Fréquences absolues ou relatives des codons.
Par réponses à des menus vous pouvez calculer les fréquences absolues ou relatives et choisir une sortie soit par ordre alphabétique des codons soit par acides aminés.
Les fréquences relatives sont écrites en pour mille. La sortie par ordre alphabétique se présente sous forme de tableaux, les deux premières bases du codon étant indiquées sur la ligne, la 3ème sur la colonne. La sortie "par acide aminé" regroupe les codons correspondants au même acide aminé dont le symbole (sur 3 lettres) est indiqué. Le cumul indique pour les fréquences absolues la somme des valeurs pour chaque séquence, et pour les fréquences relatives leur moyenne. Attention les fréquences marginales sont celles des bases et peuvent donc différer de la somme des nombres du tableau. Vous obtenez aussi le nombre total de codons.