- a -

• addElement() : bpp::RaaList

- c -

• closeDatabase() : bpp::RAA
• count() : bpp::RaaSpeciesTree
• createEmptyList() : bpp::RAA

- d -

• deleteList() : bpp::RAA

- e -

• elementLength() : bpp::RaaList
• elementName() : bpp::RaaList

- f -

• findNode() : bpp::RaaSpeciesTree
• firstChild() : bpp::RaaSpeciesTree
• firstElement() : bpp::RaaList
• freeSpeciesTree() : bpp::RAA

- g -

• getAccessionNumber() : bpp::RaaSeqAttributes
• getAddr() : bpp::RaaAddress
• getAnnotLineAtAddress() : bpp::RAA
• getAttributes() : bpp::RAA
• getCount() : bpp::RaaList
• getCurrentAnnotAddress() : bpp::RAA
• getDescription() : bpp::RaaSeqAttributes
• getDirectFeature() : bpp::RAA
• getDiv() : bpp::RaaAddress
• getFirstAnnotLine() : bpp::RAA
• getGeneticCode() : bpp::RaaSeqAttributes
• getLength() : bpp::RaaSeqAttributes
• getMajor() : bpp::RaaSpeciesTree
• getName() : bpp::RaaSeqAttributes , bpp::RaaSpeciesTree , bpp::RaaList
• getNextAnnotLine() : bpp::RAA
• getNextFeature() : bpp::RAA
• getRank() : bpp::RaaSeqAttributes , bpp::RaaList
• getReadingFrame() : bpp::RaaSeqAttributes
• getSeq() : bpp::RAA
• getSeqFrag() : bpp::RAA
• getSpeciesName() : bpp::RaaSeqAttributes
• getTid() : bpp::RaaSpeciesTree
• getType() : bpp::RaaList

- i -

• interruptGetAnyFeature() : bpp::RAA
• isChild() : bpp::RaaSpeciesTree
• isInList() : bpp::RaaList

- k -

• keywordPattern() : bpp::RAA
• knownDatabases() : bpp::RAA

- l -

• label() : bpp::RaaSpeciesTree
• listAllFeatureKeys() : bpp::RAA
• listDirectFeatureKeys() : bpp::RAA
• loadSpeciesTree() : bpp::RAA

- m -

• modifyByDate() : bpp::RaaList
• modifyByLength() : bpp::RaaList

- n -

• nextChild() : bpp::RaaSpeciesTree
• nextElement() : bpp::RaaList
• nextMatchingKeyword() : bpp::RAA
• nextSynonym() : bpp::RaaSpeciesTree

- o -

• openDatabase() : bpp::RAA

- p -

• parent() : bpp::RaaSpeciesTree
• parentsOnly() : bpp::RaaList
• prepareGetAnyFeature() : bpp::RAA
• processQuery() : bpp::RAA

- r -

• RAA() : bpp::RAA
• removeElement() : bpp::RaaList
• residueCount() : bpp::RaaList

- s -

• setFrom() : bpp::RaaList

- t -

• translateCDS() : bpp::RAA
• translateInitCodon() : bpp::RAA

- z -

• zeroList() : bpp::RaaList

- ~ -

• ~RAA() : bpp::RAA