Re: Èliminer un effet...

From: Stephane Dray (dray@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Mon Aug 19 2002 - 14:33:05 MEST


> Bonjour.
>
>Quelques petites questions concernant l'utilisation des analyses
>inter-intras.
>
>Losque l'on prend le fichier servant d'exemple d'ADE (Méaudret), et que
>l'on réalise une ACP intra-saison, on élimine l'effet de ce facteur en
>générant une carte factorielle représentant la distribution des stations
>d'échantillonnage à chaque saison.
>Par la suite, lorsque l'on réalise une inter-saisons, je crois
>comprendre que l'effet station n'est pas éliminé. Quel est donc l'apport
>d'une inter-saison ? aura-t-on le droit de conclure que l'effet saison
>est significatif, même si l'effet station est inclu dans l'analyse ?

le principe des analyse inter-intra est assez simple.
Si on considere un tableau X de variables quantitative, on peut
calculer un tableau X- qui contient les moyennes de chacune des
variables par saison pour chaque station. X- contient des valeurs
identiques pour toutes les stations echantillonnée a une meme saison.
On a donc eliminé les différences intra-saison et on se concentre sur
les différences entre les saisons, c'est l'acp inter.
De la meme maniere, on peut calculer X+ contenant les différences
entre la valeur de chaque station et la moyenne calculée par saison
(i.e. X+=X-(X-)). C'est l'acp intra ou l'on elimine l'effet de chaque
saison pour effacer l'effet de variations temporelles et l'on se
concentre sur les différences intra-saisons.
acp, acp inter et acp intra sont complémentaires car X=(X+)+(X-), on
a donc une décomposition complète de l'inertie

>Ma seconde interrogation est la suivante : comment procéder pour isoler
>les effets dûs à différents facteurs dans le cas où je dispose de 2
>facteurs spatiaux (rivière, station) et 2 facteurs temporels (année,
>saison) ?

Pour étudier les variations spatiales et temporelles, il faudrait
peut etre regarder du coté des méthodes k-tableaux. La thèse de
Laurence Blanc peut vous intéresser. Elles est disponible à
ftp://pbil.univ-lyon1.fr/pub/mac/ADE/ADE4/THESELB.pdf

>En vous remerciant de l'attention que vous avez d'ores et déjà porté à
>ma requête,
>
>Cordiales salutations,
>
>Yorick REYJOL
>Limnologisches Institute,
>KONSTANZ
>DEUTSCHLAND
>
>
>______________________________________________________________________________
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-- 
Stéphane DRAY
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Biométrie et Biologie évolutive - Equipe "Écologie Statistique"
Universite Lyon 1 - Bat 711 - 69622 Villeurbanne CEDEX - France

Tel : 04 72 43 27 56 Fax : 04 78 89 27 19 04 72 43 27 57 E-mail : dray@biomserv.univ-lyon1.fr --------------------------------------------------------------- ADE-4 http://pbil.univ-lyon1.fr/ADE-4/ADE-4F.html ---------------------------------------------------------------



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