Chers collègues,
Juste un petit mot pour préciser la question intéressante de Martin Béland
sur l'utilisation de la fonction intertype.
Martin Béland utilise, avec raison, la fonction intertype L12(r) pour
caractériser la structure spatiale relative entre deux espèces d'arbres (cf.
doc du module ADS Intertype). Pour cet outil, il existe deux hypothèses
nulles très classiques - random labelling et indépendance des populations -,
qui correspondent à des cadres d'application très différents...
Malheureusement, dans de nombreux articles le choix de la bonne hypothèse
nulle est encore souvent mal expliqué, voire erroné. C'est ce qui nous a
poussé, R. Pélissier et moi, à commettre un article qui résume ces
différences et illustre le risque lié à l'utilisation d'une hypothèse nulle
non pertinente : Goreaud F., Pélissier R. - in press : Avoiding
misinterpretation of biotic interactions with the intertype K12-function:
population independence vs. random labelling hypotheses. Journal of
Vegetation Science.(disponible en préprint sur demande)
Dans le cas de l'étude de la structure spatiale du mélange de deux espèces,
seule l'hypothèse d'indépendance des deux espèces a un sens (cf. Diggle,
1983 ou Lotwick & Silvermann 1982).
Je ne connais pas bien le logiciel utilisé par Martin Béland (Potemkin),
mais d'après ce qu'il nous décrit j'ai l'impression que ce logiciel ne
permet de calculer qu'une des deux hypothèses nulles pour la fonction
intertype : l'hypothèse de random labelling (shuffle species labels), qui
malheureusement convient bien à l'étude de la structure d'une marque
affectant a posteriori le semis de points (maladie, mortalité), mais ne
convient pas du tout à l'étude de la structure relative de deux espèces.
Apparemment les options 1 à 3 concernent le calcul de la structure spatiale
d'un semis univarié, et pas le cas bivarié.
C'est pourquoi pour ma part, j'ai conseillé à Martin Béland soit de
contacter le concepteur de Potemkin, soit d'utiliser le module Intertype
d'ADS, qui permet justement de calculer l'hypothèse d'indépendance des
populations.
Si quelqu'un de la liste connait le logiciel Potemkin, peut être pourra t il
nous éclairer sur la possibilité réelles de ce logiciel de calculer
l'hypothèse d'indépendance ?
Bien amicalement,
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François Goreaud
CEMAGREF, LISC
24 avenue des Landais - BP 50085
63172 AUBIERE CEDEX 1 - France
Tel. : 33 (0)4.73.44.06.80
Fax : 33 (0)4.73.44.06.96
email : francois.goreaud@clermont.cemagref.fr
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> De : Martin Béland[SMTP:mbeland@umce.ca]
> Date : mercredi 19 mars 2003 15:40
> A : adelist@biomserv.univ-lyon1.fr
> Objet : random labeling, binomial or poisson confidence inteval for
> bivariate K
>
> Bonjour cher membre de la ADELIST,
>
> Je suis en voie d'achever les corrections à un article dans lequel
> j'utilise
> des analyses des patrons de points avec les statistiques bivariées de
> Ripley
> pour comparer la distribution de 2 espèces d'arbres dans des parcelles de
> 20
> m par 20 m.
>
> Un des réviseurs, me demande que je vérifie si le logiciel que j'ai
> utilisé
> (Potemkin) pour calculer les statistiques de Ripley utilisait l'hypothèse
> nulle appropriée. J'ai vérifié dans le logiciel et il y a quatre choix
> proposés à l'utilisateur pour définir les intervales de confiance:
>
> 1- don't randomize
> 2- binomial: same number of points, random in space,
> 3- Poisson: similar number of points, random in space
> 4- Conditional: same points, but shuffle species labels (bivariate only).
>
> Le réviseur m'affirme que la solution 4, qui correspond au "random
> labeling"
> n'est pas la bonne. Selon vous, laquelle de la 2 ou la 3 est la bonne?
>
> Merci de votre aide précieuse
>
> ________________________________________________________
> Prof. Martin Béland, Ph. D. env.
> Sylviculture et écologie
> Faculté de Foresterie
> Université de Moncton - Campus d'Edmundston (UMCE)
> Edmundston, Nouveau-Brunswick
> E3V 2S8 Canada
>
> Téléphone - Phone: (506) 737-5249
> Télécopieur - Fax: (506) 737-5373
> Courriél - E-mail: mbeland@umce.ca
> Site internet - WEB site: (http://www.umce.ca/foresterie/)
>
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