Bonjour,
Aller, je me lance a tenter une reponse...
Je ne sais pas a quoi correspond le graphe du bas de la page 27, dans ma
version de la doc thematique ce sont les correlations des variables
initiales avec les axes (avec Rec-arb, haut-arb, haut-bra, rec-he et alti
du meme cote a gauche). Les 2 questions me semble donc identiques.
J'ai mis aussi du temps a comprendre que pour obtenir ces points, il
fallait passer par une etape supplementaire, indiquee dans le texte:
utiliser matalg/diagonal inner product.
En X, j'indique le tableau initial des variables
en option, je les normalise (choix idem a celui de l'acp utilisee dans la
CCA)
en Y: **.ivl1
D inner: option 2
poids: **.fcpl poids de l'AFC
et j'indique un nom de fichier de sauvegarde qui est utilise pour la
representation (avec scatters).
Peut-etre ce fichier pourrait-il faire partie des fichiers de sortie? Un de
plus un de moins...
en esperant ne pas jetre de confusion...
Marc Deconchat INRA-URSAD/SEBSO BP 27 F-31320 Castanet
Tel:+ 33 (0) 5 61 28 52 55 Fax: +33 (0) 5 61 73 20 77
Email: deconcha@telesad.toulouse.inra.fr
> -----Message d'origine-----
> De: Pascal Vittoz [SMTP:Pascal.Vittoz@ibsg.unil.ch]
> Date: jeudi 26 mars 1998 13:31
> A: adelist@biomserv.univ-lyon1.fr
> Objet: Analyses canonique de correspondance
>
> Qui pourrat m'aider ?
>
> Je desire effectuer une analyse canonique de correspondances sur une
> matrice de releves de vegetation couplee avec une matrice de donnees
> ecologiques (altitude, pente, orientation, ...). J'ai suivi la procedure
> expliquee dans Thema 37.card (Analyses canoniques de correspondances) en
> utilisant les paragraphes 1.1, 1.5, 3.1 et 3.2.
>
> Tout a bien fonctionne jusqu'a la page 26 et les resultats obtenus sont
> tout a fait coherents avec ceux obtenus par un collegue avec le logiciel
> CANOCO. Mais il y a deux elements que j'aimerais obtenir pour
> l'interpretation mais je ne comprends pas ou les trouver:
> -les coordonnees des pointes de fleches. Seul **.ivfa donnant le poids de
> ces variables est a disposition, mais je ne trouve comment obtenir le
> graphe situe au bas de la page 27.
> - la matrice de correlations intra-set, ou les correlations des variables
> environnementales avec les axes. Si j'ai bien compris les analyses
> canoniques de correspondances, ces correlations sont importantes pour
juger
> de l'importance respective des differentes variables environnementales
pour
> chaque axe, mais je ne trouve pas comment les obtenir.
>
> D'avance merci beaucoup
>
> Pascal Vittoz
> Universite de Lausanne
> Institut de botanique systematique et de geobotanique
> CH-1015 Lausanne
>
>
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