fourth-corner problem

From: Sylvain Doledec (sylvain@biomserv.univ-lyon1.fr)
Date: Wed Nov 12 1997 - 15:36:53 MET


En réponse à Nicolas Sauvion

Nous avons effectivement eu connaissance de cet article qui avait fait
l'objet d'une communication à un congrès d'halieutique en 1995 ou 1996. En
fait nous avions déjà fait une proposition sous le nom d'analyse RLQ qui
correspond à la fiche ADE du fascicule 4: "triplet d'analyse des
correspondances" lors du congrès Intecol de 1994 à Manchester.
L'histoire de l'article qui s'ensuivit mérite d'être comptée pour les
amateurs de pot de beurre.
Nous cherchions à relier des traits biologiques d'espèces à des contraintes
environnementales via un tableau d'abondance et D. Chessel inventa la
méthode RLQ (R pour environnement analysé en mode R, L pour tableau lien et
Q pour tableau analysé en mode Q). Cette méthode fournit de scores des
sites et des traits dans les matrices R et Q respectivement les plus
covariants à travers L. Fort de cette découverte méthodologique et à la
suite de la présentation en congrès, nous décidâmes de proposer un article
à Ecology sur un cas particluier ou le tableau central est traité en AFC et
les tableaux R et Q sont des tableaux d'ACM. L'un des referee nous indiqua
que moyennant certaines modifications l'article était acceptableŠ c'était
Cajo ter Braak. L'autre fut beaucoup plus laconique dans sa revue et connut
une certaine difficulté à la lecture de notre article. L'éditeur nous
invita à resoumettre l'article sous une autre forme plus adaptée à la
politique éditoriale de Ecology.
Finalement, nous changeâmes de revue et nous fîment une proposition à
"Environmental and Ecological statistics" une revue tenue par G.P. Patil
(chairman au congrès de Manchester, vous suivez?). A nouveau, notre
proposition recueillit un certain nombre de critiques et notamment celle
d'un referee, je vous le donne en mille, Cajo ter Braak. Celui-ci nous
invita indirectement à une généralisation du triplet d'analyse des
correspondances. A la suite de multiples navettes avec ter Braak, nous
décidâmes de l'inscrire comme coauteur. Ce qui fait qu'une méthode générale
pour le fourth corner problem est contenue dans la référence suivante :
Dolédec, S., Chessel, D., Ter Braak, C.J.F. & Champely, S. (1996) Matching
species traits to environmental variables: a new three-table ordination
method. Environmental and Ecological Statistics, 3, 143-166.
d'ailleurs aimablement citée par Legendre et al. dans leur article d'Ecology.
Finalement nous sommes bien peu de choses mais nous vivons une époque moderne.

A plus.

_____________________________________________
 Sylvain Dolédec
 Ecologie des Eaux Douces
 et des Grands Fleuves
 Univ. Lyon 1 - Bat 401C
 69622 Villeurbanne CEDEX - France
 phone work: 33 4 72 43 13 63
       Home: 33 4 78 44 94 71
        Fax: 33 4 72 43 11 41
_____________________________________________
 ADE-4 package is available on the WWW
 --> http://biomserv.univ-lyon1.fr/ADE-4.html
_____________________________________________



This archive was generated by hypermail 2b30 : Sat Feb 10 2001 - 10:21:40 MET