At 11:27 05/07/2004 +0200, Fabien Jouenne wrote:
>bonjour,
>
>je suis étudiant en thèse à l'Université de Caen, sous la direction du Pr. Yvan Lagadeuc, directeur du CAREN (Centre Armoricain de Recherche en Environnement). J'étudie les variations de la production primaire phytoplanctonique en fonction des conditions environnementales en Baie des Veys (14) et l'analyse canonique est un des outils les plus puissants pour appréhender à la fois la composition spécifique et les facteurs physico-chimiques. J'ai décidé d'utiliser ADE4 pour réaliser cette analyse mais je suis malheureusement novice en la matière, aussi bien en ce qui concerne l'analyse canonique que son application sur ADE4. J'ai au préalable étudié les documents fournis par ADE4 au format pdf mais j'ai toujours besoin d'aide pour cette étude. Finalement, je recherche une personne qui aurait l'amabilité de me décrire la démarche à suivre pour réaliser une Analyse canonique sur ADE4 à partir d'une matrice de données sur l'environnement et une matrice de données d'effectifs spécifique
s de microalgues.
>Bien cordialement.
>Fabien.
J'étais tenté de répondre : le plus simple est de lire
http://pbil.univ-lyon1.fr/R/cours/bsb.pdf
(pour ADE-4) ou
http://pbil.univ-lyon1.fr/R/stage/stage5.pdf
http://pbil.univ-lyon1.fr/R/fichestd/tdr64.pdf
http://pbil.univ-lyon1.fr/R/fichestd/tdr65.pdf
(pour ade4)
Mais ce n'est pas le problème. Quand on n'y connaît pas grand-chose et qu'on souhaite de l'aide (si j'ai bien compris) il ne faut pas parler de méthodes a priori.
"l'analyse canonique est un des outils les plus puissants pour appréhender à la fois la composition spécifique et les facteurs physico-chimiques" est une assertion qui a beaucoup de chances d'être fausse et qui interdit de vous aider. Si vous avez décidé ce qui est bon pour traiter vos données, on ne peut plus grand chose. En particulier vous dire comment faire, parce que ce n'est pas sûr que ce soit possible ou souhaitable ou utile (l'analyse canonique est très particulière).
Dites plutôt j'ai tant de stations, tant de dates, tant de relevés, tant d'espèces et tant de variables. Je cherche à traiter les données pour tel objectif. Est-ce que je peux avoir des tuyaux ?
Sur adelist, le miracle est permanent.
Daniel Chessel - chessel@biomserv.univ-lyon1.fr
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