- a -

• a : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::VarComp
• ALLELE_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• alleleIndex_ : bpp::BiAlleleMonolocusGenotype , bpp::MonoAlleleMonolocusGenotype , bpp::MultiAlleleMonolocusGenotype
• alleles_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record , bpp::LocusInfo
• an_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• AN_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• analyzedLoci_ : bpp::DataSet

- b -

• b : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::VarComp

- c -

• c : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::VarComp
• COMA : bpp::PopgenlibIO
• coord_ : bpp::Individual
• count_ : bpp::PolymorphismSequenceContainer

- d -

• dac_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• DAC_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• data_separator_ : bpp::PopgenlibIO
• date_ : bpp::Individual
• day_ : bpp::Date
• DIPLOID : bpp::LocusInfo , bpp::PopgenlibIO
• dye_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• DYE_H : bpp::GeneMapperCsvExport

- f -

• Fis : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::Fstats
• Fit : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::Fstats
• Fst : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::Fstats

- g -

• genotype_ : bpp::Individual
• group_ : bpp::PolymorphismSequenceContainer
• groups_ : bpp::DataSet , bpp::PolymorphismMultiGContainer
• groupsNames_ : bpp::PolymorphismMultiGContainer

- h -

• HAPLODIPLOID : bpp::LocusInfo , bpp::PopgenlibIO
• HAPLOID : bpp::LocusInfo , bpp::PopgenlibIO
• height_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Allele
• HEIGHT_H : bpp::GeneMapperCsvExport

- i -

• id_ : bpp::BadIdentifierException , bpp::BasicAlleleInfo , bpp::Group , bpp::Individual
• individuals_ : bpp::Group
• ingroup_ : bpp::PolymorphismSequenceContainer

- l -

• localities_ : bpp::DataSet
• locality_ : bpp::Individual
• loci_ : bpp::AnalyzedLoci , bpp::MultilocusGenotype

- m -

• MARKER_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• markerName_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• missing_data_symbol_ : bpp::PopgenlibIO
• missingData_ : bpp::DarwinVarSingle
• month_ : bpp::Date
• multilocusGenotypes_ : bpp::PolymorphismMultiGContainer

- n -

• name_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Allele , bpp::Group , bpp::Locality< T > , bpp::LocusInfo

- p -

• panel_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• PANEL_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• PEAK_AREA_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• peakArea_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Allele
• percentInf : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::PermResults
• percentSup : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::PermResults
• ploidy_ : bpp::LocusInfo

- s -

• SAMPLE_FILE_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• SAMPLE_NAME_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• sampleFile_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• sampleName_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Record
• SEMICOLON : bpp::PopgenlibIO
• sequenceAlphabet_ : bpp::DataSet
• sequences_ : bpp::Individual
• sex_ : bpp::Individual
• size_ : bpp::GeneMapperCsvExport::Allele
• SIZE_H : bpp::GeneMapperCsvExport
• statistic : bpp::MultilocusGenotypeStatistics::PermResults

- t -

• TAB : bpp::PopgenlibIO

- u -

• UNKNOWN : bpp::LocusInfo , bpp::PopgenlibIO

- w -

• WHITESPACE : bpp::PopgenlibIO

- y -

• year_ : bpp::Date