Lorraine Bottin a écrit :
>Bonjour,
>
>Je travaille sur une espèce forestières, et j'ai 2 types de jeux de
>données:
>- données discrètes: microsatellites nucléaires
>- données continues: caractères quantitatifs (taille, diamètre,
>proportion de diverses molécules dans le bois de coeur.
>Je cherche à faire une analyse sur l'ensemble de ces caractères
>
>
Ce qui frappe dans cette question c'est l'absence d'objectif.
Vouloir "faire une analyse" ne conduit à aucune réponse possible.
De quoi est-il question ?
Comparer la distribution spatiale de la diversité génétique moléculaire
(marqueurs microsatellites) avec celle de la diversité en huiles
essentielles
(analysée à partir d'échantillons de bois de cœur) ?
Comprendre l'impact de la fragmentation et de l'isolement des habitats
sur cette diversité et sur le régime de reproduction local (comparaison de
systèmes insulaires de taille variable, études de descendances
maternelles et inférences de paternités à l'aide des marqueurs
microsatellites) ?
Comprendre le rôle fonctionnel de la diversité en huiles essentielles
(échantillonnage des parasites associés aux arbres échantillonnées,
recherche de
corrélations avec la composition chimique du bois de cœur, des feuilles
et des graines) ?
Mettre au point des méthodes permettant d'utiliser l'information
apportée par les marqueurs moléculaires pour inférer l'héritabilité de
la production en huiles essentielles. ?
(Mais d'où il sort ça ? Google "Lorraine Bottin", et hop "La lettre
d’information de l’Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier")
>J'ai vu la procédure dudi.mix dans le package Ade4 de R.
>Pourriez-vous me dire en quoi consiste l'article de référence de Hill &
>Smith (1976) (et éventuellement me l'envoyer si vous l'avez)?
>
Désolé, adelist n'est pas un serveur peer to peer de bibliographie (enfin, pas officiellement).
>J'ai vu qu'il existait d'autres méthodes pour mélanger des données de
>type différent (Bar-Hen 1995, Nuñez 2003...), pourriez vous me dire, si
>vous les connaissez, en quoi ces méthodes
>diffèrent et laquelle me conseillez vous pour mon analyse
>
>
Intéressant, vous pouvez me les envoyer.
Pour les conseils, on évite ici d'en donner à tort et à travers sans
savoir quels sont les objectifs.
On réduit la probabilité de dire des bêtises (laquelle n'est jamais
nulle, évidemment)
Peut-être que Samir Messad E-Mail : messad@cirad.fr
<mailto:messad@cirad.fr?Subject=Re:%20%5BR%5D%20xyplot&In-Reply-To=%3C3.0.6.32.20010529163529.00a806c0@mail.cirad.fr%3E>
qui est un spécialiste d'ade4 et de R à Baillarguet pourrait vous aider
à préciser la question ?
Ce n'est pas le même département ?
Les statisticiens ont l'esprit large :-) .
D. Chessel
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