Re: ACC, ACC partielles et ï¿

From: delettre (yannick.delettre@univ-rennes1.fr)
Date: Fri May 19 2006 - 08:55:56 MEST

  • Next message: Jean-Louis Devineau: "co-inertie, distance entre positions..."

    Sylvain DOLEDEC a écrit :

    > Il y a plusieurs options dans ade4. Je n'y ai pas trouvé Bray-Curtis.
    > Je n'ai aucune spécial affection pour cette mesure de dissimilarité
    > mais elle est dans les articles au moins aussi souvent que la dcca.
    > Son absence est elle lié au fait qu'on la trouve dans d'autre packages
    > ou y-a-t'il une raison plus théorique ou ai-je mal cherché ?

    Bonjour !
    La distance de Bray-Curtis est aussi appelée distance de Sorensen.
    On la trouve dans ADE4 (au moins l'ancienne version) sous DMAUtil /
    Quantitative variables, distance type = 4

    Merci de la précision sur l'identité du résultat obtenu par PCo sur
    distances euclidiennes et ACP normée .
    Bonne journée
    Yann

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    > rapport au point de vue sur les distances, on constate une
    > intéressante évoluion. Cependant, vous me direz si je me trompe mais
    > faire l'acp normée d'un tableau ou faire la pco des distances
    > euclidiennes interrelevés du même tableau normalisé donne en principe
    > la même chose en terme de score des relevés. Il y a aussi sûrement un
    > équivalent distance du chi2 pour l'AFC. Les questions qui se posent
    > alors sont celle du centrage initial du tableau et celle du type de
    > distance à utiliser. Il y a plusieurs options dans ade4. Je n'y ai pas
    > trouvé Bray-Curtis. Je n'ai aucune spécial affection pour cette mesure
    > de dissimilarité mais elle est dans les articles au moins aussi
    > souvent que la dcca. Son absence est elle lié au fait qu'on la trouve
    > dans d'autre packages ou y-a-t'il une raison plus théorique ou ai-je
    > mal cherché ?
    > Bonne journée,
    > Sylvain Dolédec
    >
    >
    >>

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