.univ-lyon1.fr --------------------------------------------------------------- ADE-4 http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4F.html ---------------------------------------------------------------



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