La meilleure stratégie pour minimiser le poids des espèces rares dans
l'ordination d'une matrice site x espèce consiste très certainement à
passer de l'analyse des correspondances "classique" (CA, AFC) à
l'analyse non-symétrique des correspondances (ANSC).
Voir Thema28 d'ADE-4, ainsi que les articles suivants :
- Gimaret-Carpentier, C., Chessel, D. & Pascal, J.-P. 1998.
Non-symetric correspondence analysis: an alternative for species
occurrences data. Plant Ecology, 138: 97-112
- Pélissier, R., Couteron, P., Dray, S. & Sabatier, D. 2003. Consitency
between ordination techniques and diversity measurements: two
strategies for species occurrence data. Ecology, 84 (1): 242-251
Cordialement,
Le mardi, 27 jan 2004, à 22:55 US/Pacific, Patrick Bungener a écrit :
> Bonjour,
>
> j'ai une question relative à l'analyse des correspondances (AC) sur
> une matrice
> site x espèce.
> J'aimerais savoir quel est la meilleure façon pour diminuer le poids
> des
> espèces rares dans une AC pour performer au mieux une ac:
> -en attribuant un facteur particulier de pondération sur le poids des
> espèces
> rares, qui jouent un rôle dans le positionnement des sites -ce que
> propose
> bon nombre de logiciel ('downweighting' des rare species p.ex. dans
> canoco)
> -ou directement en transformant AVANT l'analyse l'ensemble de la
> matrice
> par une transformation adéquate (du genre arcsin (racine carrée (X))
> qui
> a tendance à relever les basses fréquences des sp en plus hautes
> fréquences,
> excellent pour les données de type pourcentage.
>
> bref, quelle est la meilleure stratégie à adopter, je suis perdu sur
> cette
> histoire des sp rares dans l'ac, merci d'avance pour vos lumières
> éclairantes,
>
> Patrick Bungener
>
>
***********************************************
Raphaël Pélissier
UMR AMAP
TA40/PS2
34398 Montpellier cedex 5
France
Tel. +33 (0)4 67 61 75 23
Fax. +33 (0)4 67 61 56 68
RP Home Page http://pelissier.free.fr/
************************************************
This archive was generated by hypermail 2b30 : Tue Sep 07 2004 - 13:30:56 MEST