Bonjour,
Dans la rubrique "on le sait mais on le fait quand meme, pour voir", nous
avons realise une CCA (630 lignes) avec 5 variables explicatives tres
correlees entre elles, bien qu'il soit connu que ces situations conduisent
a des resultats peu fiables. Et effectivement le resultat etait
demonstratif puisque les coefficients des variables explicatives etaient
tres differents les uns des autres, sans qu'il soit possible de leur donner
un sens ecologique particulier. Notre "explication" de ce phenomene est que
ce sont les differences tres petites entre les valeurs des variables qui
ont servi a les distinguer les unes des autres pour leur affecter des
coefficients. L'analyse n'est donc pas fiable si ces petites differences
sont negligeables ou si elles sont plus petites que l'erreur de mesure.
Mais qu'en est-il si ces petites differences sont justement ce qui nous
interesse, c'est a dire si l'on souhaite choisir la "meilleure" variable
predictive parmis un ensemble deja bon? Sans doute d'autres methodes sont
plus adaptees?
Dans la rubrique "une question en cache une autre", pour fonder notre
interpretation, nous avons relu l'article de Ter Braak de 1987 (Vegetatio,
The analysis of vegetation-environment relationships by cca) et on a ete
etonne par les phrases suivantes:
"Loosely speaking, the arrow for an environmental variable points in the
direction of maximum change of that environmental variable across the
diagram, and its lenght is proportional to the rate of change in this
direction. Environmental variables with long arrows are more strongly
correlated with the ordination axes than those with short arrows, and so
more closely related to the pattern of community variation shown in the
ordination diagram."
Il nous semble que la longueur des fleches, c'est a dire le coefficient des
variables environnementales d'apres la premiere phrase, ne correspond pas a
la correlation de ces variables avec les axes. D'ailleurs, dans ADE, il
s'agit de deux graphiques bien distincts. Cette interpretation a ete
reprise dans un cours d'ENSA a partir de l'article cite...
S'agit-il d'une specificite francaise de la CCA d'ADE ou bien, plus
vraisemblablement, d'une aide a l'interpretation abusive?
A propos de "CCA a la francaise" comparee a une "CCA du reste du monde",
abordee dans le message de Daniel Chessel (Re: acc sur variables
qualitatives), nous n'avons pas bien compris s'il s'agit
-de deux conceptions differentes aboutissant a deux techniques de calcul
pour un meme resultat,
-de deux methodes legerement differentes donnant des resultats differents
ou, ce qui me semble,
-de deux conceptions pouvant deboucher sur deux techniques de calculs
donnant des resultats differents mais compatibles que ADE 4 fourni en
sortie du module (*.ivfa, *.ivc1 et *.ivli d'une part et *.ivfa, *.ivco et
*.ivl1 d'autre part).
Merci et bonne rentree a ceux qui rentrent.
Marc Deconchat et Frederic Girard
Marc Deconchat INRA-URSAD/SEBSO BP 27 F-31320 Castanet
Tel:+ 33 (0) 5 61 28 52 55 Fax: +33 (0) 5 61 73 20 77
Email: deconcha@telesad.toulouse.inra.fr
This archive was generated by hypermail 2b30 : Sat Feb 10 2001 - 10:22:00 MET