Re: à propos acm en codage flou

From: Daniel Chessel (chessel@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Tue Mar 28 2006 - 17:09:56 MEST

  • Next message: Errol Leal: "x----SPAM----x Thank you for choosing EasySpeedy"

    Une réponse à une question qui peut se poser à d'autres utilisateurs d'ade4.

    Emilie MOESCH a écrit :

    Bonjour,
    je suis actuellement en 1ère année d'écologie fonctionnelle à l'université de Besançon et je réalise un travail d'étude et de recherche (TER) sur la qualité bilogique de 4 ruisseaux affluents du Doubs. J'aurai aimé avec mes résultats faire une afc  et une acm en codage flou, puis une analyse de co-inertie. J'ai trouvé les commandes pour l'afc, pour l'acm mais je ne sais pas comment faire pour rentrer mes données et dans R pour qu'il comprenne que ce sont des traits et des modalités. Tout les exemples qui sont sur le net sont réalisés avec des bases de données déja comprises dans ade4. Donc il n'y pas d'explication sur la manière d'entrée les données.
     
    Ci-joint mon tableau de données
     
    Vous remerciant par avance de l'attention que vous aurez porter à ce message, cordialement
     
    MOESCH Emilie

    Pour retrouver l'information sur un mot clef :
    help.search("fuzzy")

    On a :

    coleo(ade4)                Table of Fuzzy Biological Traits
    dudi.fca(ade4)             Fuzzy Correspondence Analysis and Fuzzy Principal
                               Components Analysis
    fuzzygenet(ade4)           Reading a table of genetic data (diploid individuals)
    scatter.fca(ade4)          Plot of the factorial maps for a fuzzy correspondence
                               analysis

    Lire  la doc de dudi.fca
    On a:
    prep.fuzzy.var (df, col.blocks, row.w = rep(1, nrow(df)))

    L'AFC floue se fait avec dudi.fca.
    Pour préparer le tableau, il faut en faire un data.frame ordinaire puis le lire avac prep.fuzzy.var.
    L'argument col.blocks est un vecteur qui entre le nombre de modalités par blocs.
    Lire les exemples qui sont transparents.
    Les informations sont rangées dans des attributs du nouveau data.frame.

    Ou bien
    Aller à
    http://pbil.univ-lyon1.fr/R/enseignement.html
    Dans la fenêtre Google en bas de la page d'entrée taper fuzzy
    Vous trouverez directement 25 documents qui parlent de votre problème.

    Merci d'utiliser adelist pour vos questions.
    Cordialement
    D. Chessel




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