Structure Des Fichiers

Chaque fichier de travail d' ANALSEQ est en fait un ensemble de 2 fichiers à accès direct. Le premier fichier a toujours l'extension. IN. Chacun de ses enregistrements contient 20 caractères et 3 entiers. Le deuxième a l'extension .SE et chaque enregistrement contient 90 caractères. Le premier enregistrement de chacun des fichiers contient entre autres le nombre total d'enregistrements de chaque fichier. Ces fichiers peuvent être obtenus :

• soit par la commande EXT du logiciel ACNUC de la banque sur laquelle s'effectue le travail. Cette méthode extrait intégralement les éléments des séquences, ce qui provoque souvent la création de gros fichiers.

• soit à l'aide des commandes existant dans ANALSEQ ( OUV, INS,.).Cette deuxième méthode permet d'insérer virtuellement des séquences de la banque et ainsi de manipuler des fichiers de moindre importance.

  Le fichier principal de travail a une structure très particulière. En effet ce fichier peut contenir des espaces de travail. Ces fichiers espaces sont en fait un sous-ensemble constitué par des numéros de séquences provenant du fichier de travail principal. Ceci permet de travailler sur un lot de séquences sans être obligé de traiter le fichier en entier.